MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 15572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018829	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	410417817
2	NC_018829	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	410417817
3	NC_018829	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	410417817
4	NC_018829	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	410417817
5	NC_018829	CTGA	2	8	1345	1352	25 %	25 %	25 %	25 %	410417817
6	NC_018829	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	410417817
7	NC_018829	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	410417817
8	NC_018829	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	410417818
9	NC_018829	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	410417818
10	NC_018829	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	410417818
11	NC_018829	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	410417819
12	NC_018829	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	410417819
13	NC_018829	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	410417819
14	NC_018829	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	410417820
15	NC_018829	CCTG	2	8	4382	4389	0 %	25 %	25 %	50 %	410417821
16	NC_018829	GTGC	2	8	4500	4507	0 %	25 %	50 %	25 %	410417821
17	NC_018829	GGCC	2	8	4577	4584	0 %	0 %	50 %	50 %	410417821
18	NC_018829	GGCC	2	8	5310	5317	0 %	0 %	50 %	50 %	410417822
19	NC_018829	CGAC	2	8	5426	5433	25 %	0 %	25 %	50 %	410417822
20	NC_018829	CGGC	2	8	5742	5749	0 %	0 %	50 %	50 %	410417822
21	NC_018829	TATG	2	8	8025	8032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018829	TTGC	2	8	8361	8368	0 %	50 %	25 %	25 %	410417824
23	NC_018829	AAGG	2	8	8982	8989	50 %	0 %	50 %	0 %	410417825
24	NC_018829	CCCG	2	8	9401	9408	0 %	0 %	25 %	75 %	410417826
25	NC_018829	CCTA	2	8	11808	11815	25 %	25 %	0 %	50 %	410417830
26	NC_018829	TCGC	2	8	12169	12176	0 %	25 %	25 %	50 %	410417830
27	NC_018829	GTCG	2	8	13708	13715	0 %	25 %	50 %	25 %	410417830
28	NC_018829	TCGC	2	8	14241	14248	0 %	25 %	25 %	50 %	410417830
29	NC_018829	GGCC	2	8	14962	14969	0 %	0 %	50 %	50 %	410417830
30	NC_018829	TCGC	2	8	15781	15788	0 %	25 %	25 %	50 %	410417830
31	NC_018829	CAAG	2	8	15843	15850	50 %	0 %	25 %	25 %	410417831
32	NC_018829	ATGG	2	8	16524	16531	25 %	25 %	50 %	0 %	410417831
33	NC_018829	AAGG	2	8	17767	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	410417831
34	NC_018829	ATCG	2	8	18582	18589	25 %	25 %	25 %	25 %	410417831
35	NC_018829	GGTG	2	8	19125	19132	0 %	25 %	75 %	0 %	410417831
36	NC_018829	ACTG	2	8	20071	20078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018829	CCTG	2	8	21139	21146	0 %	25 %	25 %	50 %	410417833
38	NC_018829	GCCC	2	8	21914	21921	0 %	0 %	25 %	75 %	410417833
39	NC_018829	CACG	2	8	22032	22039	25 %	0 %	25 %	50 %	410417833
40	NC_018829	TTCG	2	8	22216	22223	0 %	50 %	25 %	25 %	410417834
41	NC_018829	CACG	2	8	22329	22336	25 %	0 %	25 %	50 %	410417834
42	NC_018829	CGGA	2	8	22359	22366	25 %	0 %	50 %	25 %	410417834
43	NC_018829	GCCG	2	8	23070	23077	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
44	NC_018829	CGCC	2	8	23583	23590	0 %	0 %	25 %	75 %	410417834
45	NC_018829	GGCC	2	8	23769	23776	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
