MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 1676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018829	TATG	2	8	8025	8032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018829	ACTG	2	8	20071	20078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018829	GGCC	2	8	27365	27372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018829	CTGG	2	8	27440	27447	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018829	AGCC	2	8	27686	27693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018829	ATCG	2	8	27790	27797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018829	AACG	2	8	27871	27878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018829	CTAC	2	8	29020	29027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018829	GGCC	2	8	38985	38992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018829	GCCT	2	8	40786	40793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018829	TTGG	2	8	40995	41002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018829	CAGG	2	8	41074	41081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018829	CAGG	2	8	41091	41098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018829	TCGT	2	8	41211	41218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018829	GGTT	2	8	56034	56041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018829	GGCA	2	8	56185	56192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018829	CGGC	2	8	71728	71735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018829	ACCG	2	8	73095	73102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018829	CGGG	2	8	73177	73184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018829	CAGG	2	8	73742	73749	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018829	AGCC	2	8	76700	76707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018829	GCAC	2	8	80470	80477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018829	GGCC	2	8	85284	85291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018829	TACT	2	8	85312	85319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018829	GGCG	2	8	91416	91423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018829	CCGG	2	8	93651	93658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018829	AATC	2	8	95837	95844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018829	GGGC	2	8	95922	95929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018829	CGGG	2	8	96594	96601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018829	CGGC	2	8	97596	97603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018829	GCCG	2	8	97608	97615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018829	GCGT	2	8	99577	99584	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018829	CCCT	2	8	99692	99699	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_018829	GCCT	2	8	106865	106872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018829	CCCG	2	8	106932	106939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_018829	TGCC	2	8	113781	113788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018829	CTGG	2	8	113829	113836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018829	GCGA	2	8	136808	136815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018829	GTAT	2	8	141705	141712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018829	CCTA	2	8	141816	141823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018829	TGCA	2	8	142023	142030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018829	GACG	2	8	149281	149288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018829	GCGT	2	8	152442	152449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018829	TGCC	2	8	162944	162951	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018829	CGGC	2	8	171556	171563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018829	GGCG	2	8	171565	171572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018829	CGGC	2	8	176227	176234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018829	GCCG	2	8	176237	176244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018829	GGCG	2	8	177509	177516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018829	GGTC	2	8	178868	178875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018829	TTCC	2	8	179430	179437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018829	CTGG	2	8	180088	180095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018829	ATTG	2	8	182178	182185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018829	CGGC	2	8	184971	184978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018829	TATT	3	12	202586	202597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018829	CCGA	2	8	209796	209803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018829	CGGG	2	8	222249	222256	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018829	GCGG	2	8	234503	234510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018829	GAAA	2	8	239840	239847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018829	CGGA	2	8	239886	239893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018829	CATA	2	8	241878	241885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018829	GCGG	2	8	252706	252713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018829	GCCG	2	8	254311	254318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018829	GCTG	2	8	264731	264738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018829	AGTA	2	8	272788	272795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018829	GGCC	2	8	272870	272877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018829	TACT	2	8	273043	273050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018829	CGGC	2	8	273175	273182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018829	TGAA	2	8	290289	290296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018829	GGGC	2	8	291106	291113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018829	GGCA	2	8	295808	295815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018829	GGAT	2	8	301558	301565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018829	GCCG	2	8	302413	302420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018829	CGGC	3	12	302425	302436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018829	GGCG	3	12	306277	306288	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018829	GTTG	2	8	307749	307756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018829	GGCG	2	8	310154	310161	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018829	TGCG	2	8	312505	312512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018829	ATAC	2	8	318927	318934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018829	TGCG	2	8	323493	323500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018829	GCTT	2	8	323601	323608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018829	TTAT	2	8	323660	323667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018829	AGAA	2	8	323698	323705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018829	GCCT	2	8	329075	329082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018829	GGCC	2	8	330235	330242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018829	TGGG	2	8	330320	330327	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018829	GCAG	2	8	331249	331256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018829	CGGC	2	8	335031	335038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018829	GCCC	2	8	344170	344177	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_018829	GCCG	2	8	344276	344283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018829	CTCG	2	8	344376	344383	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018829	CGGC	2	8	345483	345490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018829	TGGG	2	8	347396	347403	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018829	TTGC	2	8	347404	347411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018829	GCCC	2	8	353845	353852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_018829	GAGG	2	8	355587	355594	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018829	GCGG	2	8	355698	355705	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018829	GCCC	2	8	355721	355728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_018829	CGGC	2	8	356744	356751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018829	GGCG	2	8	357747	357754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018829	AGGC	2	8	363181	363188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018829	GGCA	2	8	363358	363365	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018829	GCGG	2	8	367222	367229	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018829	GCCG	2	8	368738	368745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018829	CGCC	2	8	376179	376186	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_018829	GCCG	2	8	377298	377305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018829	ATTC	2	8	380201	380208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018829	GAGC	2	8	384633	384640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018829	GGAA	2	8	387139	387146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018829	CCGC	2	8	387928	387935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_018829	GCCT	2	8	392344	392351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018829	GCAG	2	8	392398	392405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018829	TGTT	2	8	392504	392511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018829	GCGG	2	8	392543	392550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018829	GCCC	2	8	399116	399123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_018829	CTCC	2	8	407895	407902	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_018829	GCCG	2	8	413070	413077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018829	CCGG	2	8	417546	417553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018829	AAGG	2	8	419199	419206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018829	GGGC	2	8	419333	419340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018829	CGGT	2	8	420316	420323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018829	GCGG	2	8	420639	420646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018829	ATTT	2	8	421750	421757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018829	GCGG	2	8	421854	421861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018829	GGCG	2	8	422046	422053	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018829	CGGG	2	8	424857	424864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018829	ACGG	2	8	425149	425156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018829	CGAT	2	8	429836	429843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018829	CAGG	2	8	434515	434522	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018829	GCCG	2	8	434542	434549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018829	CCAG	2	8	434607	434614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018829	TACA	2	8	434773	434780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018829	GGGC	2	8	435195	435202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018829	GGTA	2	8	437168	437175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018829	CGTG	2	8	439996	440003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018829	CGGC	2	8	443740	443747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018829	GCCG	2	8	451031	451038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018829	GACG	2	8	451068	451075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018829	TGGC	2	8	451141	451148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018829	TGTT	2	8	451158	451165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018829	ACGC	2	8	454461	454468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018829	GGCG	2	8	456230	456237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018829	CTAT	2	8	457191	457198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018829	GGCG	2	8	458663	458670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018829	GGAT	2	8	459832	459839	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018829	TGCG	2	8	470344	470351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018829	TCAC	2	8	474623	474630	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018829	CGGC	2	8	479449	479456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018829	GGGC	2	8	481288	481295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018829	CGGG	2	8	482314	482321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018829	CGGC	2	8	482326	482333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018829	CGTC	2	8	482360	482367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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464	NC_018829	GGGC	2	8	1332827	1332834	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_018829	GAAA	2	8	1409630	1409637	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_018829	GCCC	2	8	1426000	1426007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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498	NC_018829	CGGG	2	8	1430876	1430883	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
499	NC_018829	CCGG	2	8	1430907	1430914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_018829	CAGC	2	8	1430932	1430939	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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