MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018878	TTCTAT	2	12	2573	2584	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410677906
2	NC_018878	GAAAAC	2	12	4488	4499	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018878	CAAGGT	2	12	5354	5365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410677907
4	NC_018878	AATGGA	2	12	6083	6094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410677907
5	NC_018878	TAGATA	2	12	8331	8342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410677908
6	NC_018878	TTTAGT	2	12	8401	8412	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410677908
7	NC_018878	GATTGG	2	12	11169	11180	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410677911
8	NC_018878	AAATTG	2	12	11714	11725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410677911
9	NC_018878	TGCAGA	2	12	13770	13781	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410677913
10	NC_018878	GTGTAT	2	12	16678	16689	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410677916
11	NC_018878	ATCTAA	2	12	17788	17799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410677917
12	NC_018878	TGAAGC	2	12	19222	19233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410677919
13	NC_018878	GATTTA	2	12	19442	19453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410677920
14	NC_018878	TCAAAA	2	12	20261	20272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018878	TTTATA	2	12	25864	25875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018878	TAAAAA	2	12	29680	29691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410677938
17	NC_018878	AGAAAA	2	12	31059	31070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018878	TATCTA	2	12	31663	31674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410677942
19	NC_018878	ATTTTG	2	12	33131	33142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410677943
20	NC_018878	CAAAAG	2	12	35339	35350	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410677946
21	NC_018878	AATATA	2	12	35387	35398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018878	ATTTTT	2	12	35900	35911	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018878	GCAGAT	2	12	38444	38455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410677951
24	NC_018878	AAGAGA	2	12	39629	39640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410677953
25	NC_018878	TAAAAG	2	12	40085	40096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410677954
26	NC_018878	ATGGAA	2	12	46011	46022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410677965
27	NC_018878	CAATGG	2	12	49144	49155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410677969
28	NC_018878	TTGTTT	2	12	54962	54973	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410677978
29	NC_018878	ATCAAA	2	12	55445	55456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410677978
30	NC_018878	ATATTA	2	12	57800	57811	50 %	50 %	0 %	0 %	410677984
31	NC_018878	GGAGTG	2	12	59763	59774	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410677987
32	NC_018878	CAAAAG	2	12	60204	60215	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	410677989
33	NC_018878	TGCAAT	2	12	60994	61005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410677990
34	NC_018878	GAAAAG	2	12	62583	62594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410677993
35	NC_018878	TTCTTT	2	12	64724	64735	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410677997
36	NC_018878	AAAGAG	2	12	65851	65862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410677999
37	NC_018878	ATGAGA	2	12	67811	67822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678005
38	NC_018878	GGTAAA	2	12	71758	71769	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678013
39	NC_018878	CAGTGT	2	12	72744	72755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410678014
40	NC_018878	GAAGCA	2	12	73221	73232	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410678015
41	NC_018878	AAATAA	3	18	75536	75553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018878	TCTATC	2	12	77999	78010	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410678024
43	NC_018878	AGTTGA	2	12	80195	80206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678029
44	NC_018878	CCATTT	2	12	84399	84410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410678041
45	NC_018878	AAATTT	2	12	86258	86269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018878	TTAAAA	2	12	86403	86414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678045
47	NC_018878	TTTGAT	2	12	88593	88604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410678047
48	NC_018878	AATTCT	2	12	95576	95587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678053
49	NC_018878	TATTAA	2	12	100538	100549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018878	AAATAT	2	12	106289	106300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018878	AATAGA	2	12	110457	110468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678067
52	NC_018878	GTTCAA	2	12	110495	110506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678067
53	NC_018878	TCACTA	2	12	112850	112861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678067
54	NC_018878	AAACAA	2	12	114644	114655	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410678068
55	NC_018878	TGCAGG	2	12	117996	118007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410678069
56	NC_018878	GTAAAA	2	12	118144	118155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678069
57	NC_018878	AAAGTA	2	12	119221	119232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678069
58	NC_018878	ATATGC	2	12	122339	122350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678070
59	NC_018878	TAAAGG	2	12	127457	127468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678072
60	NC_018878	AATTAA	2	12	128339	128350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678072
61	NC_018878	GAATCA	2	12	128955	128966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410678072
62	NC_018878	ATGGAA	2	12	132604	132615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678077
63	NC_018878	ATATGT	2	12	134593	134604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410678078
64	NC_018878	CAAAAA	2	12	136570	136581	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410678080
