MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p

Total Repeats: 570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018878	ATTCA	2	10	269	278	40 %	40 %	0 %	20 %	410677903
2	NC_018878	GAAAT	2	10	915	924	60 %	20 %	20 %	0 %	410677903
3	NC_018878	GTTAA	2	10	2134	2143	40 %	40 %	20 %	0 %	410677905
4	NC_018878	ATTTC	2	10	2211	2220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018878	CTTTC	2	10	2223	2232	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018878	TAAGA	2	10	4563	4572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018878	AAGAA	2	10	8916	8925	80 %	0 %	20 %	0 %	410677908
8	NC_018878	AAATT	2	10	9120	9129	60 %	40 %	0 %	0 %	410677908
9	NC_018878	TGTTT	2	10	10147	10156	0 %	80 %	20 %	0 %	410677909
10	NC_018878	ATACA	2	10	12282	12291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018878	TTACA	2	10	12431	12440	40 %	40 %	0 %	20 %	410677912
12	NC_018878	CTTTT	2	10	12863	12872	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018878	GATAT	2	10	14000	14009	40 %	40 %	20 %	0 %	410677913
14	NC_018878	ATTTT	2	10	14649	14658	20 %	80 %	0 %	0 %	410677914
15	NC_018878	GTATT	2	10	15191	15200	20 %	60 %	20 %	0 %	410677915
16	NC_018878	AAATT	2	10	15514	15523	60 %	40 %	0 %	0 %	410677915
17	NC_018878	TTTAA	2	10	17495	17504	40 %	60 %	0 %	0 %	410677917
18	NC_018878	AGAAA	2	10	19817	19826	80 %	0 %	20 %	0 %	410677921
19	NC_018878	TCAAT	2	10	20131	20140	40 %	40 %	0 %	20 %	410677922
20	NC_018878	AAAGA	2	10	22291	22300	80 %	0 %	20 %	0 %	410677927
21	NC_018878	GAGAT	2	10	24221	24230	40 %	20 %	40 %	0 %	410677930
22	NC_018878	ATAAA	2	10	24424	24433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018878	CATTT	2	10	24522	24531	20 %	60 %	0 %	20 %	410677931
24	NC_018878	CAATA	2	10	26074	26083	60 %	20 %	0 %	20 %	410677932
25	NC_018878	GAATT	2	10	26108	26117	40 %	40 %	20 %	0 %	410677932
26	NC_018878	AATCT	2	10	27169	27178	40 %	40 %	0 %	20 %	410677933
27	NC_018878	AGAGT	2	10	27682	27691	40 %	20 %	40 %	0 %	410677935
28	NC_018878	TTTTC	2	10	28729	28738	0 %	80 %	0 %	20 %	410677936
29	NC_018878	TAATA	2	10	29353	29362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018878	GAAGG	2	10	30243	30252	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018878	GCTTT	2	10	30382	30391	0 %	60 %	20 %	20 %	410677939
32	NC_018878	AAGTC	2	10	32218	32227	40 %	20 %	20 %	20 %	410677942
33	NC_018878	TATTT	2	10	34658	34667	20 %	80 %	0 %	0 %	410677945
34	NC_018878	ATTTA	2	10	34677	34686	40 %	60 %	0 %	0 %	410677945
35	NC_018878	GAAAA	2	10	34849	34858	80 %	0 %	20 %	0 %	410677945
36	NC_018878	ACACA	2	10	35290	35299	60 %	0 %	0 %	40 %	410677946
37	NC_018878	GAACG	2	10	35450	35459	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018878	GAAAA	2	10	35524	35533	80 %	0 %	20 %	0 %	410677947
39	NC_018878	AAAGT	2	10	35750	35759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018878	TATCT	2	10	36971	36980	20 %	60 %	0 %	20 %	410677948
41	NC_018878	TGTAT	2	10	38920	38929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018878	TATAT	2	10	39305	39314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018878	TTATT	2	10	40042	40051	20 %	80 %	0 %	0 %	410677954
44	NC_018878	ATAAA	2	10	40952	40961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018878	TAAAC	2	10	43011	43020	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018878	TCATA	2	10	44293	44302	40 %	40 %	0 %	20 %	410677963
47	NC_018878	TCATT	2	10	44617	44626	20 %	60 %	0 %	20 %	410677963
