MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018829	TTCTC	2	10	40717	40726	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018829	AAACG	2	10	41029	41038	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018829	GGCGG	2	10	48666	48675	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018829	CCGGC	2	10	50407	50416	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_018829	GCCGG	2	10	62420	62429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018829	CCCGG	2	10	62441	62450	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_018829	CGGGC	2	10	80388	80397	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018829	GCGCG	2	10	80412	80421	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018829	CGCAC	2	10	100721	100730	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_018829	TTCGG	2	10	100833	100842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018829	CGCAT	2	10	113801	113810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018829	CAGGG	2	10	117008	117017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018829	ATGCC	2	10	127866	127875	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018829	ACGGG	2	10	179555	179564	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018829	GCGAA	2	10	181293	181302	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018829	CGCGC	2	10	196224	196233	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_018829	GGGGC	2	10	197805	197814	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018829	GAAAG	2	10	209847	209856	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018829	TGCAG	2	10	209962	209971	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018829	ATATT	2	10	219677	219686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018829	GCGCG	2	10	220914	220923	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_018829	GGTTG	2	10	229500	229509	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018829	GCGCC	2	10	234635	234644	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_018829	CGCAA	2	10	236004	236013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018829	TATGA	2	10	241863	241872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018829	GCGCG	2	10	246038	246047	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_018829	GGCGC	2	10	248115	248124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018829	CGCGC	2	10	253620	253629	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_018829	CTACT	2	10	263860	263869	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_018829	ATTCG	2	10	273208	273217	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018829	CGGCC	2	10	291083	291092	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_018829	CGGCG	2	10	295819	295828	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018829	GGCCC	2	10	299574	299583	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_018829	GTGCG	2	10	311008	311017	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018829	TGCGC	2	10	330589	330598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018829	TGCGC	2	10	331140	331149	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018829	GGCGC	2	10	336016	336025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018829	CGTGT	2	10	340804	340813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018829	TGGCG	2	10	344388	344397	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018829	GCGCC	2	10	362106	362115	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_018829	GGCCG	3	15	379302	379316	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018829	GGCGT	2	10	380243	380252	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018829	GGCCG	2	10	384985	384994	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018829	TGCAA	2	10	409013	409022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018829	CGCGG	2	10	417536	417545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018829	GGCGA	2	10	419539	419548	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018829	GCGTT	2	10	420584	420593	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018829	CGCGC	2	10	428459	428468	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_018829	CGCGG	2	10	434952	434961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018829	GATGG	2	10	444340	444349	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018829	AGCGC	2	10	451047	451056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_018829	GCTAC	2	10	454493	454502	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018829	GCGCC	2	10	456251	456260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_018829	GCCGG	2	10	469466	469475	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018829	CGCGC	2	10	482423	482432	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018829	GCGGG	2	10	488388	488397	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018829	GGCAT	2	10	489923	489932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018829	TCCTT	2	10	490341	490350	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018829	AAGTG	2	10	497825	497834	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018829	CCATG	2	10	498196	498205	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018829	AGCGC	2	10	502216	502225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018829	GTTCT	2	10	506384	506393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018829	GCGCG	2	10	515292	515301	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018829	GCGCG	2	10	515760	515769	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018829	TGGGT	2	10	529938	529947	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018829	GGCCG	2	10	548554	548563	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018829	GCCCG	2	10	562314	562323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_018829	CGACA	2	10	565679	565688	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_018829	CCAGG	2	10	571751	571760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018829	GCCCG	2	10	574532	574541	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_018829	GCTTC	2	10	579049	579058	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_018829	GGCGC	2	10	596890	596899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_018829	TCGCC	2	10	598314	598323	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_018829	GGGCC	2	10	599532	599541	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018829	CGGCG	2	10	601265	601274	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_018829	GATTG	2	10	643921	643930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018829	CCGGC	2	10	646893	646902	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_018829	CGGGC	2	10	649302	649311	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_018829	TGCGG	2	10	659591	659600	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018829	CGTTT	2	10	675077	675086	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018829	CGTGA	2	10	693173	693182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018829	CATGC	2	10	705749	705758	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018829	TGCAA	2	10	706190	706199	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018829	GCCGC	2	10	713050	713059	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_018829	CGTGC	2	10	713832	713841	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_018829	CGCGC	2	10	714075	714084	