MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalobacter sp. DCA chromosome

Total Repeats: 1442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018866	CAGA	2	8	1440	1447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018866	GCCA	2	8	4131	4138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018866	TGAA	2	8	4204	4211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018866	GGGA	2	8	4254	4261	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018866	TTGT	2	8	11561	11568	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018866	TGGC	2	8	13475	13482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018866	CATT	2	8	13976	13983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018866	ATTT	2	8	15002	15009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018866	TTTA	2	8	15920	15927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018866	TAGG	2	8	16989	16996	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018866	TTTA	2	8	17022	17029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018866	AACC	2	8	19120	19127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018866	CTTT	2	8	20711	20718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018866	TAAT	2	8	20851	20858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018866	ACTT	2	8	23275	23282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018866	ATCA	2	8	25688	25695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018866	TAAA	2	8	25853	25860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018866	CTTT	2	8	25989	25996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018866	ATCT	2	8	31798	31805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018866	AGCG	2	8	34588	34595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018866	TTTC	2	8	35435	35442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018866	AAGA	2	8	35817	35824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018866	CCAT	2	8	36893	36900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018866	TCAA	2	8	36922	36929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018866	ATCT	2	8	45065	45072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018866	TCCT	2	8	49047	49054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018866	CATT	2	8	56709	56716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018866	TGCT	2	8	56931	56938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018866	TCCT	2	8	69538	69545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018866	ATGG	2	8	70676	70683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018866	CAAA	2	8	71026	71033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018866	GCTT	2	8	73100	73107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018866	ATTC	2	8	73188	73195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018866	TGCA	2	8	73413	73420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018866	TTTC	2	8	73492	73499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018866	TAAT	2	8	73514	73521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018866	CATG	2	8	73812	73819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018866	TTAA	2	8	74842	74849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018866	ACAA	2	8	74885	74892	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018866	TAAA	2	8	75422	75429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018866	CAGC	2	8	75529	75536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018866	GCAC	2	8	75771	75778	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018866	AGCT	2	8	75824	75831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018866	AATA	2	8	75903	75910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018866	AGAA	2	8	76242	76249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018866	ATTT	2	8	76763	76770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018866	TGGA	2	8	76888	76895	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018866	TTTC	2	8	76934	76941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018866	TCAC	2	8	77006	77013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018866	ACGG	2	8	77512	77519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018866	GAAA	2	8	77535	77542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018866	TTAA	2	8	78139	78146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018866	CCAA	2	8	78483	78490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018866	CCTT	2	8	78566	78573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018866	GTAG	2	8	78820	78827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018866	GGAA	2	8	82825	82832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018866	ACAG	2	8	84939	84946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018866	AGGC	2	8	85239	85246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018866	GTTT	2	8	96328	96335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018866	AATT	2	8	97129	97136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018866	CGGT	2	8	97591	97598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018866	AACC	2	8	97608	97615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018866	ATGA	2	8	97787	97794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018866	TGAG	2	8	97836	97843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018866	AATG	2	8	97878	97885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018866	TTTA	2	8	105549	105556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018866	TTGA	2	8	117050	117057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018866	TAAA	2	8	131792	131799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018866	ATTT	2	8	133658	133665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018866	AAAC	2	8	135582	135589	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018866	TTGA	2	8	135962	135969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018866	GTAA	2	8	135980	135987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018866	TGAT	2	8	140005	140012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018866	ACGA	2	8	144063	144070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018866	AAAT	2	8	146060	146067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018866	ATTT	2	8	146084	146091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018866	GATA	2	8	146213	146220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018866	TCAG	2	8	148696	148703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018866	ATCG	2	8	151435	151442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018866	GAGG	2	8	158366	158373	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018866	ATTA	2	8	159874	159881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018866	AGTG	2	8	165892	165899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018866	GGGT	2	8	167873	167880	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018866	TAAA	2	8	169614	169621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018866	TAAA	2	8	171716	171723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018866	TGTC	2	8	175457	175464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018866	AAAG	2	8	175473	175480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018866	GTAG	2	8	184155	184162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018866	TAAA	2	8	185829	185836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018866	ATAA	2	8	191416	191423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018866	ATAA	2	8	193503	193510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018866	TATT	2	8	203273	203280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018866	CTTT	2	8	203283	203290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018866	AGTT	2	8	203491	203498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018866	TTTA	2	8	207180	207187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018866	GAAA	2	8	207215	207222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018866	AACA	2	8	207223	207230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018866	TAAA	2	8	211063	211070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018866	CGAA	2	8	219025	219032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018866	GCTT	2	8	221682	221689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018866	AACG	2	8	233863	233870	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018866	ATTT	2	8	235199	235206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018866	TATT	2	8	235207	235214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018866	TTAT	2	8	235215	235222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018866	TGTA	2	8	237863	237870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018866	AGTT	2	8	244535	244542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018866	CATC	2	8	245365	245372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018866	TTTA	2	8	245520	245527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018866	ATTA	2	8	246897	246904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018866	CTTG	2	8	248566	248573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018866	AATT	2	8	251419	251426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018866	ATGG	2	8	251600	251607	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018866	AAAT	2	8	254915	254922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018866	TCCC	3	12	256196	256207	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_018866	TAAA	2	8	265938	265945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018866	CATC	2	8	266049	266056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018866	GCCA	2	8	269288	269295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018866	TTGA	2	8	269331	269338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018866	TATT	3	12	274961	274972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018866	TATT	2	8	277824	277831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018866	GATT	2	8	284718	284725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018866	ATTA	2	8	288815	288822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018866	AGGG	2	8	300256	300263	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018866	GTTC	2	8	300772	300779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018866	TTAA	2	8	302546	302553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018866	GAAT	2	8	302736	302743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018866	AGCA	2	8	302911	302918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018866	GCGA	2	8	302933	302940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018866	TGAG	2	8	302977	302984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018866	TAGA	2	8	304077	304084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018866	AGCC	2	8	304383	304390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018866	GACT	2	8	304543	304550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018866	ATTT	2	8	304573	304580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018866	CATA	2	8	304648	304655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018866	CCAT	2	8	304769	304776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018866	AATA	2	8	305153	305160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018866	AAAG	2	8	305211	305218	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018866	AAGG	2	8	306456	306463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018866	GGCG	2	8	307393	307400	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018866	ACAA	2	8	307513	307520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018866	TAAT	2	8	308480	308487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018866	GAAT	2	8	310841	310848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018866	AATT	2	8	310877	310884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018866	TAAT	2	8	311005	311012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018866	AGGA	2	8	321415	321422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018866	TAAT	2	8	322502	322509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018866	AATA	2	8	323450	323457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018866	GCCA	2	8	327774	327781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018866	CCTG	2	8	334668	334675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018866	ATAA	2	8	334817	334824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018866	ATGG	2	8	338181	338188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018866	CCAT	2	8	338235	338242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018866	CTTT	2	8	338961	338968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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