MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 6346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018829	CTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018829	GCG	2	6	6178	6183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018829	CGG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018829	GCC	2	6	6209	6214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_018829	GGA	2	6	6281	6286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018829	CCT	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018829	CCA	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018829	AGC	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018829	GGA	2	6	6527	6532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018829	ACG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018829	TTC	3	9	6723	6731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018829	AGT	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018829	CCG	2	6	8145	8150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018829	CGG	2	6	8176	8181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018829	TGC	2	6	10364	10369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018829	GTT	2	6	10397	10402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018829	GAA	2	6	10480	10485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018829	CAG	2	6	11635	11640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018829	ATA	2	6	20663	20668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018829	GGC	2	6	20676	20681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018829	GAC	2	6	20717	20722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018829	GCG	2	6	26329	26334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018829	CGA	2	6	27419	27424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018829	CGC	2	6	27506	27511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018829	GCC	2	6	27537	27542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018829	CCG	2	6	27808	27813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018829	ATT	2	6	27838	27843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018829	GCA	2	6	28457	28462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018829	GTC	2	6	28471	28476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018829	GGC	2	6	28483	28488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018829	CGC	2	6	31140	31145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018829	CAA	2	6	31169	31174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018829	CGC	2	6	32428	32433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018829	CGG	3	9	32872	32880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018829	TGC	2	6	32926	32931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018829	GCC	2	6	33002	33007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018829	GCG	2	6	33038	33043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018829	CGC	2	6	37916	37921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018829	GGC	2	6	37993	37998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018829	GCA	2	6	38032	38037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018829	CCG	2	6	38051	38056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018829	CCG	2	6	39003	39008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018829	CGG	2	6	39014	39019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018829	TCG	2	6	40537	40542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018829	ATG	2	6	40578	40583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018829	GGA	2	6	40659	40664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018829	TGC	2	6	40780	40785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018829	CCG	2	6	40825	40830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018829	GCC	2	6	40864	40869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018829	TTG	2	6	40972	40977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018829	CGG	2	6	41157	41162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018829	CAG	2	6	41222	41227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018829	TGA	2	6	42574	42579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018829	CGC	2	6	48576	48581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018829	CGC	3	9	48583	48591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018829	TGG	2	6	48611	48616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018829	CGG	2	6	48691	48696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018829	CGC	2	6	49808	49813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018829	AGA	2	6	49878	49883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018829	GCG	2	6	50386	50391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018829	CGG	2	6	50419	50424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018829	TTG	2	6	50911	50916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018829	GCG	2	6	50924	50929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018829	CCG	2	6	50941	50946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018829	GCC	2	6	50997	51002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018829	TCG	2	6	56228	56233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018829	TGC	2	6	61902	61907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018829	GCG	2	6	61936	61941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018829	GGC	2	6	61970	61975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018829	AGC	2	6	61977	61982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018829	CCG	2	6	61983	61988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018829	TTG	2	6	62059	62064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018829	TGC	2	6	67899	67904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018829	CTG	2	6	68007	68012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018829	CGG	2	6	68026	68031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018829	GGC	2	6	68716	68721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018829	GGC	2	6	68724	68729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018829	GCC	2	6	68761	68766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018829	GTG	2	6	72999	73004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018829	GCC	2	6	73016	73021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018829	TCG	2	6	73046	73051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018829	TCA	2	6	73062	73067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018829	CGG	2	6	73169	73174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018829	AAT	3	9	73803	73811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018829	ATA	2	6	73832	73837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018829	CCG	2	6	73892	73897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018829	GCG	2	6	76052	76057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018829	GCC	2	6	76063	76068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018829	GGA	2	6	76173	76178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018829	TCG	2	6	80326	80331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018829	AAT	2	6	80357	80362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018829	CGC	2	6	80402	80407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018829	GGC	2	6	80568	80573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018829	CAA	2	6	80580	80585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018829	CCG	2	6	82093	82098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018829	ACA	2	6	82110	82115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018829	ATA	2	6	83138	83143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018829	TAC	2	6	83239	83244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018829	GCC	2	6	85296	85301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018829	CTA	2	6	86372	86377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018829	CGG	2	6	87413	87418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018829	CCG	2	6	87429	87434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018829	GCA	2	6	90598	90603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018829	GGC	2	6	90604	90609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018829	CCG	2	6	91407	91412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018829	GGC	2	6	91427	91432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018829	CGT	2	6	93622	93627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018829	CAT	2	6	93679	93684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018829	GGC	2	6	93752	93757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018829	AGC	2	6	93818	93823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018829	GCT	2	6	95792	95797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018829	CGT	2	6	95819	95824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018829	TCG	2	6	95848	95853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018829	CGG	2	6	95881	95886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018829	GCG	2	6	95946	95951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018829	TCC	2	6	96363	96368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018829	GGC	2	6	96397	96402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018829	CGT	2	6	96408	96413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018829	TTG	2	6	96421	96426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018829	ATT	2	6	96489	96494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018829	CCA	2	6	96535	96540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018829	TGC	2	6	98865	98870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018829	CGC	2	6	98891	98896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018829	CGG	2	6	99666	99671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018829	GGC	3	9	100677	100685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018829	GCC	2	6	100692	100697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018829	CGC	2	6	100867	100872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018829	TCC	2	6	113667	113672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018829	TCA	2	6	113730	113735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018829	GCG	2	6	113875	113880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018829	GCC	2	6	115595	115600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018829	CGC	2	6	115623	115628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018829	GCA	2	6	115670	115675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018829	CGC	3	9	117021	117029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018829	GGC	2	6	117032	117037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018829	CGG	2	6	117039	117044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018829	GCC	2	6	117099	117104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018829	GCC	2	6	117107	117112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018829	GCG	3	9	120005	120013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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