MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanolobus psychrophilus R15 chromosome

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018876	GAAGG	2	10	2367	2376	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018876	GTTGA	2	10	2855	2864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018876	ATATA	2	10	3663	3672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018876	ATTTA	2	10	8240	8249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018876	AATCC	2	10	9051	9060	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018876	CAAGA	2	10	9521	9530	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018876	ATAAG	2	10	12481	12490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018876	CCCTT	2	10	15094	15103	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_018876	TCTTT	2	10	15194	15203	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018876	ATCAA	2	10	29219	29228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018876	TTCGC	2	10	29910	29919	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018876	AGAGA	2	10	70651	70660	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018876	GGAGG	2	10	83045	83054	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018876	TATCC	2	10	83908	83917	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018876	TATCT	2	10	91050	91059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018876	AATAG	2	10	97703	97712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018876	GATAA	2	10	139866	139875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018876	ATTTT	2	10	141523	141532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018876	TGAAT	2	10	156657	156666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018876	TAAAT	2	10	171380	171389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018876	ATTTC	2	10	174072	174081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018876	ATATT	2	10	194484	194493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018876	TTGTC	2	10	194560	194569	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018876	AACAA	2	10	197885	197894	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018876	ATATT	2	10	205243	205252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018876	GGGAT	2	10	206240	206249	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018876	AGTTA	2	10	206480	206489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018876	TTCAA	2	10	216444	216453	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018876	AAAAT	2	10	228184	228193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018876	TCCTT	2	10	228730	228739	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018876	TATAA	2	10	229890	229899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018876	GTAGT	2	10	230814	230823	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018876	GTTTT	2	10	243091	243100	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018876	AACAT	2	10	251863	251872	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018876	GGGGA	2	10	264362	264371	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018876	AAAAG	2	10	266060	266069	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018876	TCAGT	2	10	268332	268341	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018876	ATTAA	2	10	269900	269909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018876	AGAAA	2	10	269910	269919	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018876	TCAAT	2	10	277643	277652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018876	TTTAT	2	10	279762	279771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018876	TTTCT	2	10	280202	280211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018876	GATGA	2	10	283498	283507	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018876	ATCCC	2	10	284424	284433	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_018876	TAAAT	2	10	288890	288899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018876	TTATA	2	10	291131	291140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018876	TTCAC	2	10	294121	294130	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018876	TAACC	2	10	306905	306914	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018876	ACACC	2	10	313804	313813	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_018876	ATTTA	2	10	313852	313861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018876	ATATT	2	10	313950	313959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018876	GTATA	2	10	313980	313989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018876	ACCAT	2	10	317410	317419	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018876	TATCT	2	10	317741	317750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018876	TATCT	2	10	334037	334046	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018876	ATTTT	2	10	341014	341023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018876	TTCAC	2	10	354171	354180	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018876	AAAAG	2	10	372040	372049	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018876	ACAGG	2	10	375205	375214	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018876	TCCAC	2	10	386535	386544	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_018876	ATGTA	2	10	394949	394958	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018876	ATAGT	2	10	395807	395816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018876	GTATA	2	10	405344	405353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018876	AAATA	2	10	405467	405476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018876	CTTGG	2	10	405508	405517	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018876	GAAAT	2	10	407576	407585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018876	AATAA	2	10	420220	420229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018876	TCCTT	2	10	422260	422269	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_018876	GGAGT	2	10	425217	425226	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018876	AAATC	2	10	431658	431667	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018876	GGAAC	2	10	436546	436555	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018876	ATTCT	2	10	445407	445416	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018876	TCATA	2	10	454272	454281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018876	GAAGA	2	10	458649	458658	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018876	ATGCA	2	10	460614	460623	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018876	AATCA	2	10	478894	478903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018876	TGAAA	2	10	479077	479086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018876	TCGCT	2	10	504327	504336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_018876	AATTG	2	10	506808	506817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018876	TTTCA	2	10	517425	517434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018876	GAAAC	2	10	517437	517446	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018876	AATAA	2	10	523245	523254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018876	ATACA	2	10	527900	527909	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018876	TTGTT	2	10	532519	532528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018876	TAAAT	2	10	554073	554082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018876	AGGTA	2	10	574670	574679	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018876	TGGAA	2	10	575006	575015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018876	ATTTG	2	10	575041	575050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018876	CATAT	2	10	597523	597532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018876	AATTT	2	10	597605	597614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018876	AAATT	2	10	598696	598705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018876	AAGGT	2	10	600892	600901	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018876	CTATG	2	10	605108	605117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018876	AATTC	2	10	605257	605266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018876	GATTT	2	10	605755	605764	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018876	TTCAT	2	10	607257	607266	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018876	TATAA	2	10	617407	617416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018876	AATAT	2	10	624281	624290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018876	CCAAA	2	10	624415	624424	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_018876	AATAT	2	10	631442	631451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018876	ATATT	2	10	647065	647074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018876	AGAAA	2	10	660773	660782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018876	GAGAA	2	10	661694	661703	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018876	ACTAA	2	10	661829	661838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018876	TAAAA	2	10	677791	677800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018876	CTTTC	2	10	679293	679302	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_018876	AAATG	2	10	685245	685254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018876	AAAAG	2	10	691340	691349	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018876	GTGTT	2	10	691804	691813	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018876	CAAAA	2	10	694209	694218	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018876	ACATT	2	10	697559	697568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018876	ATATT	2	10	699006	699015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018876	TTAAA	2	10	723977	723986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018876	TAAAG	2	10	735261	735270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018876	ATTAT	2	10	737308	737317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018876	ATATT	2	10	751818	751827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018876	TTACT	2	10	758778	758787	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018876	TGGCT	2	10	760314	760323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018876	GATAT	2	10	760358	760367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018876	GCAAA	2	10	777483	777492	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018876	CAAAA	2	10	778823	778832	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018876	AAATC	2	10	778851	778860	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018876	ATCAT	2	10	779339	779348	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018876	CATTT	2	10	782879	782888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018876	TATTT	2	10	795768	795777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018876	TGAAA	2	10	795835	795844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018876	GTAAA	2	10	811737	811746	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018876	ACTGA	2	10	818952	818961	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018876	CCAGC	2	10	841665	841674	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_018876	AGATG	2	10	846083	846092	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018876	CAAAA	2	10	846174	846183	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018876	GATAA	2	10	850392	850401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018876	AACAG	2	10	862525	862534	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018876	ATTCA	2	10	884930	884939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018876	AGGAA	2	10	890914	890923	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018876	TCTTA	2	10	902188	902197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018876	AAAGC	2	10	904248	904257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018876	TAATA	2	10	922129	922138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018876	AATAG	2	10	922141	922150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018876	CAAAC	2	10	932675	932684	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_018876	TTGCA	2	10	937615	937624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018876	CTGCC	2	10	942675	942684	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_018876	TTACT	2	10	959943	959952	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018876	AAATG	2	10	963801	963810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018876	ATATA	2	10	1008765	1008774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018876	AAAAT	2	10	1008786	1008795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018876	CAAAA	2	10	1025946	1025955	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018876	CATCA	2	10	1026406	1026415	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.