MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018877	CTATTA	2	12	1548	1559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018877	ATTTTT	2	12	8978	8989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018877	TTTCGT	2	12	10607	10618	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018877	ATTTTT	2	12	28722	28733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018877	TTTCGT	2	12	30351	30362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018877	TTTTCC	2	12	54043	54054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018877	CTTTTT	2	12	74072	74083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018877	TTATAT	2	12	81740	81751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018877	ATTTTT	2	12	82003	82014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018877	ATTTTT	2	12	87713	87724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018877	AGTCAA	2	12	92709	92720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018877	ATTTTT	2	12	150894	150905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018877	GTGATT	2	12	157868	157879	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018877	TGAAAC	2	12	169726	169737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018877	GTATGT	2	12	174028	174039	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018877	AAAATA	2	12	206676	206687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018877	AAGGGG	2	12	206759	206770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018877	AAAAGT	2	12	208177	208188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018877	AGAGGT	2	12	210140	210151	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018877	AAAAGA	2	12	222378	222389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018877	ATTTTT	2	12	243881	243892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018877	ATTTTT	2	12	266998	267009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018877	ATTTTT	2	12	274232	274243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018877	ATTTTT	2	12	282917	282928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018877	AGTATT	2	12	298011	298022	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018877	ATTTTT	2	12	298333	298344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018877	ATTTTT	2	12	305485	305496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018877	TTTATT	2	12	310338	310349	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018877	TATAAA	2	12	343743	343754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018877	AAAAAT	2	12	360281	360292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018877	ATTTGA	2	12	362119	362130	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018877	GTGTAA	2	12	375010	375021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018877	AATGAT	2	12	381560	381571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018877	ATACTT	2	12	387376	387387	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018877	TAAAAA	2	12	440474	440485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018877	AAAAAT	2	12	441841	441852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018877	TATTTT	5	30	462629	462658	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018877	ATTTTT	2	12	466278	466289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018877	CCAATT	2	12	472227	472238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018877	TTTTCT	2	12	488120	488131	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018877	GCATAA	2	12	500824	500835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018877	AATGAA	2	12	500877	500888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018877	ATTTTT	2	12	525355	525366	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018877	ATCATT	2	12	545047	545058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018877	TGTATA	2	12	597617	597628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018877	ATTTAT	2	12	605448	605459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018877	ATGAAA	2	12	637884	637895	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018877	TTTAAT	2	12	696121	696132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018877	CTTTTT	2	12	710772	710783	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018877	TCTAAA	2	12	731642	731653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018877	AGATTT	2	12	732681	732692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018877	GAAATA	2	12	740193	740204	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018877	ATTTTT	2	12	742024	742035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018877	ACTTAA	2	12	755427	755438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018877	CTTTTT	2	12	767134	767145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018877	TTAAAA	2	12	776905	776916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018877	ATTTTT	2	12	784116	784127	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018877	ATCAAT	2	12	828879	828890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018877	GTATAT	2	12	835612	835623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018877	TGTAGA	2	12	841701	841712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018877	ATGTAA	2	12	858193	858204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018877	AAATTC	2	12	883953	883964	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018877	AAATGT	2	12	903141	903152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018877	ACGAGA	2	12	903190	903201	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018877	GTTTTT	2	12	908767	908778	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018877	GTATAT	2	12	921966	921977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018877	ATTACC	2	12	932194	932205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018877	TATGAA	2	12	945195	945206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018877	AAAAAT	2	12	956776	956787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018877	GTAGAA	2	12	959205	959216	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018877	TGGGAG	2	12	960697	960708	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018877	TGATGG	2	12	963853	963864	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018877	GCATGT	2	12	975389	975400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018877	ATATAG	2	12	990867	990878	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018877	AAATGT	2	12	1006924	1006935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018877	CATTAA	2	12	1015168	1015179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018877	TGTTTA	2	12	1015188	1015199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018877	GCAATA	2	12	1019361	1019372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018877	AGCCAC	2	12	1019635	1019646	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018877	ATTAAA	2	12	1021080	1021091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018877	TACTTT	2	12	1030541	1030552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018877	TCTTTT	2	12	1059532	1059543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018877	ATACAT	2	12	1072655	1072666	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018877	AAAATA	2	12	1080572	1080583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018877	AAAAAG	2	12	1120239	1120250	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018877	TAATAT	2	12	1120866	1120877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018877	TCCATT	2	12	1122160	1122171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018877	AAATTC	2	12	1126704	1126715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018877	TACTTT	3	18	1139151	1139168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018877	GAAGTA	2	12	1157512	1157523	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018877	CTTTTT	2	12	1186863	1186874	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018877	GAAATA	2	12	1205731	1205742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018877	AAGTAT	2	12	1234966	1234977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018877	GAAGGG	2	12	1244234	1244245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018877	ATTTGA	2	12	1280591	1280602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018877	AGAAAT	2	12	1281487	1281498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018877	TTACGT	2	12	1281712	1281723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018877	GGAGAG	2	12	1283823	1283834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018877	AAATAA	2	12	1286170	1286181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018877	AAAGAA	2	12	1286975	1286986	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018877	GAAAAA	2	12	1315813	1315824	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018877	AGGATA	2	12	1340459	1340470	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018877	AAAAGT	2	12	1352550	1352561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018877	AATAAA	2	12	1361482	1361493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018877	TCTTTT	2	12	1384064	1384075	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018877	ATACAA	2	12	1409704	1409715	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018877	GTATAT	2	12	1436543	1436554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018877	TTATCA	2	12	1445718	1445729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018877	TTTTAT	2	12	1488862	1488873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018877	GAAATA	2	12	1525487	1525498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018877	AGGTAG	2	12	1540301	1540312	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018877	ATAAGT	2	12	1590980	1590991	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018877	AATGAT	2	12	1649927	1649938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018877	TTAAAA	2	12	1651382	1651393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018877	TATAAC	2	12	1651444	1651455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018877	TAAAGG	2	12	1673532	1673543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018877	TTTATT	2	12	1676364	1676375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018877	AATAGA	2	12	1687077	1687088	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018877	AGAGAT	2	12	1696432	1696443	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018877	TCCTTT	2	12	1718562	1718573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018877	GAAAAT	2	12	1729332	1729343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018877	TTTTAT	2	12	1744295	1744306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018877	TTTTTA	2	12	1759777	1759788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018877	TTCTTT	2	12	1776358	1776369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018877	TATGGA	2	12	1810676	1810687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018877	GAAAAA	2	12	1822857	1822868	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018877	AAAATC	2	12	1827720	1827731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018877	AAAATA	2	12	1871286	1871297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018877	ATATAA	2	12	1871405	1871416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.