MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 chromosome

Total Repeats: 5071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018877	CAAAT	2	10	1014	1023	60 %	20 %	0 %	20 %	410672378
2	NC_018877	TACAA	2	10	1628	1637	60 %	20 %	0 %	20 %	410672379
3	NC_018877	AAAAT	2	10	1932	1941	80 %	20 %	0 %	0 %	410672379
4	NC_018877	ATTAA	2	10	4900	4909	60 %	40 %	0 %	0 %	410672382
5	NC_018877	CCAGC	2	10	5977	5986	20 %	0 %	20 %	60 %	410672382
6	NC_018877	AAAAC	2	10	7339	7348	80 %	0 %	0 %	20 %	410672383
7	NC_018877	AAACA	2	10	8951	8960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018877	TCGTG	2	10	10089	10098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018877	TTCAA	2	10	10632	10641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018877	GATAT	2	10	10660	10669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018877	ATGGT	2	10	11072	11081	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018877	CTGAA	2	10	12836	12845	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018877	TAGGT	2	10	14070	14079	20 %	40 %	40 %	0 %	410672384
14	NC_018877	TAAAG	2	10	15429	15438	60 %	20 %	20 %	0 %	410672385
15	NC_018877	ATGCT	2	10	15866	15875	20 %	40 %	20 %	20 %	410672385
16	NC_018877	TGGAA	2	10	19863	19872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018877	TAAAA	2	10	20019	20028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018877	TTTCC	2	10	21396	21405	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018877	ATATT	2	10	21449	21458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018877	TTTTA	2	10	21628	21637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018877	AAATT	2	10	23182	23191	60 %	40 %	0 %	0 %	410672392
22	NC_018877	ATTTT	2	10	23598	23607	20 %	80 %	0 %	0 %	410672393
23	NC_018877	AAGCG	2	10	26501	26510	40 %	0 %	40 %	20 %	410672395
24	NC_018877	TGAAG	2	10	27091	27100	40 %	20 %	40 %	0 %	410672396
25	NC_018877	TATTT	2	10	28132	28141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018877	TTGTC	2	10	28214	28223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018877	TCGTG	2	10	29833	29842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018877	TTCAA	2	10	30376	30385	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018877	GATAT	2	10	30404	30413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018877	ATGGT	2	10	30816	30825	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018877	CTGAA	2	10	32580	32589	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018877	TTGGC	2	10	36048	36057	0 %	40 %	40 %	20 %	410672402
33	NC_018877	GTATT	2	10	36171	36180	20 %	60 %	20 %	0 %	410672402
34	NC_018877	ATTGT	2	10	40112	40121	20 %	60 %	20 %	0 %	410672408
35	NC_018877	TGGAT	2	10	42190	42199	20 %	40 %	40 %	0 %	410672410
36	NC_018877	TGACA	2	10	43559	43568	40 %	20 %	20 %	20 %	410672411
37	NC_018877	TCTAT	2	10	44237	44246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018877	GAAAC	2	10	47488	47497	60 %	0 %	20 %	20 %	410672416
39	NC_018877	AAGAC	2	10	47759	47768	60 %	0 %	20 %	20 %	410672417
40	NC_018877	GATTT	2	10	59086	59095	20 %	60 %	20 %	0 %	410672427
41	NC_018877	TATTT	2	10	59645	59654	20 %	80 %	0 %	0 %	410672427
42	NC_018877	TTGGA	2	10	62326	62335	20 %	40 %	40 %	0 %	410672431
43	NC_018877	TTATG	2	10	64648	64657	20 %	60 %	20 %	0 %	410672434
44	NC_018877	GGAAA	3	15	64972	64986	60 %	0 %	40 %	0 %	410672434
45	NC_018877	TCAAT	2	10	66426	66435	40 %	40 %	0 %	20 %	410672434
46	NC_018877	AATGA	2	10	68556	68565	60 %	20 %	20 %	0 %	410672435
47	NC_018877	GATTA	2	10	69031	69040	40 %	40 %	20 %	0 %	410672436
48	NC_018877	ATAAG	2	10	71316	71325	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018877	GGAAC	2	10	72425	72434	40 %	0 %	40 %	20 %	410672439
