MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p

Total Repeats: 369

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018878	AAGA	2	8	2346	2353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018878	AGTA	2	8	2355	2362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018878	TAAA	2	8	4415	4422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018878	TAAT	2	8	4436	4443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018878	AATG	2	8	4452	4459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018878	TAAT	2	8	4519	4526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018878	AATT	2	8	4607	4614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018878	TAAA	2	8	7244	7251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018878	GATA	2	8	7349	7356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018878	TAAA	2	8	9720	9727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018878	TTAT	2	8	12345	12352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018878	TCAA	2	8	14591	14598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018878	GAAA	2	8	19004	19011	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018878	TAAA	2	8	20330	20337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018878	CTTT	2	8	22415	22422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018878	TTTA	2	8	25934	25941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018878	TAAA	2	8	26605	26612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018878	ATAA	2	8	27252	27259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018878	GTCT	2	8	28185	28192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018878	GTTG	2	8	28193	28200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018878	AACA	2	8	30042	30049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018878	TAAA	2	8	30975	30982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018878	TATT	2	8	31001	31008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018878	ACAA	2	8	35426	35433	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018878	TAAT	2	8	35826	35833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018878	TAAA	2	8	37140	37147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018878	TTTG	2	8	38936	38943	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018878	AGAT	2	8	42790	42797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018878	AATA	2	8	42906	42913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018878	TAAA	2	8	42967	42974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018878	ATAA	2	8	42975	42982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018878	TTAA	2	8	45462	45469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018878	AATG	2	8	48133	48140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018878	CTAC	2	8	48368	48375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018878	CTTT	2	8	49904	49911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018878	CTTT	2	8	50706	50713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018878	CATT	2	8	50777	50784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018878	TCAT	2	8	50839	50846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018878	TAAA	2	8	51022	51029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018878	CTTT	2	8	51567	51574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018878	CTTC	2	8	52751	52758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018878	TATT	2	8	53478	53485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018878	GTAA	2	8	53486	53493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018878	TAAA	2	8	54637	54644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018878	TAAA	2	8	56107	56114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018878	TATC	2	8	60032	60039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018878	TAGA	2	8	60163	60170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018878	AGAA	2	8	61140	61147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018878	TTTA	2	8	61150	61157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018878	ACAA	2	8	61447	61454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018878	TTTA	2	8	61990	61997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018878	TAAA	2	8	63401	63408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018878	TTAA	2	8	63434	63441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018878	ATTG	2	8	64204	64211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018878	CAAA	2	8	64217	64224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018878	CTTT	2	8	64476	64483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018878	TAAA	2	8	64973	64980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018878	TTTC	2	8	69314	69321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018878	ATGA	2	8	69394	69401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018878	GTGA	2	8	69451	69458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018878	TAAT	2	8	71353	71360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018878	AATT	2	8	71732	71739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018878	TGTT	2	8	71748	71755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018878	ATAG	2	8	75023	75030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018878	TTAA	2	8	79377	79384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018878	AGGT	2	8	80333	80340	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018878	AAGG	2	8	81632	81639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018878	AAAT	2	8	82155	82162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018878	ACTC	2	8	84300	84307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018878	ATCT	2	8	88062	88069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018878	AAAT	2	8	88756	88763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018878	TAAA	2	8	91218	91225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018878	ATTT	2	8	91271	91278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018878	TAAA	2	8	91286	91293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018878	AGTT	2	8	91348	91355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018878	CTAA	2	8	94358	94365	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018878	TACA	2	8	94392	94399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018878	TAAA	2	8	96234	96241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018878	TTTA	2	8	96251	96258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018878	GAAC	2	8	96337	96344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018878	GAAT	2	8	96441	96448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018878	ATAA	2	8	96734	96741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018878	CAAA	2	8	97794	97801	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018878	CAAA	2	8	97819	97826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018878	GAAA	2	8	98088	98095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018878	CAAT	2	8	98201	98208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018878	TCAT	2	8	98555	98562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018878	TTAA	2	8	98977	98984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018878	AACC	2	8	99160	99167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018878	CTAC	2	8	99475	99482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018878	TTAT	2	8	99992	99999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018878	AGAA	2	8	100221	100228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018878	ACTC	2	8	101049	101056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018878	ACTC	2	8	101501	101508	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018878	ATTT	2	8	101731	101738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018878	AGAA	2	8	102262	102269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018878	ATAA	2	8	102751	102758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018878	TCCA	2	8	102836	102843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018878	GAGT	2	8	103018	103025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018878	ATAA	2	8	104089	104096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018878	TGGA	2	8	104297	104304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018878	TAAA	2	8	104535	104542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018878	GAAA	2	8	104889	104896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018878	CGAA	2	8	105193	105200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018878	CCTA	2	8	105929	105936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018878	ATTA	2	8	106477	106484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018878	TTTA	2	8	106506	106513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018878	AAAT	2	8	107343	107350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018878	TAAA	2	8	107524	107531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018878	TTTA	2	8	109438	109445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018878	ATAA	2	8	109478	109485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018878	AATT	2	8	129822	129829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018878	TCAT	2	8	131562	131569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018878	GAAA	2	8	137337	137344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018878	TTTC	2	8	141016	141023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018878	CAAG	2	8	141087	141094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018878	TGTT	2	8	142651	142658	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018878	AGAT	2	8	142672	142679	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018878	ATAG	2	8	146698	146705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018878	AGAA	2	8	146713	146720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018878	ATTA	2	8	148336	148343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018878	CAAG	2	8	150921	150928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018878	GAGT	2	8	150929	150936	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018878	CAAA	2	8	151877	151884	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018878	AAGG	2	8	151925	151932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018878	GAAT	2	8	153457	153464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018878	AAAT	2	8	153465	153472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018878	TTAA	2	8	153482	153489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018878	ATTT	2	8	153972	153979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018878	GAAT	2	8	157119	157126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018878	AATA	5	20	158292	158311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018878	ATAG	2	8	158316	158323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018878	AAGG	2	8	163618	163625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018878	GATA	2	8	167657	167664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018878	TTAT	2	8	168404	168411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018878	ACGT	2	8	168510	168517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018878	TAAA	2	8	172881	172888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018878	ATCT	2	8	175406	175413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018878	AATA	2	8	175495	175502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018878	AAGG	2	8	180498	180505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018878	CTTT	2	8	182089	182096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018878	GAAG	2	8	182899	182906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018878	ATAA	2	8	186986	186993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018878	TAAT	2	8	187788	187795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018878	AAGG	2	8	188616	188623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018878	AATC	2	8	189296	189303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018878	TTTC	2	8	192718	192725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018878	AGAA	2	8	193892	193899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018878	AAGA	2	8	195100	195107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018878	AATT	2	8	197690	197697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018878	ACAG	2	8	198276	198283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018878	TGAG	2	8	198301	198308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_018878	AACA	2	8	198942	198949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.