MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	TAAA	2	8	198	205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018879	AATA	2	8	207	214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018879	GGGA	2	8	642	649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018879	GCCT	2	8	715	722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018879	ATTT	2	8	1121	1128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018879	TAAT	2	8	1152	1159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018879	AAAT	2	8	1385	1392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018879	ATTT	2	8	1400	1407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018879	AATA	2	8	1602	1609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018879	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018879	TTCT	2	8	4533	4540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018879	TAAA	2	8	6823	6830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018879	GGTG	2	8	6948	6955	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018879	ATAA	2	8	7323	7330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018879	CAAC	2	8	7690	7697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018879	TGTT	2	8	9311	9318	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018879	ATAA	2	8	10088	10095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018879	TTTA	2	8	10171	10178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018879	GTTT	2	8	10430	10437	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018879	TAAG	2	8	12371	12378	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018879	ATTA	3	12	16596	16607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018879	ATTT	2	8	16805	16812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018879	TTAT	2	8	24851	24858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018879	TTAT	2	8	24885	24892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018879	ATAA	2	8	24923	24930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018879	AATA	2	8	25000	25007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018879	AAAG	2	8	28313	28320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018879	ATTT	2	8	36752	36759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018879	ATTT	2	8	38252	38259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018879	ATTA	2	8	38897	38904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018879	CAGT	2	8	50137	50144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018879	AAGC	2	8	50272	50279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018879	ACTT	2	8	50451	50458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018879	ATCC	2	8	54785	54792	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018879	AAAT	2	8	54935	54942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018879	AAAC	2	8	55053	55060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018879	GTTT	2	8	55075	55082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018879	TAAG	2	8	55325	55332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018879	TTAT	2	8	56129	56136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018879	TTTA	2	8	56298	56305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018879	TAAA	2	8	56589	56596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018879	GAAG	2	8	60342	60349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018879	AATT	2	8	60400	60407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018879	TTTC	2	8	60419	60426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018879	AAGA	2	8	60719	60726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018879	TCAA	2	8	61047	61054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018879	AATT	2	8	61613	61620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018879	TTTA	2	8	61863	61870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018879	TAAT	2	8	63854	63861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018879	CTTA	2	8	64906	64913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018879	AAAT	2	8	64932	64939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018879	AAAC	2	8	66475	66482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018879	ATTT	2	8	66573	66580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018879	TATT	2	8	68423	68430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018879	AAAT	2	8	68464	68471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018879	TAAA	2	8	68606	68613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018879	ATTT	2	8	69701	69708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018879	ATCC	2	8	70388	70395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018879	ATCA	2	8	70474	70481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018879	TTAT	3	12	71511	71522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018879	TATT	2	8	71566	71573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018879	TTCT	2	8	72153	72160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018879	AGCT	2	8	72165	72172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018879	ATAA	2	8	73949	73956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.