50	NC_018877	AATTA	2	10	74145	74154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018877	AAGGG	2	10	74417	74426	40 %	0 %	60 %	0 %	410672441
52	NC_018877	AAAAG	2	10	74682	74691	80 %	0 %	20 %	0 %	410672441
53	NC_018877	AGAGC	2	10	75172	75181	40 %	0 %	40 %	20 %	410672441
54	NC_018877	ATTTA	2	10	75695	75704	40 %	60 %	0 %	0 %	410672442
55	NC_018877	TGATG	2	10	76441	76450	20 %	40 %	40 %	0 %	410672443
56	NC_018877	GGTAA	2	10	77939	77948	40 %	20 %	40 %	0 %	410672444
57	NC_018877	AAAAC	2	10	78715	78724	80 %	0 %	0 %	20 %	410672446
58	NC_018877	AAATA	2	10	79361	79370	80 %	20 %	0 %	0 %	410672448
59	NC_018877	GTTAT	2	10	81587	81596	20 %	60 %	20 %	0 %	410672449
60	NC_018877	TCGTG	2	10	83114	83123	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018877	ATGGT	2	10	83872	83881	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018877	CTGAA	2	10	85636	85645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018877	TCGTG	2	10	88824	88833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018877	ATGGT	2	10	89582	89591	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018877	CTGAA	2	10	91346	91355	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018877	TTTTA	2	10	92568	92577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018877	TCAAA	2	10	94591	94600	60 %	20 %	0 %	20 %	410672452
68	NC_018877	GAACA	2	10	95097	95106	60 %	0 %	20 %	20 %	410672453
69	NC_018877	GAACA	2	10	95319	95328	60 %	0 %	20 %	20 %	410672453
70	NC_018877	TGAAG	2	10	96259	96268	40 %	20 %	40 %	0 %	410672453
71	NC_018877	GAAAA	2	10	96282	96291	80 %	0 %	20 %	0 %	410672453
72	NC_018877	GAAAA	2	10	96405	96414	80 %	0 %	20 %	0 %	410672453
73	NC_018877	AGTGA	2	10	97517	97526	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018877	CGTAT	2	10	98279	98288	20 %	40 %	20 %	20 %	410672454
75	NC_018877	TGAAA	2	10	98340	98349	60 %	20 %	20 %	0 %	410672454
76	NC_018877	GTAAT	2	10	99305	99314	40 %	40 %	20 %	0 %	410672455
77	NC_018877	TATGA	2	10	100043	100052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018877	ATATA	2	10	102018	102027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018877	CATTC	2	10	103163	103172	20 %	40 %	0 %	40 %	410672459
80	NC_018877	GAAAA	2	10	104051	104060	80 %	0 %	20 %	0 %	410672459
81	NC_018877	GAAAA	2	10	109740	109749	80 %	0 %	20 %	0 %	410672467
82	NC_018877	GAAAA	2	10	109756	109765	80 %	0 %	20 %	0 %	410672467
83	NC_018877	AAAGA	2	10	112802	112811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018877	AGAAA	2	10	113375	113384	80 %	0 %	20 %	0 %	410672472
85	NC_018877	TAACG	2	10	118917	118926	40 %	20 %	20 %	20 %	410672474
86	NC_018877	CAATC	2	10	119451	119460	40 %	20 %	0 %	40 %	410672474
87	NC_018877	AACAT	2	10	121159	121168	60 %	20 %	0 %	20 %	410672475
88	NC_018877	ACGTG	2	10	121849	121858	20 %	20 %	40 %	20 %	410672477
89	NC_018877	TAAAA	2	10	122454	122463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018877	AATCC	2	10	122464	122473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018877	TCGTA	2	10	122885	122894	20 %	40 %	20 %	20 %	410672478
92	NC_018877	CATGG	2	10	126211	126220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018877	TGGTA	2	10	129973	129982	20 %	40 %	40 %	0 %	410672487
94	NC_018877	GTGCG	2	10	137213	137222	0 %	20 %	60 %	20 %	410672502
95	NC_018877	GAAAT	2	10	141838	141847	60 %	20 %	20 %	0 %	410672510
96	NC_018877	GAGCA	2	10	144852	144861	40 %	0 %	40 %	20 %	410672514
97	NC_018877	AAAAG	2	10	145516	145525	80 %	0 %	20 %	0 %	410672516
98	NC_018877	GGGCT	2	10	146823	146832	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018877	GATAA	2	10	147335	147344	60 %	20 %	20 %	0 %	410672518
100	NC_018877	CTTGG	2	10	148170	148179	0 %	40 %	40 %	20 %	410672519
101	NC_018877	GTTTT	2	10	148889	148898	0 %	80 %	20 %	0 %	410672520