65	NC_018878	AAAAAC	2	12	138787	138798	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018878	AAACTA	2	12	147666	147677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678101
67	NC_018878	ATAAAA	2	12	148361	148372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018878	ATGCAA	2	12	150433	150444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410678108
69	NC_018878	AGAGAA	2	12	150496	150507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678108
70	NC_018878	TGGAAA	2	12	157143	157154	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678131
71	NC_018878	TAAGGT	2	12	157205	157216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678131
72	NC_018878	TGATTT	2	12	159196	159207	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410678136
73	NC_018878	AATGAA	2	12	159539	159550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678138
74	NC_018878	AAATGA	2	12	160316	160327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678140
75	NC_018878	ATATGA	2	12	163699	163710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678150
76	NC_018878	ATAGAT	2	12	165411	165422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678154
77	NC_018878	GGAAAA	2	12	166774	166785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678160
78	NC_018878	GTCCAG	2	12	170886	170897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410678167
79	NC_018878	AGTAAA	2	12	171133	171144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678167
80	NC_018878	AAAAGA	2	12	174087	174098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410678171
81	NC_018878	TTATGA	2	12	176246	176257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410678174
82	NC_018878	ATGAAA	2	12	178265	178276	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410678176
83	NC_018878	AGAAGG	2	12	178854	178865	50 %	0 %	50 %	0 %	410678177
84	NC_018878	AATTGA	2	12	181695	181706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678180
85	NC_018878	AGAAAA	2	12	184231	184242	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410678185
86	NC_018878	ATTACA	2	12	185634	185645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018878	TTTTAG	2	12	186680	186691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	410678190
88	NC_018878	TGTAGC	2	12	188570	188581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018878	TAAGAT	2	12	192017	192028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018878	TACTAT	2	12	192485	192496	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678197
91	NC_018878	ATGACT	2	12	201099	201110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678211
92	NC_018878	ATAAAA	2	12	201819	201830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018878	TTATGG	2	12	202702	202713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410678215
94	NC_018878	ATAGAT	2	12	205757	205768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410678221
95	NC_018878	TAGATT	2	12	206935	206946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410678222
96	NC_018878	GAGATA	2	12	206953	206964	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410678222
97	NC_018878	TACCAT	2	12	211747	211758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678229
98	NC_018878	TACAAA	2	12	212140	212151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	410678229
99	NC_018878	ATTCAA	2	12	213505	213516	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678231
100	NC_018878	AGATTC	2	12	213974	213985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678231
101	NC_018878	TTTTAT	2	12	214423	214434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018878	TTTAGG	2	12	215881	215892	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410678233
103	NC_018878	AAGAAA	2	12	217509	217520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	410678234
104	NC_018878	AAATAA	2	12	220253	220264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018878	CAAAAA	2	12	221081	221092	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	410678240
106	NC_018878	GAAAGC	2	12	224693	224704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410678248
107	NC_018878	AAATAT	2	12	228004	228015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018878	GTGAAG	2	12	229188	229199	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410678256
109	NC_018878	GCTTCT	2	12	230311	230322	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410678257
110	NC_018878	TCAATA	2	12	230881	230892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678257
111	NC_018878	TTCATA	2	12	234680	234691	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678261
112	NC_018878	ACTGTA	2	12	237748	237759	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410678266
113	NC_018878	CATTTT	2	12	240285	240296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410678269
114	NC_018878	TTAATA	2	12	243211	243222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018878	GTCCAA	2	12	244326	244337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410678276
116	NC_018878	TAAAAA	2	12	246733	246744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018878	GCTAAT	2	12	246833	246844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018878	CAATTT	2	12	248736	248747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678283
119	NC_018878	AAATTT	2	12	248911	248922	50 %	50 %	0 %	0 %	410678284
120	NC_018878	TCAACA	2	12	249220	249231	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410678284
121	NC_018878	CTTTTT	2	12	254280	254291	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	410678292
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125	NC_018878	CTCTTT	2	12	258601	258612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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238	NC_018878	TATAAA	2	12	495328	495339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678628
239	NC_018878	TATATT	2	12	496577	496588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678630
240	NC_018878	ATTTTT	2	12	496763	496774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_018878	ATAAAA	2	12	497824	497835	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410678632
242	NC_018878	GTAAAA	2	12	501863	501874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.