48	NC_018878	CACTC	2	10	44627	44636	20 %	20 %	0 %	60 %	410677964
49	NC_018878	TTTCG	2	10	44639	44648	0 %	60 %	20 %	20 %	410677964
50	NC_018878	TTTGA	2	10	44809	44818	20 %	60 %	20 %	0 %	410677964
51	NC_018878	TGAAG	2	10	45682	45691	40 %	20 %	40 %	0 %	410677965
52	NC_018878	TTATA	2	10	46887	46896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018878	AGAAA	2	10	47307	47316	80 %	0 %	20 %	0 %	410677967
54	NC_018878	TTGGA	2	10	48771	48780	20 %	40 %	40 %	0 %	410677969
55	NC_018878	TTGTT	2	10	51346	51355	0 %	80 %	20 %	0 %	410677971
56	NC_018878	ATATT	2	10	53501	53510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018878	CGAGG	2	10	53556	53565	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018878	GAGAA	2	10	53999	54008	60 %	0 %	40 %	0 %	410677976
59	NC_018878	AATCA	2	10	56970	56979	60 %	20 %	0 %	20 %	410677980
60	NC_018878	ATTCC	2	10	57456	57465	20 %	40 %	0 %	40 %	410677982
61	NC_018878	AAATA	2	10	58115	58124	80 %	20 %	0 %	0 %	410677985
62	NC_018878	AATTT	2	10	58471	58480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018878	ATTTC	2	10	60419	60428	20 %	60 %	0 %	20 %	410677989
64	NC_018878	ATTAC	2	10	62540	62549	40 %	40 %	0 %	20 %	410677993
65	NC_018878	TGTAT	2	10	62641	62650	20 %	60 %	20 %	0 %	410677993
66	NC_018878	TTTAT	2	10	63798	63807	20 %	80 %	0 %	0 %	410677994
67	NC_018878	TAGGG	2	10	64599	64608	20 %	20 %	60 %	0 %	410677997
68	NC_018878	AAAAG	2	10	65369	65378	80 %	0 %	20 %	0 %	410677998
69	NC_018878	AAATG	2	10	65577	65586	60 %	20 %	20 %	0 %	410677999
70	NC_018878	TGAAA	2	10	67221	67230	60 %	20 %	20 %	0 %	410678003
71	NC_018878	AAAGG	2	10	68019	68028	60 %	0 %	40 %	0 %	410678005
72	NC_018878	ATTTT	2	10	68789	68798	20 %	80 %	0 %	0 %	410678007
73	NC_018878	TTTCT	2	10	68842	68851	0 %	80 %	0 %	20 %	410678007
74	NC_018878	AAAAT	2	10	69369	69378	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018878	GGGAA	2	10	69577	69586	40 %	0 %	60 %	0 %	410678009
76	NC_018878	ATTAC	2	10	69770	69779	40 %	40 %	0 %	20 %	410678009
77	NC_018878	AAAAG	2	10	72633	72642	80 %	0 %	20 %	0 %	410678014
78	NC_018878	TCAAT	2	10	72819	72828	40 %	40 %	0 %	20 %	410678014
79	NC_018878	AATTT	2	10	73537	73546	40 %	60 %	0 %	0 %	410678015
80	NC_018878	GAGAA	2	10	74317	74326	60 %	0 %	40 %	0 %	410678017
81	NC_018878	AGAAA	2	10	74547	74556	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018878	ATGAA	2	10	74628	74637	60 %	20 %	20 %	0 %	410678018
83	NC_018878	CTTCC	2	10	78094	78103	0 %	40 %	0 %	60 %	410678024
84	NC_018878	AATTT	2	10	78951	78960	40 %	60 %	0 %	0 %	410678026
85	NC_018878	TATAA	2	10	81584	81593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018878	TTTGG	2	10	81728	81737	0 %	60 %	40 %	0 %	410678033
87	NC_018878	GAAGC	2	10	82331	82340	40 %	0 %	40 %	20 %	410678035
88	NC_018878	AAATC	2	10	82466	82475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018878	CCGAG	2	10	82924	82933	20 %	0 %	40 %	40 %	410678036
90	NC_018878	GTAAA	2	10	83274	83283	60 %	20 %	20 %	0 %	410678037
91	NC_018878	AATCG	2	10	85190	85199	40 %	20 %	20 %	20 %	410678044
92	NC_018878	TGGAA	2	10	88380	88389	40 %	20 %	40 %	0 %	410678047
93	NC_018878	ATAAA	2	10	88805	88814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018878	AAAGC	2	10	89980	89989	60 %	0 %	20 %	20 %	410678048
95	NC_018878	ATATG	2	10	91126	91135	40 %	40 %	20 %	0 %	410678049
96	NC_018878	CTTTT	2	10	93379	93388	0 %	80 %	0 %	20 %	410678051
97	NC_018878	TAAAT	2	10	94321	94330	60 %	40 %	0 %	0 %	410678051
