MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5 plasmid BPP5P1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018830	GC	3	6	222	227	0 %	0 %	50 %	50 %	410500991
2	NC_018830	GC	3	6	366	371	0 %	0 %	50 %	50 %	410500991
3	NC_018830	AC	3	6	894	899	50 %	0 %	0 %	50 %	410500992
4	NC_018830	CG	3	6	1535	1540	0 %	0 %	50 %	50 %	410500993
5	NC_018830	CG	3	6	2318	2323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018830	CG	3	6	2327	2332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018830	CG	3	6	2862	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	410500995
8	NC_018830	GT	3	6	3846	3851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018830	GC	3	6	3875	3880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018830	GC	3	6	4424	4429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018830	GC	3	6	5456	5461	0 %	0 %	50 %	50 %	410500997
12	NC_018830	GC	3	6	5514	5519	0 %	0 %	50 %	50 %	410500997
13	NC_018830	CA	3	6	6338	6343	50 %	0 %	0 %	50 %	410500999
14	NC_018830	GC	3	6	6857	6862	0 %	0 %	50 %	50 %	410500999
15	NC_018830	GC	3	6	7149	7154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018830	GC	3	6	8022	8027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018830	TC	3	6	9079	9084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018830	GC	3	6	9337	9342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018830	CG	3	6	9443	9448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018830	CG	3	6	9548	9553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018830	GC	3	6	9969	9974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018830	GC	3	6	10712	10717	0 %	0 %	50 %	50 %	410501003
23	NC_018830	CA	3	6	11954	11959	50 %	0 %	0 %	50 %	410501005

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.