MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica MO149

Total Repeats: 92253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018829	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417817
2	NC_018829	TGG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417817
3	NC_018829	TGC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417817
4	NC_018829	GCG	2	6	200	205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417817
5	NC_018829	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417817
6	NC_018829	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417817
7	NC_018829	GGT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417817
8	NC_018829	GTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417817
9	NC_018829	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417817
10	NC_018829	CGC	3	9	602	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417817
11	NC_018829	AGC	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417817
12	NC_018829	TCT	2	6	680	685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410417817
13	NC_018829	ATC	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417817
14	NC_018829	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417817
15	NC_018829	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410417817
16	NC_018829	GGC	3	9	1140	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417817
17	NC_018829	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417817
18	NC_018829	GCC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417817
19	NC_018829	GCC	2	6	1358	1363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417817
20	NC_018829	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417817
21	NC_018829	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417817
22	NC_018829	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417817
23	NC_018829	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417817
24	NC_018829	CGA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417817
25	NC_018829	AGC	3	9	1721	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417817
26	NC_018829	ACG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417817
27	NC_018829	CGG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417818
28	NC_018829	CAG	3	9	2004	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417818
29	NC_018829	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417818
30	NC_018829	GCA	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417818
31	NC_018829	CGC	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417818
32	NC_018829	CGG	3	9	2198	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417818
33	NC_018829	GTG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417818
34	NC_018829	CAT	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417818
35	NC_018829	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417818
36	NC_018829	GTG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417818
37	NC_018829	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417818
38	NC_018829	TCG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417818
39	NC_018829	TGG	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417818
40	NC_018829	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417819
41	NC_018829	ACC	3	9	2678	2686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417819
42	NC_018829	AGC	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417819
43	NC_018829	TGC	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417819
44	NC_018829	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417819
45	NC_018829	CGG	2	6	2866	2871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417819
46	NC_018829	GCC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417819
47	NC_018829	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417819
48	NC_018829	TCA	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417819
49	NC_018829	CAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417819
50	NC_018829	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410417819
51	NC_018829	GCA	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417819
52	NC_018829	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417819
53	NC_018829	GGT	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417819
54	NC_018829	GTG	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417819
55	NC_018829	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417820
56	NC_018829	GGC	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
57	NC_018829	CCA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417820
58	NC_018829	GGT	2	6	3636	3641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417820
59	NC_018829	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417820
60	NC_018829	GGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
61	NC_018829	CGT	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417820
62	NC_018829	ACG	2	6	3861	3866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417820
63	NC_018829	GGC	2	6	3901	3906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
64	NC_018829	GCT	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417820
65	NC_018829	GCG	2	6	3945	3950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
66	NC_018829	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
67	NC_018829	CGC	2	6	4017	4022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417820
68	NC_018829	GCG	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
69	NC_018829	GCG	2	6	4041	4046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
70	NC_018829	CGG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417820
71	NC_018829	GCC	2	6	4130	4135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417820
72	NC_018829	ACA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410417821
73	NC_018829	CCG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417821
74	NC_018829	CAT	2	6	4481	4486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417821
75	NC_018829	ATC	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417821
76	NC_018829	AAG	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417821
77	NC_018829	CGA	2	6	4619	4624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417821
78	NC_018829	CGC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417821
79	NC_018829	CGC	2	6	4701	4706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417821
80	NC_018829	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417821
81	NC_018829	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417821
82	NC_018829	CCA	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410417821
83	NC_018829	CTG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417821
84	NC_018829	TGC	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417821
85	NC_018829	GCC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417821
86	NC_018829	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417821
87	NC_018829	AAG	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417821
88	NC_018829	ATC	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417821
89	NC_018829	GCT	2	6	5135	5140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417821
90	NC_018829	CGG	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417822
91	NC_018829	GCG	2	6	5249	5254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417822
92	NC_018829	GGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417822
93	NC_018829	GGC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417822
94	NC_018829	CGC	3	9	5400	5408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417822
95	NC_018829	CGA	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417822
96	NC_018829	TGC	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417822
97	NC_018829	TGA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410417822
98	NC_018829	CGC	2	6	5694	5699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417822
99	NC_018829	GCC	2	6	5779	5784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417822
100	NC_018829	GCT	2	6	5790	5795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417822
101	NC_018829	GCA	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417822
102	NC_018829	GGT	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417822
103	NC_018829	CGA	3	9	6042	6050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417822
104	NC_018829	TGC	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417822
105	NC_018829	GTT	2	6	6153	6158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410417822
106	NC_018829	ACG	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417823
107	NC_018829	CGG	2	6	6852	6857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417823
108	NC_018829	ACG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417823
109	NC_018829	CGG	2	6	6886	6891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417823
110	NC_018829	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417823
111	NC_018829	TGC	2	6	7051	7056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
112	NC_018829	TGG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417823
113	NC_018829	CTG	2	6	7127	7132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
114	NC_018829	CAT	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417823
115	NC_018829	GCT	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
116	NC_018829	TGG	2	6	7212	7217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417823
117	NC_018829	CTG	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
118	NC_018829	GGT	2	6	7450	7455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417823
119	NC_018829	GCG	2	6	7473	7478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417823
120	NC_018829	GAC	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417823
121	NC_018829	GCT	2	6	7564	7569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
122	NC_018829	CTG	2	6	7604	7609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
123	NC_018829	TTC	2	6	7739	7744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410417823
124	NC_018829	ACG	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417823
125	NC_018829	CGG	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417823
126	NC_018829	TGC	2	6	7824	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
127	NC_018829	GCT	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
128	NC_018829	GAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417823
129	NC_018829	CGT	2	6	7933	7938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417823
130	NC_018829	ATC	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417823
131	NC_018829	TCG	2	6	8263	8268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417824
132	NC_018829	TGG	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410417824
133	NC_018829	CGG	2	6	8339	8344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417824
134	NC_018829	GTC	2	6	8349	8354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417824
135	NC_018829	GCG	2	6	8355	8360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410417824
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139	NC_018829	GTC	2	6	8604	8609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417825
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141	NC_018829	GTC	2	6	8718	8723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410417825
142	NC_018829	CGC	2	6	8757	8762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417825
143	NC_018829	CGA	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417825
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145	NC_018829	GAA	2	6	9018	9023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417825
146	NC_018829	GAA	2	6	9188	9193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417826
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151	NC_018829	TCA	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417826
152	NC_018829	GAA	2	6	9501	9506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417826
153	NC_018829	AGC	2	6	9520	9525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417826
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160	NC_018829	CGC	2	6	9871	9876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417827
161	NC_018829	GCC	2	6	9881	9886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417827
162	NC_018829	GAC	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417827
163	NC_018829	CCG	2	6	10068	10073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410417827
164	NC_018829	GAA	2	6	10075	10080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417827
165	NC_018829	CAT	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410417827
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251	NC_018829	GCA	2	6	15228	15233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417830
252	NC_018829	CGA	2	6	15256	15261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410417830
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254	NC_018829	GAA	2	6	15289	15294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410417830
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