MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalobacter sp. DCA chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018866	GCAAGT	2	12	4072	4083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018866	GGAATA	2	12	56843	56854	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018866	TAAAAG	2	12	96979	96990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018866	TATTCC	2	12	97738	97749	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018866	GCGGAA	2	12	118057	118068	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018866	TTTGGT	2	12	126845	126856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018866	AGATGA	2	12	173330	173341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018866	AGAAAA	2	12	197105	197116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018866	TAAAAA	2	12	283194	283205	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018866	AAGCGA	2	12	305656	305667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018866	CGCAGG	2	12	307779	307790	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018866	ATTGCA	2	12	310910	310921	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018866	ATTCTT	2	12	338872	338883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018866	ATTAAG	2	12	386252	386263	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018866	GTTTAA	2	12	415715	415726	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018866	TGGAAA	2	12	428428	428439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018866	CACAGA	2	12	433297	433308	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018866	GACGGT	2	12	452191	452202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018866	TGCCTG	2	12	483700	483711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018866	ACGTAT	2	12	494393	494404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018866	CCGTTT	2	12	500523	500534	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018866	CTGCTA	2	12	504506	504517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018866	TATTTT	2	12	506370	506381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018866	CGTTAA	2	12	550785	550796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018866	AAACTT	2	12	561792	561803	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018866	CGAAAA	2	12	605960	605971	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018866	TTGTAT	2	12	619311	619322	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018866	TAACGA	2	12	619597	619608	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018866	AAGTAA	2	12	621126	621137	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018866	AATATA	2	12	621968	621979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018866	TTTCTC	2	12	623209	623220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018866	GCCCAA	2	12	624118	624129	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018866	TCTATG	2	12	697284	697295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018866	GCTTTC	2	12	715453	715464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018866	AACGTA	2	12	750302	750313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018866	ATTTAT	2	12	768845	768856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018866	TATCCT	2	12	775487	775498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018866	AACAAA	2	12	808257	808268	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018866	ATTTGA	2	12	808386	808397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018866	AATTAA	2	12	975467	975478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018866	CATTGC	2	12	1005669	1005680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018866	TTAATT	2	12	1005685	1005696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018866	TAAAAA	2	12	1021469	1021480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018866	TTATAT	2	12	1033516	1033527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018866	TCTTTA	2	12	1107610	1107621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018866	AAAATA	2	12	1149219	1149230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018866	TTGTCT	2	12	1166901	1166912	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018866	AAAAGT	2	12	1180264	1180275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018866	CAGAAA	2	12	1183872	1183883	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018866	CTTTTC	2	12	1187888	1187899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018866	CTTTTT	2	12	1191411	1191422	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018866	GTACAT	2	12	1203650	1203661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018866	GGGAAG	2	12	1219127	1219138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018866	TCCCCC	2	12	1219143	1219154	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
55	NC_018866	TTTTTC	2	12	1220967	1220978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018866	TATACA	2	12	1233034	1233045	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018866	TAAAAC	2	12	1252059	1252070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018866	CCTTCC	2	12	1255954	1255965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018866	AAACAA	2	12	1256108	1256119	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018866	ATCTAC	2	12	1278842	1278853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018866	GCGCTT	2	12	1285515	1285526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018866	GTTTGA	2	12	1303419	1303430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018866	TTTCCT	2	12	1336200	1336211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018866	TAGTGA	2	12	1375669	1375680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018866	GTCAGC	2	12	1460019	1460030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018866	ATTCCT	5	30	1581698	1581727	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018866	TTCAAA	2	12	1614588	1614599	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018866	CATTTT	2	12	1650575	1650586	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018866	TGGAAA	2	12	1681831	1681842	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018866	CAATTT	2	12	1719080	1719091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018866	ATTCGG	2	12	1721112	1721123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018866	TGATTA	2	12	1739455	1739466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018866	TTAACG	2	12	1767931	1767942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018866	GATAAT	2	12	1775477	1775488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018866	GTCGTT	2	12	1786259	1786270	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018866	TGTTTT	2	12	1838385	1838396	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018866	TCTGTG	2	12	1872417	1872428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018866	ATAATT	2	12	1910159	1910170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018866	CCTGCG	2	12	1956422	1956433	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018866	TCGCTT	2	12	1958545	1958556	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018866	ATCTAA	2	12	1959751	1959762	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018866	AGTAAG	2	12	1972142	1972153	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018866	ATAAGA	2	12	1973464	1973475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018866	CGGCTC	2	12	1988498	1988509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018866	TCTTAT	2	12	2013709	2013720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018866	TTTGTT	2	12	2031898	2031909	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018866	ATACAT	2	12	2038691	2038702	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018866	TGTGGT	2	12	2049112	2049123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018866	CCTGCG	2	12	2059052	2059063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018866	TCGCTT	2	12	2061175	2061186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018866	TAAAAC	2	12	2087908	2087919	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018866	TGATTG	2	12	2175311	2175322	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018866	AATTTG	2	12	2193163	2193174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018866	GCCGAA	2	12	2201103	2201114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018866	ATTTGC	2	12	2203455	2203466	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018866	TTGATT	2	12	2254254	2254265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018866	TTTGCA	2	12	2258046	2258057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018866	AGAGTC	2	12	2258181	2258192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018866	TTTCTT	2	12	2349753	2349764	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018866	TAAGAA	2	12	2351753	2351764	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018866	AGAAAT	2	12	2396186	2396197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018866	AATTAA	2	12	2403344	2403355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018866	AAAAAT	2	12	2428447	2428458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018866	ATTTGT	2	12	2433220	2433231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018866	TTGATG	2	12	2452888	2452899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018866	TGATGT	2	12	2462422	2462433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018866	CCCTAT	2	12	2466337	2466348	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018866	TGTTAA	2	12	2509369	2509380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018866	TAAATA	2	12	2555621	2555632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018866	ATCTTC	2	12	2558468	2558479	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018866	CTACAA	2	12	2572980	2572991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018866	ACGGCG	2	12	2602368	2602379	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018866	TTTAAT	2	12	2629587	2629598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018866	TCCCAG	2	12	2634894	2634905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018866	AAATAA	2	12	2655688	2655699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018866	GCAGGA	2	12	2674109	2674120	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018866	AGGATA	2	12	2674359	2674370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018866	TTTTTG	2	12	2688571	2688582	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018866	TCTATT	2	12	2702297	2702308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018866	CCCTAT	2	12	2722840	2722851	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018866	TGTATT	2	12	2733501	2733512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018866	CTCAGG	2	12	2788067	2788078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018866	TTTTTG	2	12	2788476	2788487	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018866	CAAAAA	2	12	2825145	2825156	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018866	TAATGA	2	12	2831439	2831450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018866	CCATAA	2	12	2838917	2838928	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018866	TCATTC	2	12	2885993	2886004	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018866	CAAAAT	2	12	2889261	2889272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018866	TAATTT	2	12	2894455	2894466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018866	TATTTT	2	12	2894622	2894633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018866	TCTTAT	6	36	2995007	2995042	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_018866	AGGTGT	2	12	3015398	3015409	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018866	ATCGTA	2	12	3042778	3042789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018866	CAAAAA	2	12	3045472	3045483	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_018866	TGATTT	2	12	3059980	3059991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.