46	NC_018829	GCTG	2	8	24229	24236	0 %	25 %	50 %	25 %	410417834
47	NC_018829	GCCG	2	8	24237	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	410417834
48	NC_018829	GCCA	2	8	24362	24369	25 %	0 %	25 %	50 %	410417834
49	NC_018829	CGGG	2	8	24374	24381	0 %	0 %	75 %	25 %	410417834
50	NC_018829	GACC	2	8	25343	25350	25 %	0 %	25 %	50 %	410417835
51	NC_018829	TGCT	2	8	25375	25382	0 %	50 %	25 %	25 %	410417835
52	NC_018829	GCCT	2	8	25975	25982	0 %	25 %	25 %	50 %	410417836
53	NC_018829	GCCG	2	8	26598	26605	0 %	0 %	50 %	50 %	410417837
54	NC_018829	TGAG	2	8	26761	26768	25 %	25 %	50 %	0 %	410417837
55	NC_018829	CGCC	2	8	26894	26901	0 %	0 %	25 %	75 %	410417837
56	NC_018829	CTGC	2	8	26906	26913	0 %	25 %	25 %	50 %	410417837
57	NC_018829	GCCG	2	8	26942	26949	0 %	0 %	50 %	50 %	410417837
58	NC_018829	CGGC	2	8	27154	27161	0 %	0 %	50 %	50 %	410417837
59	NC_018829	GCTG	2	8	27194	27201	0 %	25 %	50 %	25 %	410417837
60	NC_018829	GGCC	2	8	27365	27372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018829	CTGG	2	8	27440	27447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018829	AGCC	2	8	27686	27693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018829	ATCG	2	8	27790	27797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018829	AACG	2	8	27871	27878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018829	CTAC	2	8	29020	29027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018829	TGGA	2	8	29182	29189	25 %	25 %	50 %	0 %	410417840
67	NC_018829	GCCA	2	8	29614	29621	25 %	0 %	25 %	50 %	410417840
68	NC_018829	AAGA	2	8	30088	30095	75 %	0 %	25 %	0 %	410417840
69	NC_018829	ATGC	2	8	30118	30125	25 %	25 %	25 %	25 %	410417840
70	NC_018829	CGAA	2	8	30776	30783	50 %	0 %	25 %	25 %	410417840
71	NC_018829	AAGG	2	8	30817	30824	50 %	0 %	50 %	0 %	410417840
72	NC_018829	AAGT	2	8	31126	31133	50 %	25 %	25 %	0 %	410417840
73	NC_018829	GGCG	2	8	32023	32030	0 %	0 %	75 %	25 %	410417841
74	NC_018829	GATC	2	8	32512	32519	25 %	25 %	25 %	25 %	410417842
75	NC_018829	GTAA	2	8	33817	33824	50 %	25 %	25 %	0 %	410417843
76	NC_018829	GCTG	2	8	34232	34239	0 %	25 %	50 %	25 %	410417844
77	NC_018829	CGGC	2	8	35205	35212	0 %	0 %	50 %	50 %	410417846
78	NC_018829	CGAT	2	8	35415	35422	25 %	25 %	25 %	25 %	410417846
79	NC_018829	GGTC	2	8	35773	35780	0 %	25 %	50 %	25 %	410417847
80	NC_018829	GTCG	2	8	36347	36354	0 %	25 %	50 %	25 %	410417849
81	NC_018829	GCAC	2	8	37058	37065	25 %	0 %	25 %	50 %	410417850
82	NC_018829	TTCG	2	8	37068	37075	0 %	50 %	25 %	25 %	410417850
83	NC_018829	GCCG	2	8	37218	37225	0 %	0 %	50 %	50 %	410417850
84	NC_018829	CCAG	2	8	37533	37540	25 %	0 %	25 %	50 %	410417851
85	NC_018829	CGTC	2	8	38379	38386	0 %	25 %	25 %	50 %	410417853
86	NC_018829	GCAG	2	8	38937	38944	25 %	0 %	50 %	25 %	410417853
87	NC_018829	GGCC	2	8	38985	38992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018829	TGAT	2	8	39167	39174	25 %	50 %	25 %	0 %	410417854
89	NC_018829	TGCG	2	8	40409	40416	0 %	25 %	50 %	25 %	410417854
90	NC_018829	GCCT	2	8	40786	40793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018829	TTGG	2	8	40995	41002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018829	CAGG	2	8	41074	41081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018829	CAGG	2	8	41091	41098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018829	TCGT	2	8	41211	41218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018829	GACA	2	8	42022	42029	50 %	0 %	25 %	25 %	410417857
