MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Simiduia agarivorans SA1 = DSM 21679

Total Repeats: 2284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018868	CAGGT	2	10	1644	1653	20 %	20 %	40 %	20 %	511767221
2	NC_018868	GTCTG	2	10	2947	2956	0 %	40 %	40 %	20 %	511767221
3	NC_018868	CGGTT	2	10	4303	4312	0 %	40 %	40 %	20 %	511767221
4	NC_018868	GGCAG	2	10	5539	5548	20 %	0 %	60 %	20 %	410662603
5	NC_018868	GCATC	2	10	9022	9031	20 %	20 %	20 %	40 %	410662606
6	NC_018868	GCAAC	2	10	13713	13722	40 %	0 %	20 %	40 %	410662610
7	NC_018868	CAGGT	2	10	13774	13783	20 %	20 %	40 %	20 %	410662610
8	NC_018868	CAGGC	2	10	14282	14291	20 %	0 %	40 %	40 %	511767222
9	NC_018868	GGGCA	2	10	15272	15281	20 %	0 %	60 %	20 %	511767222
10	NC_018868	GGTTT	2	10	16195	16204	0 %	60 %	40 %	0 %	511767223
11	NC_018868	CCATT	2	10	16966	16975	20 %	40 %	0 %	40 %	511767223
12	NC_018868	AAAGG	2	10	20195	20204	60 %	0 %	40 %	0 %	410662615
13	NC_018868	AGGGT	2	10	20313	20322	20 %	20 %	60 %	0 %	410662615
14	NC_018868	GTGGC	2	10	20932	20941	0 %	20 %	60 %	20 %	410662617
15	NC_018868	TCCAA	2	10	22756	22765	40 %	20 %	0 %	40 %	511767225
16	NC_018868	GGCAT	2	10	24874	24883	20 %	20 %	40 %	20 %	410662621
17	NC_018868	TGCAA	2	10	26562	26571	40 %	20 %	20 %	20 %	410662622
18	NC_018868	CCCAA	2	10	29438	29447	40 %	0 %	0 %	60 %	511767226
19	NC_018868	GCCTG	2	10	32328	32337	0 %	20 %	40 %	40 %	410662626
20	NC_018868	CAGTG	2	10	32419	32428	20 %	20 %	40 %	20 %	410662626
21	NC_018868	GGTTC	2	10	33453	33462	0 %	40 %	40 %	20 %	410662627
22	NC_018868	GGTCA	2	10	35434	35443	20 %	20 %	40 %	20 %	511767227
23	NC_018868	AGTTC	2	10	37788	37797	20 %	40 %	20 %	20 %	410662631
24	NC_018868	GCGCG	2	10	40077	40086	0 %	0 %	60 %	40 %	410662632
25	NC_018868	TTTGT	2	10	41505	41514	0 %	80 %	20 %	0 %	410662634
26	NC_018868	AGCAC	2	10	41825	41834	40 %	0 %	20 %	40 %	410662634
27	NC_018868	GTCCA	2	10	42682	42691	20 %	20 %	20 %	40 %	410662634
28	NC_018868	TCGGA	2	10	43256	43265	20 %	20 %	40 %	20 %	410662634
29	NC_018868	CAGGC	2	10	45245	45254	20 %	0 %	40 %	40 %	410662635
30	NC_018868	GGTGG	2	10	46509	46518	0 %	20 %	80 %	0 %	410662636
31	NC_018868	TCCGT	2	10	49368	49377	0 %	40 %	20 %	40 %	410662639
32	NC_018868	CAGTT	2	10	51869	51878	20 %	40 %	20 %	20 %	410662643
33	NC_018868	TGTTT	2	10	52577	52586	0 %	80 %	20 %	0 %	410662643
34	NC_018868	GTGGG	2	10	56278	56287	0 %	20 %	80 %	0 %	410662649
35	NC_018868	CTGGG	2	10	57152	57161	0 %	20 %	60 %	20 %	410662649
36	NC_018868	TGGAC	2	10	58395	58404	20 %	20 %	40 %	20 %	410662650
37	NC_018868	GCTGA	2	10	59096	59105	20 %	20 %	40 %	20 %	410662651
38	NC_018868	ATCGC	2	10	59315	59324	20 %	20 %	20 %	40 %	410662651
39	NC_018868	AGCGC	2	10	69870	69879	20 %	0 %	40 %	40 %	410662660
