MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	GAACA	2	10	2330	2339	60 %	0 %	20 %	20 %	410678639
2	NC_018879	TTATT	2	10	3337	3346	20 %	80 %	0 %	0 %	410678640
3	NC_018879	AAATA	2	10	4453	4462	80 %	20 %	0 %	0 %	410678642
4	NC_018879	AACAA	2	10	5428	5437	80 %	0 %	0 %	20 %	410678643
5	NC_018879	TTTTA	2	10	8275	8284	20 %	80 %	0 %	0 %	410678648
6	NC_018879	TGAAA	2	10	10214	10223	60 %	20 %	20 %	0 %	410678652
7	NC_018879	TATAA	2	10	11339	11348	60 %	40 %	0 %	0 %	410678654
8	NC_018879	AAATT	2	10	11432	11441	60 %	40 %	0 %	0 %	410678654
9	NC_018879	ATTTA	2	10	11523	11532	40 %	60 %	0 %	0 %	410678654
10	NC_018879	TTTAA	2	10	14094	14103	40 %	60 %	0 %	0 %	410678657
11	NC_018879	AGGAA	2	10	14105	14114	60 %	0 %	40 %	0 %	410678657
12	NC_018879	TAGTT	2	10	15755	15764	20 %	60 %	20 %	0 %	410678657
13	NC_018879	ACTGT	2	10	17963	17972	20 %	40 %	20 %	20 %	410678659
14	NC_018879	TTGTA	2	10	18049	18058	20 %	60 %	20 %	0 %	410678659
15	NC_018879	CCTTT	2	10	18498	18507	0 %	60 %	0 %	40 %	410678660
16	NC_018879	CTGTT	2	10	19198	19207	0 %	60 %	20 %	20 %	410678661
17	NC_018879	AAAAG	2	10	20679	20688	80 %	0 %	20 %	0 %	410678663
18	NC_018879	TTCGT	2	10	21604	21613	0 %	60 %	20 %	20 %	410678666
19	NC_018879	TTGTT	2	10	21960	21969	0 %	80 %	20 %	0 %	410678667
20	NC_018879	TCATT	3	15	24299	24313	20 %	60 %	0 %	20 %	410678673
21	NC_018879	CAATT	2	10	25105	25114	40 %	40 %	0 %	20 %	410678676
22	NC_018879	CTTTG	2	10	27511	27520	0 %	60 %	20 %	20 %	410678680
23	NC_018879	TCTTT	2	10	27591	27600	0 %	80 %	0 %	20 %	410678680
24	NC_018879	CCATA	2	10	27774	27783	40 %	20 %	0 %	40 %	410678680
25	NC_018879	TTATT	2	10	29631	29640	20 %	80 %	0 %	0 %	410678684
26	NC_018879	TGTAC	2	10	30790	30799	20 %	40 %	20 %	20 %	410678685
27	NC_018879	TTGTA	2	10	32270	32279	20 %	60 %	20 %	0 %	410678686
28	NC_018879	CACTT	2	10	33327	33336	20 %	40 %	0 %	40 %	410678687
29	NC_018879	CCCTA	2	10	35197	35206	20 %	20 %	0 %	60 %	410678689
30	NC_018879	GATTT	2	10	36066	36075	20 %	60 %	20 %	0 %	410678689
31	NC_018879	TAAGT	2	10	36919	36928	40 %	40 %	20 %	0 %	410678690
32	NC_018879	ATTTT	2	10	41691	41700	20 %	80 %	0 %	0 %	410678694
33	NC_018879	AAAAG	2	10	42330	42339	80 %	0 %	20 %	0 %	410678694
34	NC_018879	CTTTT	2	10	42940	42949	0 %	80 %	0 %	20 %	410678695
35	NC_018879	CTTTT	2	10	43468	43477	0 %	80 %	0 %	20 %	410678695
36	NC_018879	CTTTT	2	10	44419	44428	0 %	80 %	0 %	20 %	410678695
37	NC_018879	TTTTC	2	10	47532	47541	0 %	80 %	0 %	20 %	410678700
38	NC_018879	CTAAT	2	10	49919	49928	40 %	40 %	0 %	20 %	410678701
39	NC_018879	TTAGT	2	10	50039	50048	20 %	60 %	20 %	0 %	410678701
40	NC_018879	AATTA	2	10	55637	55646	60 %	40 %	0 %	0 %	410678706
41	NC_018879	CTAAT	2	10	55657	55666	40 %	40 %	0 %	20 %	410678706
42	NC_018879	TATCA	2	10	55898	55907	40 %	40 %	0 %	20 %	410678706
43	NC_018879	ATCCC	2	10	56113	56122	20 %	20 %	0 %	60 %	410678706
44	NC_018879	AAGAG	2	10	58243	58252	60 %	0 %	40 %	0 %	410678708
45	NC_018879	AAATG	2	10	59383	59392	60 %	20 %	20 %	0 %	410678708
46	NC_018879	TCTTT	2	10	61169	61178	0 %	80 %	0 %	20 %	410678711
47	NC_018879	ATTTC	2	10	62373	62382	20 %	60 %	0 %	20 %	410678712
48	NC_018879	CATCC	2	10	62764	62773	20 %	20 %	0 %	60 %	410678713
49	NC_018879	ATAAA	2	10	67239	67248	80 %	20 %	0 %	0 %	410678719
50	NC_018879	TAAAG	2	10	67452	67461	60 %	20 %	20 %	0 %	410678719
51	NC_018879	GGGCT	2	10	68974	68983	0 %	20 %	60 %	20 %	410678720
52	NC_018879	TGACT	2	10	70765	70774	20 %	40 %	20 %	20 %	410678723
53	NC_018879	TTACA	2	10	71362	71371	40 %	40 %	0 %	20 %	410678724
54	NC_018879	TTCAA	2	10	72200	72209	40 %	40 %	0 %	20 %	410678726
55	NC_018879	TACAG	2	10	74589	74598	40 %	20 %	20 %	20 %	410678727
56	NC_018879	AAGCA	2	10	75379	75388	60 %	0 %	20 %	20 %	410678728
57	NC_018879	GTATA	2	10	75407	75416	40 %	40 %	20 %	0 %	410678728
58	NC_018879	TGAAT	2	10	76127	76136	40 %	40 %	20 %	0 %	410678728

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.