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_018829	GCCGG	2	10	722065	722074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_018829	GGCGG	2	10	722107	722116	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018829	GCCGG	2	10	730058	730067	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018829	CGGCG	2	10	730810	730819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018829	GCACG	2	10	730943	730952	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018829	CCGCG	2	10	738929	738938	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_018829	CGCGG	2	10	769637	769646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018829	GCCGG	2	10	784749	784758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018829	GCCCG	2	10	784765	784774	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_018829	GCGCG	2	10	785787	785796	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_018829	CGTCG	2	10	787258	787267	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_018829	CGCCC	2	10	850293	850302	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_018829	GTTCC	2	10	851829	851838	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_018829	GCCGG	2	10	851861	851870	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_018829	CAGGC	2	10	856131	856140	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018829	CGCGG	2	10	860016	860025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018829	GGCGG	2	10	860927	860936	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018829	GGCCG	3	15	863988	864002	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018829	CGGCG	2	10	872160	872169	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_018829	CGCGC	3	15	876121	876135	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_018829	CGGCG	2	10	876153	876162	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018829	CGGTG	2	10	907607	907616	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018829	CGCGC	2	10	922502	922511	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_018829	CGGCG	2	10	922576	922585	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018829	GCACG	2	10	922595	922604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_018829	GGCCG	2	10	930487	930496	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018829	CAGGG	2	10	950551	950560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018829	GCCGG	2	10	953740	953749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018829	CGGCC	2	10	953813	953822	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_018829	GGGCC	2	10	953848	953857	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018829	TGGGG	2	10	954626	954635	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018829	CGGCA	2	10	959681	959690	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018829	GCAAG	2	10	961788	961797	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018829	GGCCG	2	10	965578	965587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018829	GCCGA	2	10	984214	984223	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018829	GTTTT	2	10	987971	987980	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018829	AAAGA	2	10	1003295	1003304	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018829	TAAAA	2	10	1011851	1011860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018829	CACGC	2	10	1016306	1016315	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_018829	CGCGC	2	10	1016442	1016451	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_018829	GCAAG	2	10	1016501	1016510	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018829	GGCAT	2	10	1021130	1021139	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018829	GGCGG	2	10	1035569	1035578	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018829	TGTCC	2	10	1036668	1036677	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_018829	TCAAA	2	10	1036827	1036836	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018829	GGCCT	2	10	1042554	1042563	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_018829	CGCGC	2	10	1065230	1065239	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_018829	CGGCG	2	10	1070512	1070521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018829	CCGCG	2	10	1082462	1082471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_018829	GGCCG	2	10	1086746	1086755	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018829	CGGCG	2	10	1087322	1087331	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_018829	GGCCT	2	10	1101566	1101575	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_018829	CGGCG	2	10	1106622	1106631	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_018829	AGTTT	2	10	1106653	1106662	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018829	GGAAC	2	10	1106728	1106737	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018829	GCGCC	2	10	1114696	1114705	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_018829	GGCGC	2	10	1115368	1115377	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_018829	GCCGC	2	10	1115607	1115616	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_018829	GGCCG	2	10	1131161	1131170	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_018829	GCCCG	2	10	1148779	1148788	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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181	NC_018829	CATGC	2	10	1409933	1409942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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265	NC_018829	TCTTT	2	10	1972230	1972239	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_018829	GGCGG	2	10	1987400	1987409	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
268	NC_018829	GCGCC	2	10	1987533	1987542	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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272	NC_018829	CGGTG	2	10	2007747	2007756	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
273	NC_018829	GCCCG	2	10	2008229	2008238	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
274	NC_018829	GATGC	2	10	2008326	2008335	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
275	NC_018829	CGGGG	2	10	2008378	2008387	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
276	NC_018829	AGCTG	2	10	2009512	2009521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
277	NC_018829	GTTCG	2	10	2009648	2009657	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
278	NC_018829	GCGCC	2	10	2035100	2035109	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
279	NC_018829	CGGGG	2	10	2043755	2043764	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
280	NC_018829	GGGGC	2	10	2045342	2045351	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
281	NC_018829	AACAG	2	10	2046034	2046043	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
282	NC_018829	GCGCC	2	10	2047709	2047718	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
283	NC_018829	GCAGG	2	10	2051063	2051072	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
284	NC_018829	TGGGC	2	10	2051241	2051250	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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423	NC_018829	CGCGC	2	10	3141515	3141524	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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455	NC_018829	CTGCC	2	10	3341591	3341600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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