40	NC_018868	AATCG	2	10	70441	70450	40 %	20 %	20 %	20 %	410662660
41	NC_018868	AAATC	2	10	71271	71280	60 %	20 %	0 %	20 %	410662660
42	NC_018868	CGATG	2	10	71425	71434	20 %	20 %	40 %	20 %	410662660
43	NC_018868	TTCAG	2	10	73407	73416	20 %	40 %	20 %	20 %	410662661
44	NC_018868	TGGTG	2	10	74452	74461	0 %	40 %	60 %	0 %	410662662
45	NC_018868	GCGCC	2	10	74902	74911	0 %	0 %	40 %	60 %	410662662
46	NC_018868	GGCAG	2	10	77188	77197	20 %	0 %	60 %	20 %	410662665
47	NC_018868	CCTGG	2	10	77935	77944	0 %	20 %	40 %	40 %	410662666
48	NC_018868	GCACG	2	10	79744	79753	20 %	0 %	40 %	40 %	410662668
49	NC_018868	CTGAT	2	10	81309	81318	20 %	40 %	20 %	20 %	410662669
50	NC_018868	TGAGC	2	10	81361	81370	20 %	20 %	40 %	20 %	410662669
51	NC_018868	TCAAC	2	10	81855	81864	40 %	20 %	0 %	40 %	410662670
52	NC_018868	TGCAT	2	10	82310	82319	20 %	40 %	20 %	20 %	410662670
53	NC_018868	CGAGA	2	10	89228	89237	40 %	0 %	40 %	20 %	410662676
54	NC_018868	AAATC	2	10	92148	92157	60 %	20 %	0 %	20 %	410662679
55	NC_018868	TCAGT	2	10	94480	94489	20 %	40 %	20 %	20 %	410662682
56	NC_018868	GCCAG	2	10	96288	96297	20 %	0 %	40 %	40 %	410662684
57	NC_018868	GGCCA	2	10	98715	98724	20 %	0 %	40 %	40 %	410662685
58	NC_018868	CTGCG	2	10	100867	100876	0 %	20 %	40 %	40 %	410662687
59	NC_018868	AGTGG	2	10	103633	103642	20 %	20 %	60 %	0 %	511767230
60	NC_018868	TGCAT	2	10	107273	107282	20 %	40 %	20 %	20 %	410662693
61	NC_018868	TTCAG	2	10	107591	107600	20 %	40 %	20 %	20 %	410662693
62	NC_018868	GGGGC	2	10	109541	109550	0 %	0 %	80 %	20 %	410662696
63	NC_018868	AGGCG	2	10	114267	114276	20 %	0 %	60 %	20 %	511767231
64	NC_018868	TTATA	2	10	114654	114663	40 %	60 %	0 %	0 %	511767231
65	NC_018868	CTGCA	2	10	121178	121187	20 %	20 %	20 %	40 %	410662704
66	NC_018868	AGGCG	2	10	122751	122760	20 %	0 %	60 %	20 %	410662706
67	NC_018868	GATTC	2	10	123374	123383	20 %	40 %	20 %	20 %	410662707
68	NC_018868	CGGTG	2	10	125125	125134	0 %	20 %	60 %	20 %	410662708
69	NC_018868	CCTTA	2	10	128325	128334	20 %	40 %	0 %	40 %	410662711
70	NC_018868	GTTAT	2	10	131491	131500	20 %	60 %	20 %	0 %	410662712
71	NC_018868	TCCGA	2	10	134194	134203	20 %	20 %	20 %	40 %	410662715
72	NC_018868	AGCCC	2	10	137337	137346	20 %	0 %	20 %	60 %	410662718
73	NC_018868	CCGGC	2	10	138591	138600	0 %	0 %	40 %	60 %	410662720
74	NC_018868	AGGCC	2	10	143839	143848	20 %	0 %	40 %	40 %	410662724
75	NC_018868	TTGGT	2	10	148650	148659	0 %	60 %	40 %	0 %	511767236
76	NC_018868	GAAAA	2	10	149120	149129	80 %	0 %	20 %	0 %	511767236
77	NC_018868	AACTG	2	10	149722	149731	40 %	20 %	20 %	20 %	410662729
78	NC_018868	TCTGC	2	10	151117	151126	0 %	40 %	20 %	40 %	410662731
79	NC_018868	GGCAA	2	10	153339	153348	40 %	0 %	40 %	20 %	410662735
