MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Simiduia agarivorans SA1 = DSM 21679

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018868	AATATA	2	12	9615	9626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018868	CCTTAG	2	12	41447	41458	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018868	GGAATC	2	12	107868	107879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018868	AGGATA	2	12	107880	107891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018868	GTAATG	2	12	123118	123129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018868	CGAAAG	2	12	147877	147888	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018868	GGTCAG	2	12	199722	199733	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018868	CTCAGT	2	12	247236	247247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018868	GGCCTG	2	12	259216	259227	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018868	AGGCAG	2	12	295081	295092	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018868	CTCCCA	2	12	320282	320293	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_018868	GTAATA	2	12	320639	320650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018868	CACAAC	2	12	324626	324637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018868	TTGGTT	2	12	363921	363932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018868	TGCTGG	2	12	364302	364313	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018868	CTGGCG	2	12	470485	470496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018868	TTGTGT	2	12	478506	478517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018868	ATTGGC	2	12	519888	519899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018868	ATATTT	2	12	596694	596705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018868	TTATTT	2	12	611944	611955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018868	CACTGG	2	12	649056	649067	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018868	CCTGAG	2	12	827535	827546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018868	AGTGTC	2	12	848130	848141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018868	ACCCGC	2	12	871426	871437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018868	GCCTGA	2	12	1008434	1008445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018868	ATTTCA	2	12	1035160	1035171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018868	TTTACA	2	12	1037320	1037331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018868	AAATCA	2	12	1037387	1037398	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018868	TTATGA	2	12	1109287	1109298	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018868	CTTCAT	2	12	1148158	1148169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018868	TCTGAT	2	12	1173155	1173166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018868	GGCTGG	2	12	1235453	1235464	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018868	CCGCCT	2	12	1276105	1276116	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018868	TTTCAA	2	12	1282189	1282200	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018868	CATTAG	2	12	1284686	1284697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018868	CGTGGG	2	12	1377250	1377261	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018868	TAATGA	3	18	1438693	1438710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018868	ACGCCA	2	12	1444938	1444949	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018868	GCCCCC	2	12	1476581	1476592	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
40	NC_018868	AGGCAA	2	12	1500334	1500345	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018868	TTGCCT	2	12	1500363	1500374	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018868	AAAATA	2	12	1504764	1504775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018868	CGCCCC	2	12	1656128	1656139	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_018868	CGGAAC	2	12	1659309	1659320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018868	ATCCCG	2	12	1659921	1659932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018868	GATGAA	2	12	1746901	1746912	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018868	AGCCAA	2	12	1851036	1851047	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018868	GGCATT	2	12	1862700	1862711	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018868	TTTTCA	2	12	1880871	1880882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018868	ATTTCA	2	12	1907193	1907204	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018868	TTTACA	2	12	1909352	1909363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018868	CTAAAA	2	12	2035016	2035027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018868	GCTTGT	2	12	2036888	2036899	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018868	TAACAA	2	12	2050009	2050020	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018868	TAAAAA	2	12	2052562	2052573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018868	TTTTTG	2	12	2070962	2070973	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018868	ATTTCA	2	12	2072676	2072687	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018868	TTTACA	2	12	2074835	2074846	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018868	AAATCA	2	12	2074902	2074913	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018868	GGTGCA	2	12	2087328	2087339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018868	GATTGT	2	12	2131731	2131742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018868	GTTTAC	2	12	2206732	2206743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018868	CCAATT	2	12	2327107	2327118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018868	AAGCGC	2	12	2356038	2356049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018868	AGGCGC	2	12	2427806	2427817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018868	CTGCCG	2	12	2476681	2476692	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018868	CAAGAA	2	12	2484692	2484703	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018868	TTATCG	2	12	2488914	2488925	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018868	AGCGCC	2	12	2490709	2490720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018868	CCTTGC	2	12	2597097	2597108	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018868	TTGACA	2	12	2604708	2604719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018868	ATGCCC	2	12	2609913	2609924	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018868	GGGTTG	2	12	2646059	2646070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018868	CAAAAA	2	12	2730190	2730201	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018868	CTGTGG	2	12	2753650	2753661	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018868	AAATAT	2	12	2859985	2859996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018868	TGTTGG	2	12	2892340	2892351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018868	TGCCGC	3	18	2974026	2974043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018868	AGAGAA	2	12	3008628	3008639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018868	GTTCGG	3	18	3013696	3013713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018868	CATTGG	2	12	3022919	3022930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018868	AAGCAA	2	12	3039640	3039651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018868	AAGCAA	2	12	3052480	3052491	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018868	GCCTGC	2	12	3108924	3108935	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018868	TGAGCT	2	12	3159885	3159896	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018868	CCATAA	2	12	3193620	3193631	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018868	TCCTTG	2	12	3212179	3212190	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018868	TATCGC	2	12	3228059	3228070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018868	GTTGCT	2	12	3277242	3277253	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018868	ACCGGC	2	12	3293975	3293986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018868	TAAAGG	2	12	3372321	3372332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018868	GCTGGC	2	12	3381370	3381381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018868	GCCTGC	2	12	3381925	3381936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018868	AAGCAA	2	12	3401116	3401127	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018868	CTGTCG	2	12	3514052	3514063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018868	TGGATT	2	12	3566946	3566957	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018868	GGCTGA	2	12	3592096	3592107	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018868	CGGCTG	2	12	3598457	3598468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018868	TAACGT	2	12	3669371	3669382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018868	TTATCC	2	12	3704125	3704136	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018868	CAATAA	2	12	3729288	3729299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018868	GCCGGG	2	12	3762709	3762720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018868	GGGCAT	2	12	4007347	4007358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018868	AATAAA	2	12	4020482	4020493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018868	CCGGTT	2	12	4030323	4030334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018868	GCCTGT	2	12	4037597	4037608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018868	CACCAA	2	12	4037648	4037659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018868	CAACGC	2	12	4037663	4037674	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018868	CAAAAA	2	12	4091911	4091922	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018868	GCTGTC	2	12	4119994	4120005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018868	CAAAAA	2	12	4196582	4196593	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018868	AAGCCG	2	12	4219159	4219170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018868	GCTCTT	2	12	4282498	4282509	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.