96	NC_018829	GCTG	2	8	42625	42632	0 %	25 %	50 %	25 %	410417858
97	NC_018829	GCCG	2	8	43098	43105	0 %	0 %	50 %	50 %	410417859
98	NC_018829	CCCA	2	8	43678	43685	25 %	0 %	0 %	75 %	410417860
99	NC_018829	CAAG	2	8	43713	43720	50 %	0 %	25 %	25 %	410417860
100	NC_018829	GCCG	2	8	44550	44557	0 %	0 %	50 %	50 %	410417862
101	NC_018829	GCGT	2	8	45278	45285	0 %	25 %	50 %	25 %	410417864
102	NC_018829	CGGC	2	8	45350	45357	0 %	0 %	50 %	50 %	410417864
103	NC_018829	GCTT	2	8	45390	45397	0 %	50 %	25 %	25 %	410417864
104	NC_018829	CATC	2	8	45670	45677	25 %	25 %	0 %	50 %	410417865
105	NC_018829	AAGA	2	8	45723	45730	75 %	0 %	25 %	0 %	410417865
106	NC_018829	GGCC	2	8	45737	45744	0 %	0 %	50 %	50 %	410417865
107	NC_018829	TCCG	2	8	46465	46472	0 %	25 %	25 %	50 %	410417865
108	NC_018829	GCTG	2	8	46520	46527	0 %	25 %	50 %	25 %	410417865
109	NC_018829	TGCT	2	8	46551	46558	0 %	50 %	25 %	25 %	410417865
110	NC_018829	ACCG	2	8	47652	47659	25 %	0 %	25 %	50 %	410417869
111	NC_018829	CGCT	2	8	48026	48033	0 %	25 %	25 %	50 %	410417870
112	NC_018829	GTGG	2	8	48460	48467	0 %	25 %	75 %	0 %	410417870
113	NC_018829	CCGA	2	8	48949	48956	25 %	0 %	25 %	50 %	410417871
114	NC_018829	GATC	2	8	49530	49537	25 %	25 %	25 %	25 %	410417871
115	NC_018829	GAAC	2	8	49644	49651	50 %	0 %	25 %	25 %	410417871
116	NC_018829	CACG	2	8	50021	50028	25 %	0 %	25 %	50 %	410417872
117	NC_018829	GGCA	2	8	50729	50736	25 %	0 %	50 %	25 %	410417873
118	NC_018829	GATG	2	8	50797	50804	25 %	25 %	50 %	0 %	410417873
119	NC_018829	CTGT	2	8	51129	51136	0 %	50 %	25 %	25 %	410417874
120	NC_018829	GCTG	2	8	51428	51435	0 %	25 %	50 %	25 %	410417875
121	NC_018829	CGCC	2	8	51468	51475	0 %	0 %	25 %	75 %	410417875
122	NC_018829	CCAG	2	8	51785	51792	25 %	0 %	25 %	50 %	410417875
123	NC_018829	GGCG	2	8	51855	51862	0 %	0 %	75 %	25 %	410417875
124	NC_018829	CGGC	2	8	51998	52005	0 %	0 %	50 %	50 %	410417875
125	NC_018829	GTCG	2	8	52158	52165	0 %	25 %	50 %	25 %	410417875
126	NC_018829	GAGC	2	8	52332	52339	25 %	0 %	50 %	25 %	410417875
127	NC_018829	GGCG	2	8	52434	52441	0 %	0 %	75 %	25 %	410417875
128	NC_018829	TGGA	2	8	52576	52583	25 %	25 %	50 %	0 %	410417875
129	NC_018829	GCTG	2	8	52785	52792	0 %	25 %	50 %	25 %	410417875
130	NC_018829	CGGC	2	8	52871	52878	0 %	0 %	50 %	50 %	410417875
131	NC_018829	CGCA	2	8	53064	53071	25 %	0 %	25 %	50 %	410417875
132	NC_018829	GGCT	2	8	53654	53661	0 %	25 %	50 %	25 %	410417876
133	NC_018829	CTAC	2	8	54060	54067	25 %	25 %	0 %	50 %	410417876
134	NC_018829	CTGG	2	8	54307	54314	0 %	25 %	50 %	25 %	410417876
135	NC_018829	CGCC	2	8	54327	54334	0 %	0 %	25 %	75 %	410417876
136	NC_018829	CGGC	2	8	54359	54366	0 %	0 %	50 %	50 %	410417876
137	NC_018829	AGCC	2	8	54497	54504	25 %	0 %	25 %	50 %	410417877
138	NC_018829	CGAG	2	8	55203	55210	25 %	0 %	50 %	25 %	410417877
139	NC_018829	GGTT	2	8	56034	56041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018829	GGCA	2	8	56185	56192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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