98	NC_018878	AATAA	2	10	94427	94436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018878	GTTTT	2	10	95458	95467	0 %	80 %	20 %	0 %	410678053
100	NC_018878	ATTGA	2	10	96981	96990	40 %	40 %	20 %	0 %	410678058
101	NC_018878	TGTTA	2	10	101448	101457	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018878	AGTTA	2	10	103028	103037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018878	AGTTT	2	10	103459	103468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018878	TAATT	2	10	105229	105238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018878	TTTAT	2	10	105988	105997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018878	AGTTA	2	10	106866	106875	40 %	40 %	20 %	0 %	410678063
107	NC_018878	AACAA	2	10	107194	107203	80 %	0 %	0 %	20 %	410678063
108	NC_018878	TTGTT	2	10	107647	107656	0 %	80 %	20 %	0 %	410678064
109	NC_018878	TGGAA	2	10	108183	108192	40 %	20 %	40 %	0 %	410678065
110	NC_018878	TTTTA	2	10	108351	108360	20 %	80 %	0 %	0 %	410678065
111	NC_018878	AAAAT	2	10	108364	108373	80 %	20 %	0 %	0 %	410678065
112	NC_018878	AAATG	2	10	108915	108924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018878	AATAA	2	10	109454	109463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018878	TATAG	2	10	109464	109473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018878	AAACA	2	10	109577	109586	80 %	0 %	0 %	20 %	410678067
116	NC_018878	GAGAA	2	10	110176	110185	60 %	0 %	40 %	0 %	410678067
117	NC_018878	CATTT	2	10	110839	110848	20 %	60 %	0 %	20 %	410678067
118	NC_018878	AATAC	2	10	112725	112734	60 %	20 %	0 %	20 %	410678067
119	NC_018878	ACGAT	2	10	113570	113579	40 %	20 %	20 %	20 %	410678068
120	NC_018878	CACAA	2	10	114278	114287	60 %	0 %	0 %	40 %	410678068
121	NC_018878	TTATT	2	10	114840	114849	20 %	80 %	0 %	0 %	410678068
122	NC_018878	AAATA	2	10	115212	115221	80 %	20 %	0 %	0 %	410678068
123	NC_018878	TATCA	2	10	117105	117114	40 %	40 %	0 %	20 %	410678069
124	NC_018878	AAAGA	2	10	117226	117235	80 %	0 %	20 %	0 %	410678069
125	NC_018878	ATGGG	2	10	117405	117414	20 %	20 %	60 %	0 %	410678069
126	NC_018878	CAAGA	2	10	117517	117526	60 %	0 %	20 %	20 %	410678069
127	NC_018878	TGGGT	2	10	117945	117954	0 %	40 %	60 %	0 %	410678069
128	NC_018878	GAAAA	2	10	117979	117988	80 %	0 %	20 %	0 %	410678069
129	NC_018878	ATTGG	2	10	118288	118297	20 %	40 %	40 %	0 %	410678069
130	NC_018878	AAACG	2	10	119302	119311	60 %	0 %	20 %	20 %	410678069
131	NC_018878	ATGGG	2	10	119378	119387	20 %	20 %	60 %	0 %	410678069
132	NC_018878	AATTC	2	10	119420	119429	40 %	40 %	0 %	20 %	410678069
133	NC_018878	ATACC	2	10	120269	120278	40 %	20 %	0 %	40 %	410678069
134	NC_018878	GAAGC	2	10	121465	121474	40 %	0 %	40 %	20 %	410678070
135	NC_018878	GGATT	2	10	121941	121950	20 %	40 %	40 %	0 %	410678070
136	NC_018878	TAAAG	2	10	121973	121982	60 %	20 %	20 %	0 %	410678070
137	NC_018878	GATAA	2	10	122316	122325	60 %	20 %	20 %	0 %	410678070
138	NC_018878	TAAAA	2	10	122540	122549	80 %	20 %	0 %	0 %	410678070
139	NC_018878	TTAAA	2	10	123175	123184	60 %	40 %	0 %	0 %	410678070
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264	NC_018878	ATAAA	2	10	232156	232165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_018878	TTTTA	2	10	240464	240473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_018878	TATTT	2	10	240489	240498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_018878	ATACA	2	10	241875	241884	60 %	20 %	0 %	20 %	410678272
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