MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalobacter sp. DCA chromosome

Total Repeats: 443

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018866	TTTAT	2	10	1352	1361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018866	GCGGA	2	10	11838	11847	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018866	CGCAC	2	10	12637	12646	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_018866	TCAAG	2	10	14106	14115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018866	TTCCG	2	10	14214	14223	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018866	GTTAA	2	10	16194	16203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018866	ATGTT	2	10	16268	16277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018866	ATTTG	2	10	16739	16748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018866	TCTGC	2	10	20975	20984	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018866	GAAAA	2	10	57002	57011	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018866	GAGGG	2	10	70974	70983	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018866	TATAA	2	10	75712	75721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018866	GCTTT	2	10	78662	78671	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018866	CTTTT	2	10	85075	85084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018866	TTGGA	2	10	85281	85290	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018866	CAAAA	2	10	96415	96424	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018866	ATTTT	2	10	97463	97472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018866	CTTTT	2	10	97581	97590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018866	GAGGG	2	10	118210	118219	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018866	GAAGG	2	10	126578	126587	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018866	CTCAC	2	10	131255	131264	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_018866	ATATA	2	10	134191	134200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018866	AGAGA	2	10	137634	137643	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018866	ATCAT	2	10	137775	137784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018866	GATAA	2	10	147655	147664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018866	AAATA	2	10	151597	151606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018866	ACATA	2	10	151628	151637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018866	ATTAT	2	10	151668	151677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018866	CATTT	2	10	152725	152734	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018866	TTATT	2	10	152903	152912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018866	GCTAA	3	15	158665	158679	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018866	ATATA	2	10	162956	162965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018866	ATATA	2	10	171593	171602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018866	GAAAA	2	10	173434	173443	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018866	TGGAT	2	10	175086	175095	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018866	AAGGT	2	10	175097	175106	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018866	GAGCG	2	10	180914	180923	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018866	AATTA	2	10	182630	182639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018866	TAAAA	2	10	211361	211370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018866	GTTAT	2	10	237785	237794	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018866	ATAAG	2	10	242431	242440	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018866	ATATG	2	10	242642	242651	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018866	TTTTA	2	10	245434	245443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018866	CTTAG	2	10	251646	251655	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018866	AATAA	2	10	254995	255004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018866	TTGGA	2	10	269994	270003	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018866	GTTTT	2	10	287314	287323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018866	GATCG	2	10	291055	291064	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018866	TATTT	2	10	300184	300193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018866	TCGTG	2	10	303996	304005	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018866	GAAGC	2	10	304182	304191	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018866	GGGAG	2	10	305519	305528	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018866	AAGCA	2	10	306323	306332	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018866	TTGAA	2	10	307039	307048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018866	GACAG	2	10	307206	307215	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018866	GGCAA	2	10	310962	310971	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018866	TAAAA	2	10	322511	322520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018866	TTAAA	2	10	322521	322530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018866	GATAA	2	10	323366	323375	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018866	ATTAC	2	10	339019	339028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018866	TTTAT	2	10	352792	352801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018866	TTCTT	2	10	357271	357280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018866	TAGGT	2	10	358844	358853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018866	CAGGA	2	10	360423	360432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018866	AATTA	2	10	367687	367696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018866	TAAAC	2	10	371814	371823	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018866	CTTGT	2	10	382129	382138	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018866	CTTTG	2	10	386342	386351	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018866	TGTCA	2	10	386396	386405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018866	TTATA	2	10	387126	387135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018866	TGTTT	2	10	387681	387690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018866	TTTTC	2	10	401710	401719	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018866	GCATG	2	10	403338	403347	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018866	GTTAT	2	10	408929	408938	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018866	AAGGA	2	10	411710	411719	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018866	TGCGT	2	10	412093	412102	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018866	GAAAA	2	10	420297	420306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018866	CATCT	2	10	431592	431601	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_018866	TAAGT	2	10	431649	431658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018866	GTAAA	2	10	432476	432485	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018866	ATTTA	2	10	434247	434256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018866	ATATA	2	10	446754	446763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018866	GGATT	2	10	467119	467128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018866	TCTAT	2	10	468663	468672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018866	GTCTG	2	10	469374	469383	