MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5 plasmid BPP5P1

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018830	GGCT	2	8	372	379	0 %	25 %	50 %	25 %	410500991
2	NC_018830	GCCG	2	8	551	558	0 %	0 %	50 %	50 %	410500991
3	NC_018830	CGTT	2	8	792	799	0 %	50 %	25 %	25 %	410500992
4	NC_018830	CGTG	2	8	1132	1139	0 %	25 %	50 %	25 %	410500992
5	NC_018830	GAAC	2	8	1351	1358	50 %	0 %	25 %	25 %	410500992
6	NC_018830	CGAC	2	8	1527	1534	25 %	0 %	25 %	50 %	410500993
7	NC_018830	TCTA	2	8	1759	1766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018830	CCGG	2	8	3096	3103	0 %	0 %	50 %	50 %	410500995
9	NC_018830	GCCG	2	8	3628	3635	0 %	0 %	50 %	50 %	410500995
10	NC_018830	GTTA	2	8	3753	3760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018830	TAGA	2	8	4324	4331	50 %	25 %	25 %	0 %	410500996
12	NC_018830	CCAT	2	8	4975	4982	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018830	TCGC	2	8	5011	5018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018830	GCTC	2	8	5385	5392	0 %	25 %	25 %	50 %	410500997
15	NC_018830	CGAC	2	8	5478	5485	25 %	0 %	25 %	50 %	410500997
16	NC_018830	TGCC	2	8	5981	5988	0 %	25 %	25 %	50 %	410500998
17	NC_018830	TCGG	2	8	6129	6136	0 %	25 %	50 %	25 %	410500999
18	NC_018830	TGGC	2	8	6161	6168	0 %	25 %	50 %	25 %	410500999
19	NC_018830	CTGC	2	8	6218	6225	0 %	25 %	25 %	50 %	410500999
20	NC_018830	GGCG	2	8	6254	6261	0 %	0 %	75 %	25 %	410500999
21	NC_018830	ATGG	2	8	6702	6709	25 %	25 %	50 %	0 %	410500999
22	NC_018830	ACCT	2	8	7473	7480	25 %	25 %	0 %	50 %	410501000
23	NC_018830	GCTG	2	8	8333	8340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018830	CCAA	2	8	8868	8875	50 %	0 %	0 %	50 %	410501001
25	NC_018830	TTTC	2	8	9073	9080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018830	ACCA	2	8	9175	9182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018830	GCAG	2	8	10371	10378	25 %	0 %	50 %	25 %	410501002
28	NC_018830	CTCA	2	8	10633	10640	25 %	25 %	0 %	50 %	410501003
29	NC_018830	CCCG	2	8	11253	11260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_018830	TGAG	2	8	11526	11533	25 %	25 %	50 %	0 %	410501005
31	NC_018830	GCGG	2	8	11926	11933	0 %	0 %	75 %	25 %	410501005

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.