80	NC_018868	GAAAT	2	10	153741	153750	60 %	20 %	20 %	0 %	410662735
81	NC_018868	CCGAG	2	10	154877	154886	20 %	0 %	40 %	40 %	410662736
82	NC_018868	AAATC	2	10	156077	156086	60 %	20 %	0 %	20 %	410662738
83	NC_018868	CGTGG	2	10	157001	157010	0 %	20 %	60 %	20 %	410662739
84	NC_018868	TCCGT	2	10	158646	158655	0 %	40 %	20 %	40 %	511767238
85	NC_018868	CCGTG	2	10	158793	158802	0 %	20 %	40 %	40 %	511767238
86	NC_018868	AATCC	2	10	159410	159419	40 %	20 %	0 %	40 %	511767238
87	NC_018868	GGCAA	2	10	159556	159565	40 %	0 %	40 %	20 %	511767238
88	NC_018868	GCAGG	2	10	160908	160917	20 %	0 %	60 %	20 %	410662743
89	NC_018868	GGTAG	2	10	165418	165427	20 %	20 %	60 %	0 %	511767240
90	NC_018868	GGCCT	2	10	167637	167646	0 %	20 %	40 %	40 %	410662749
91	NC_018868	TGGGT	2	10	168304	168313	0 %	40 %	60 %	0 %	410662749
92	NC_018868	ATGGC	2	10	171862	171871	20 %	20 %	40 %	20 %	410662752
93	NC_018868	GGCTG	2	10	173118	173127	0 %	20 %	60 %	20 %	410662753
94	NC_018868	CGCGA	2	10	173191	173200	20 %	0 %	40 %	40 %	410662753
95	NC_018868	GCAGC	2	10	174804	174813	20 %	0 %	40 %	40 %	511767241
96	NC_018868	TGTGG	2	10	178602	178611	0 %	40 %	60 %	0 %	410662757
97	NC_018868	TTTCA	2	10	181203	181212	20 %	60 %	0 %	20 %	410662760
98	NC_018868	GGTCG	2	10	187125	187134	0 %	20 %	60 %	20 %	410662767
99	NC_018868	GGTCG	2	10	188117	188126	0 %	20 %	60 %	20 %	410662768
100	NC_018868	GGTGG	2	10	188359	188368	0 %	20 %	80 %	0 %	410662768
101	NC_018868	GGGTT	2	10	190331	190340	0 %	40 %	60 %	0 %	511767242
102	NC_018868	GGCAG	2	10	190937	190946	20 %	0 %	60 %	20 %	410662770
103	NC_018868	GGGCG	2	10	194629	194638	0 %	0 %	80 %	20 %	410662774
104	NC_018868	GCGAC	2	10	199825	199834	20 %	0 %	40 %	40 %	410662778
105	NC_018868	TCCGG	2	10	200595	200604	0 %	20 %	40 %	40 %	410662778
106	NC_018868	GCAGG	2	10	201332	201341	20 %	0 %	60 %	20 %	410662779
107	NC_018868	GTACT	2	10	202003	202012	20 %	40 %	20 %	20 %	511767246
108	NC_018868	ATCCA	2	10	202453	202462	40 %	20 %	0 %	40 %	511767246
109	NC_018868	GCTGC	2	10	209949	209958	0 %	20 %	40 %	40 %	511767249
110	NC_018868	ACGGC	2	10	214177	214186	20 %	0 %	40 %	40 %	410662793
111	NC_018868	CGACC	2	10	214929	214938	20 %	0 %	20 %	60 %	410662794
112	NC_018868	CGAAC	2	10	218596	218605	40 %	0 %	20 %	40 %	410662796
113	NC_018868	CCGGC	2	10	218930	218939	0 %	0 %	40 %	60 %	410662796
114	NC_018868	GCTGT	2	10	219464	219473	0 %	40 %	40 %	20 %	410662797
115	NC_018868	GACTC	2	10	220167	220176	20 %	20 %	20 %	40 %	410662798
116	NC_018868	CCGGT	2	10	222772	222781	0 %	20 %	40 %	40 %	511767251
117	NC_018868	ATGAA	2	10	230004	230013	60 %	20 %	20 %	0 %	410662802
118	NC_018868	TGGCA	2	10	233500	233509	20 %	20 %	40 %	20 %	410662804
