MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 1429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018867	CAGA	2	8	1440	1447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018867	GCCA	2	8	4131	4138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018867	TGAA	2	8	4204	4211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018867	GGGA	2	8	4254	4261	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018867	TTGT	2	8	11561	11568	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018867	ATTT	2	8	17163	17170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018867	TTTA	2	8	18081	18088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018867	CCTG	2	8	63496	63503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018867	TCAC	2	8	69326	69333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018867	GAAA	2	8	69470	69477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018867	TGAA	2	8	70869	70876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018867	TCAA	2	8	71230	71237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018867	ATTT	2	8	71291	71298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018867	CAAG	2	8	72116	72123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018867	ATTC	2	8	72347	72354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018867	AATA	2	8	73279	73286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018867	TATC	2	8	74206	74213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018867	GAAG	2	8	74699	74706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018867	GATA	2	8	78491	78498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018867	ATCA	2	8	79074	79081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018867	TCAA	2	8	80821	80828	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018867	ACCA	2	8	81178	81185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018867	TAGG	2	8	83515	83522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018867	TTTA	2	8	83548	83555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018867	AACC	2	8	85646	85653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018867	CTTT	2	8	87237	87244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018867	TAAT	2	8	87377	87384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018867	ACTT	2	8	89801	89808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018867	ATCA	2	8	92214	92221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018867	TAAA	2	8	92379	92386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018867	CTTT	2	8	92515	92522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018867	ATCT	2	8	98324	98331	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018867	AGAA	2	8	99672	99679	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018867	ATTT	2	8	100979	100986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018867	AGCG	2	8	102384	102391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018867	TTTC	2	8	103231	103238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018867	AAAG	2	8	103468	103475	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018867	AAGA	2	8	103613	103620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018867	CCAT	2	8	104689	104696	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018867	TCAA	2	8	104718	104725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018867	ATCT	2	8	112861	112868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018867	TCCT	2	8	116843	116850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018867	CATT	2	8	124505	124512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018867	TGCT	2	8	124727	124734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018867	TCCT	2	8	135165	135172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018867	ATGG	2	8	136303	136310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018867	CAAA	2	8	136653	136660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018867	GCTT	2	8	138727	138734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018867	ATTC	2	8	138815	138822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018867	CATG	2	8	139439	139446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018867	TTAA	2	8	140469	140476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018867	ACAA	2	8	140512	140519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018867	TAAA	2	8	141049	141056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018867	CAGC	2	8	141156	141163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018867	GCAC	2	8	141398	141405	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018867	AGCT	2	8	141451	141458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018867	AATA	2	8	141530	141537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018867	AGAA	2	8	141869	141876	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018867	ATTT	2	8	142390	142397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018867	TGGA	2	8	142515	142522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018867	TTTC	2	8	142561	142568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018867	TCAC	2	8	142633	142640	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018867	ACGG	2	8	143139	143146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018867	GAAA	2	8	143162	143169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018867	TTAA	2	8	143766	143773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018867	CCAA	2	8	144110	144117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018867	CCTT	2	8	144193	144200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018867	GTAG	2	8	144447	144454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018867	GGAA	2	8	148452	148459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018867	ACAG	2	8	150566	150573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018867	AGGC	2	8	150866	150873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018867	GTTT	2	8	161955	161962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018867	AATT	2	8	162755	162762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018867	TCTG	2	8	163093	163100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018867	TTGG	2	8	164632	164639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018867	CGGT	2	8	165185	165192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018867	AACC	2	8	165202	165209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018867	ATGA	2	8	165381	165388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018867	TGAG	2	8	165430	165437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018867	AATG	2	8	165472	165479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018867	TTTA	2	8	173144	173151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018867	TTGA	2	8	184645	184652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018867	TAAA	2	8	199387	199394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018867	ATTT	2	8	201253	201260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018867	AAAC	2	8	203177	203184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018867	TTGA	2	8	203557	203564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018867	TGAT	2	8	207600	207607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018867	ACGA	2	8	211658	211665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018867	AAAT	2	8	213655	213662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018867	ATTT	2	8	213679	213686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018867	GATA	2	8	213808	213815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018867	TCAG	2	8	216291	216298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018867	ATCG	2	8	219030	219037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018867	GAGG	2	8	225962	225969	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018867	ATTA	2	8	227470	227477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018867	AGTG	2	8	233488	233495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018867	AATA	2	8	233654	233661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018867	GGGT	2	8	235469	235476	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018867	TAAA	2	8	237210	237217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018867	TGTC	2	8	240950	240957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018867	AAAG	2	8	240966	240973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018867	GTAG	2	8	249648	249655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018867	TAAA	2	8	251322	251329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018867	ATAA	2	8	256910	256917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018867	ATAA	2	8	258997	259004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018867	TATT	2	8	268767	268774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018867	CTTT	2	8	268777	268784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018867	AGTT	2	8	268985	268992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018867	TTTA	2	8	272674	272681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018867	GAAA	2	8	272709	272716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018867	AACA	2	8	272717	272724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018867	TAAA	2	8	276557	276564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018867	TATT	2	8	281631	281638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018867	CAAA	2	8	281648	281655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018867	TAAA	2	8	281696	281703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018867	CGAA	2	8	284519	284526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018867	GCTT	2	8	287176	287183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018867	AACG	2	8	299357	299364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018867	ATTT	2	8	300693	300700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018867	TATT	2	8	300701	300708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018867	TTAT	2	8	300709	300716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018867	TGTA	2	8	303357	303364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018867	AGTT	2	8	310029	310036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018867	CATC	2	8	310859	310866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018867	TTTA	2	8	311014	311021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018867	ATTA	2	8	312391	312398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018867	CTTG	2	8	314060	314067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018867	AATT	2	8	316913	316920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018867	ATGG	2	8	317094	317101	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018867	AAAT	2	8	320409	320416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018867	TCCC	3	12	321690	321701	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_018867	TAAA	2	8	331432	331439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018867	CATC	2	8	331543	331550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018867	GCCA	2	8	334782	334789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018867	TTGA	2	8	334825	334832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018867	TATT	3	12	340455	340466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018867	TATT	2	8	343318	343325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018867	GATT	2	8	350212	350219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018867	ATTA	2	8	354309	354316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018867	AGGG	2	8	365750	365757	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018867	GTTC	2	8	366266	366273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018867	TTAA	2	8	368040	368047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018867	GAAT	2	8	368230	368237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018867	AGCA	2	8	368405	368412	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018867	GCGA	2	8	368427	368434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018867	TGAG	2	8	368471	368478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018867	TAGA	2	8	369571	369578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018867	AGCC	2	8	369877	369884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018867	GACT	2	8	370037	370044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018867	ATTT	2	8	370067	370074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018867	CATA	2	8	370139	370146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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