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018866	CAGCG	2	10	473621	473630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_018866	CTCAT	2	10	475528	475537	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018866	AACAT	2	10	476186	476195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018866	ATATG	2	10	483266	483275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018866	AAATA	2	10	483331	483340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018866	TCAAA	2	10	489044	489053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018866	TCTTT	2	10	489704	489713	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018866	ATATA	2	10	491690	491699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018866	GAAAA	2	10	501657	501666	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018866	ATATT	2	10	502664	502673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018866	CGTTC	2	10	527758	527767	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_018866	CAAAG	2	10	527786	527795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018866	TAAAA	2	10	532506	532515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018866	TGAAA	2	10	533287	533296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018866	TCTTT	2	10	536180	536189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018866	AATTG	2	10	540945	540954	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018866	CAGTT	2	10	546037	546046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018866	AAATC	2	10	549567	549576	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018866	AAAAC	2	10	564234	564243	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018866	AATAA	2	10	568303	568312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018866	AGGAA	2	10	586355	586364	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018866	AAGGA	2	10	588426	588435	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018866	CAAAA	2	10	593950	593959	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018866	AATTT	2	10	611501	611510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018866	GAACA	2	10	613710	613719	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018866	AAATA	2	10	613725	613734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018866	GGAAC	2	10	617047	617056	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018866	CTGTT	2	10	621668	621677	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018866	TTTAT	2	10	622203	622212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018866	AAAAT	2	10	622260	622269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018866	TTCAA	2	10	629773	629782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018866	ATGTT	2	10	632575	632584	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018866	GAAAA	2	10	632612	632621	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018866	TCCCC	2	10	634459	634468	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_018866	TGACT	2	10	636605	636614	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018866	TCCTT	2	10	643740	643749	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018866	CAGAT	2	10	683210	683219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018866	TGTTA	2	10	695160	695169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018866	GTCCT	2	10	704951	704960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_018866	TTAAG	2	10	706552	706561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018866	ATATC	2	10	720784	720793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018866	TCCAG	2	10	755294	755303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_018866	TTACT	2	10	755410	755419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018866	AATTT	2	10	756972	756981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018866	TAATG	2	10	757048	757057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018866	CTTTC	2	10	777811	777820	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_018866	TATGA	2	10	789646	789655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018866	CTTTT	2	10	791604	791613	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018866	GTATT	2	10	800610	800619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018866	CTCTG	2	10	810456	810465	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_018866	CTCTT	2	10	822858	822867	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018866	AACCA	2	10	822890	822899	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_018866	TCATT	2	10	824169	824178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_018866	AGTAA	2	10	862728	862737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018866	ATTGT	2	10	865640	865649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018866	AATTA	2	10	873696	873705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018866	AATTG	2	10	873706	873715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018866	TCAGT	2	10	889066	889075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018866	TTCAT	2	10	893030	893039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018866	TTTTA	2	10	906234	906243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018866	AGGTA	2	10	935956	935965	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018866	ATTTC	2	10	940039	940048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_018866	AATGG	2	10	940248	940257	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018866	ATTAA	2	10	940482	940491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018866	GTTGT	2	10	942218	942227	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_018866	CAATT	2	10	1007844	1007853	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_018866	TATTT	2	10	1936498	1936507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018866	ATTTA	2	10	1938251	1938260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_018866	TTCCT	2	10	2916565	2916574	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
427	NC_018866	TCCTC	2	10	2917770	2917779	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
428	NC_018866	TAAAA	2	10	2917799	2917808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_018866	TTTCT	2	10	2917900	2917909	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
430	NC_018866	AATAT	2	10	2927117	2927126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_018866	ATCTT	2	10	2930191	2930200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
432	NC_018866	ACTTT	2	10	2944577	2944586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_018866	TTCAC	2	10	2951979	2951988	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
434	NC_018866	TTCTT	2	10	2955821	2955830	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
435	NC_018866	ACTTT	2	10	2961259	2961268	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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439	NC_018866	CTTAG	2	10	2995272	2995281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
440	NC_018866	TATCC	2	10	2998979	2998988	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
441	NC_018866	GAAAT	2	10	3053872	3053881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
442	NC_018866	TCCAA	2	10	3057459	3057468	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
443	NC_018866	AATAT	2	10	3069720	3069729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.