119	NC_018868	GCGAT	2	10	234501	234510	20 %	20 %	40 %	20 %	410662804
120	NC_018868	AGTCC	2	10	237043	237052	20 %	20 %	20 %	40 %	410662806
121	NC_018868	GGTCA	2	10	239685	239694	20 %	20 %	40 %	20 %	410662808
122	NC_018868	GCCTG	2	10	243868	243877	0 %	20 %	40 %	40 %	410662812
123	NC_018868	ACCCG	2	10	247592	247601	20 %	0 %	20 %	60 %	410662815
124	NC_018868	ATTGA	2	10	247996	248005	40 %	40 %	20 %	0 %	410662816
125	NC_018868	GCAGG	2	10	249787	249796	20 %	0 %	60 %	20 %	410662817
126	NC_018868	GGCTT	2	10	249950	249959	0 %	40 %	40 %	20 %	410662817
127	NC_018868	CTGCC	2	10	251952	251961	0 %	20 %	20 %	60 %	410662818
128	NC_018868	TGATT	2	10	256178	256187	20 %	60 %	20 %	0 %	410662825
129	NC_018868	GGCGG	2	10	258379	258388	0 %	0 %	80 %	20 %	410662828
130	NC_018868	CTGGT	2	10	260425	260434	0 %	40 %	40 %	20 %	410662830
131	NC_018868	AGCTG	2	10	262405	262414	20 %	20 %	40 %	20 %	410662831
132	NC_018868	GGATT	2	10	266076	266085	20 %	40 %	40 %	0 %	410662833
133	NC_018868	CGGCG	2	10	267756	267765	0 %	0 %	60 %	40 %	410662834
134	NC_018868	TGGTG	2	10	267939	267948	0 %	40 %	60 %	0 %	410662834
135	NC_018868	CCACC	2	10	271175	271184	20 %	0 %	0 %	80 %	511767255
136	NC_018868	TGATT	2	10	271883	271892	20 %	60 %	20 %	0 %	511767255
137	NC_018868	GGGCC	2	10	274350	274359	0 %	0 %	60 %	40 %	410662840
138	NC_018868	TGAAA	2	10	282533	282542	60 %	20 %	20 %	0 %	410662849
139	NC_018868	AAGCC	2	10	283153	283162	40 %	0 %	20 %	40 %	410662849
140	NC_018868	GGGGC	2	10	283669	283678	0 %	0 %	80 %	20 %	410662850
141	NC_018868	GGGCT	2	10	283922	283931	0 %	20 %	60 %	20 %	410662850
142	NC_018868	ATTGG	2	10	284192	284201	20 %	40 %	40 %	0 %	410662851
143	NC_018868	AATTG	2	10	285351	285360	40 %	40 %	20 %	0 %	410662852
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145	NC_018868	CTGGA	2	10	287679	287688	20 %	20 %	40 %	20 %	511767258
146	NC_018868	GCCGC	2	10	288740	288749	0 %	0 %	40 %	60 %	410662854
147	NC_018868	CGGGG	2	10	297474	297483	0 %	0 %	80 %	20 %	511767259
148	NC_018868	ACTGG	2	10	298146	298155	20 %	20 %	40 %	20 %	511767259
149	NC_018868	ATCTG	2	10	299844	299853	20 %	40 %	20 %	20 %	410662863
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151	NC_018868	GCTCT	2	10	305728	305737	0 %	40 %	20 %	40 %	511767260
152	NC_018868	CGGGT	2	10	307395	307404	0 %	20 %	60 %	20 %	410662870
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154	NC_018868	TTTGG	2	10	309633	309642	0 %	60 %	40 %	0 %	410662872
155	NC_018868	GTGTT	2	10	310143	310152	0 %	60 %	40 %	0 %	410662872
156	NC_018868	GGTGG	2	10	311135	311144	0 %	20 %	80 %	0 %	410662872
157	NC_018868	GCGCC	2	10	311370	311379	0 %	0 %	40 %	60 %	410662873
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159	NC_018868	CCTGG	2	10	314756	314765	0 %	20 %	40 %	40 %	410662878