102	NC_018877	TCGTG	2	10	152005	152014	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018877	ATGGT	2	10	152763	152772	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018877	CTGAA	2	10	154527	154536	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018877	ATGTG	2	10	157259	157268	20 %	40 %	40 %	0 %	410672523
106	NC_018877	CAAAA	2	10	161218	161227	80 %	0 %	0 %	20 %	410672526
107	NC_018877	ATTAC	2	10	162479	162488	40 %	40 %	0 %	20 %	410672527
108	NC_018877	AAGTA	2	10	163549	163558	60 %	20 %	20 %	0 %	410672528
109	NC_018877	ACAGC	2	10	164519	164528	40 %	0 %	20 %	40 %	410672528
110	NC_018877	CGTAG	2	10	164714	164723	20 %	20 %	40 %	20 %	410672528
111	NC_018877	ATTAT	2	10	170175	170184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018877	TGGAA	2	10	170209	170218	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018877	AGAAT	2	10	172465	172474	60 %	20 %	20 %	0 %	410672534
114	NC_018877	TTCAC	2	10	173242	173251	20 %	40 %	0 %	40 %	410672535
115	NC_018877	TGCTT	2	10	177676	177685	0 %	60 %	20 %	20 %	410672539
116	NC_018877	TCTAT	2	10	177921	177930	20 %	60 %	0 %	20 %	410672539
117	NC_018877	AAAAG	2	10	178025	178034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018877	AAAGG	2	10	178956	178965	60 %	0 %	40 %	0 %	410672540
119	NC_018877	AAAAG	2	10	182109	182118	80 %	0 %	20 %	0 %	410672543
120	NC_018877	TTTTA	2	10	183472	183481	20 %	80 %	0 %	0 %	410672545
121	NC_018877	ATCTT	2	10	184952	184961	20 %	60 %	0 %	20 %	410672546
122	NC_018877	AACGT	2	10	184967	184976	40 %	20 %	20 %	20 %	410672546
123	NC_018877	ATGGG	2	10	188039	188048	20 %	20 %	60 %	0 %	410672549
124	NC_018877	TATTT	2	10	188373	188382	20 %	80 %	0 %	0 %	410672550
125	NC_018877	AGTTT	2	10	188692	188701	20 %	60 %	20 %	0 %	410672550
126	NC_018877	TATTG	2	10	189134	189143	20 %	60 %	20 %	0 %	410672551
127	NC_018877	TAAAT	2	10	190272	190281	60 %	40 %	0 %	0 %	410672552
128	NC_018877	TTTGT	2	10	192043	192052	0 %	80 %	20 %	0 %	410672553
129	NC_018877	AAACC	2	10	194116	194125	60 %	0 %	0 %	40 %	410672554
130	NC_018877	TTGAT	2	10	194710	194719	20 %	60 %	20 %	0 %	410672555
131	NC_018877	AAAAG	2	10	195054	195063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018877	ATGGA	2	10	195075	195084	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018877	AAAGG	2	10	195110	195119	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018877	TTTTA	2	10	195519	195528	20 %	80 %	0 %	0 %	410672556
135	NC_018877	GTTTT	2	10	195969	195978	0 %	80 %	20 %	0 %	410672557
136	NC_018877	TTCTT	2	10	198647	198656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018877	GATAT	2	10	199565	199574	40 %	40 %	20 %	0 %	410672560
138	NC_018877	TACCT	2	10	200166	200175	20 %	40 %	0 %	40 %	410672563
139	NC_018877	TAATT	2	10	200818	200827	40 %	60 %	0 %	0 %	410672563
140	NC_018877	ATTTT	2	10	201132	201141	20 %	80 %	0 %	0 %	410672564
141	NC_018877	ATTGT	2	10	201178	201187	20 %	60 %	20 %	0 %	410672564
142	NC_018877	AGCTG	2	10	202107	202116	20 %	20 %	40 %	20 %	410672565
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148	NC_018877	ATTAC	2	10	206906	206915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018877	TGTAA	2	10	206943	206952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_018877	CTGAA	2	10	247513	247522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_018877	CATTT	2	10	252463	252472	20 %	60 %	0 %	20 %	410672611
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197	NC_018877	ATGGT	2	10	276100	276109	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_018877	GAAAT	2	10	358215	358224	60 %	20 %	20 %	0 %	410672684
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269	NC_018877	GTTTG	2	10	369738	369747	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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