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168	NC_018868	TTGAT	2	10	326245	326254	20 %	60 %	20 %	0 %	410662887
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172	NC_018868	GGATT	2	10	334866	334875	20 %	40 %	40 %	0 %	410662893
173	NC_018868	GTTGC	2	10	335234	335243	0 %	40 %	40 %	20 %	410662893
174	NC_018868	GGGCA	2	10	335280	335289	20 %	0 %	60 %	20 %	410662893
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187	NC_018868	CCCAG	2	10	352673	352682	20 %	0 %	20 %	60 %	410662907
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201	NC_018868	TTCGG	2	10	372319	372328	0 %	40 %	40 %	20 %	511767266
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249	NC_018868	GGAAC	2	10	457546	457555	40 %	0 %	40 %	20 %	410662980
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252	NC_018868	GCAGG	2	10	467179	467188	20 %	0 %	60 %	20 %	410662989
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254	NC_018868	CACTG	2	10	469577	469586	20 %	20 %	20 %	40 %	410662991
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258	NC_018868	ATTGC	2	10	486723	486732	20 %	40 %	20 %	20 %	511767279
259	NC_018868	GCCAG	2	10	487082	487091	20 %	0 %	40 %	40 %	511767279
260	NC_018868	TGCGC	2	10	491494	491503	0 %	20 %	40 %	40 %	410663014
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263	NC_018868	GTCAT	2	10	498561	498570	20 %	40 %	20 %	20 %	410663022
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376	NC_018868	ACCTG	2	10	718770	718779	20 %	20 %	20 %	40 %	410663221
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381	NC_018868	TACCA	2	10	728723	728732	40 %	20 %	0 %	40 %	410663229
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383	NC_018868	AAAGT	2	10	729138	729147	60 %	20 %	20 %	0 %	410663230
384	NC_018868	CCTTG	2	10	730563	730572	0 %	40 %	20 %	40 %	410663231
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387	NC_018868	CCCCT	2	10	735654	735663	0 %	20 %	0 %	80 %	410663235
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389	NC_018868	GGCGA	2	10	742502	742511	20 %	0 %	60 %	20 %	410663241
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391	NC_018868	TGCAC	2	10	746303	746312	20 %	20 %	20 %	40 %	410663245
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496	NC_018868	CGCGG	2	10	926321	926330	0 %	0 %	60 %	40 %	410663420
497	NC_018868	GACAT	2	10	926937	926946	40 %	20 %	20 %	20 %	410663421
498	NC_018868	GGCAC	2	10	928007	928016	20 %	0 %	40 %	40 %	410663423
499	NC_018868	GACAA	2	10	932384	932393	60 %	0 %	20 %	20 %	410663428
500	NC_018868	CGGTT	2	10	933675	933684	0 %	40 %	40 %	20 %	410663430

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