MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 78788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018828	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470816
2	NC_018828	TGG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470816
3	NC_018828	TGC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470816
4	NC_018828	GCG	2	6	200	205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470816
5	NC_018828	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470816
6	NC_018828	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470816
7	NC_018828	GGT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470816
8	NC_018828	GTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470816
9	NC_018828	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470816
10	NC_018828	CGC	3	9	602	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470816
11	NC_018828	AGC	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470816
12	NC_018828	ATC	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470816
13	NC_018828	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470816
14	NC_018828	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410470816
15	NC_018828	GGC	3	9	1140	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470816
16	NC_018828	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470816
17	NC_018828	GCC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470816
18	NC_018828	GCC	2	6	1358	1363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470816
19	NC_018828	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470816
20	NC_018828	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470816
21	NC_018828	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470816
22	NC_018828	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470816
23	NC_018828	CGA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470816
24	NC_018828	AGC	3	9	1721	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470816
25	NC_018828	ACG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470816
26	NC_018828	CGG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470817
27	NC_018828	CAG	3	9	2004	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470817
28	NC_018828	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470817
29	NC_018828	GCA	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470817
30	NC_018828	GTG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470817
31	NC_018828	CAT	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470817
32	NC_018828	GAA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470817
33	NC_018828	GTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470817
34	NC_018828	GGT	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470817
35	NC_018828	TCG	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470817
36	NC_018828	TGG	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470817
37	NC_018828	GCG	2	6	2604	2609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470818
38	NC_018828	ACC	3	9	2618	2626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470818
39	NC_018828	AGC	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470818
40	NC_018828	TGC	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470818
41	NC_018828	CCA	2	6	2703	2708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470818
42	NC_018828	CGG	2	6	2806	2811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470818
43	NC_018828	ACG	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470818
44	NC_018828	GCC	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470818
45	NC_018828	GCT	2	6	2962	2967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470818
46	NC_018828	TCA	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470818
47	NC_018828	CAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410470818
48	NC_018828	TTG	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410470818
49	NC_018828	GCA	3	9	3145	3153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470818
50	NC_018828	CAC	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470818
51	NC_018828	GGT	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470818
52	NC_018828	GTG	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470818
53	NC_018828	GCC	2	6	3374	3379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470819
54	NC_018828	GGC	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
55	NC_018828	CCA	2	6	3438	3443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470819
56	NC_018828	TCG	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470819
57	NC_018828	GGC	2	6	3697	3702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
58	NC_018828	CGT	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470819
59	NC_018828	ACG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470819
60	NC_018828	GGC	2	6	3841	3846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
61	NC_018828	GCT	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470819
62	NC_018828	GCG	2	6	3885	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
63	NC_018828	GGC	2	6	3910	3915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
64	NC_018828	CGC	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470819
65	NC_018828	GCG	2	6	3964	3969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
66	NC_018828	GCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
67	NC_018828	CGG	2	6	3987	3992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470819
68	NC_018828	CAG	2	6	4046	4051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470819
69	NC_018828	GCC	2	6	4070	4075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470819
70	NC_018828	ACA	2	6	4273	4278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410470820
71	NC_018828	CCG	2	6	4311	4316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470820
72	NC_018828	CAT	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470820
73	NC_018828	ATC	2	6	4479	4484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470820
74	NC_018828	AAG	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470820
75	NC_018828	CGA	2	6	4559	4564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470820
76	NC_018828	CGC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470820
77	NC_018828	CGC	2	6	4641	4646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470820
78	NC_018828	CGA	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470820
79	NC_018828	GCC	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470820
80	NC_018828	CCA	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470820
81	NC_018828	CTG	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470820
82	NC_018828	TGC	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470820
83	NC_018828	GCC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470820
84	NC_018828	CGC	2	6	4916	4921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470820
85	NC_018828	AAG	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470820
86	NC_018828	ATC	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470820
87	NC_018828	GCT	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470820
88	NC_018828	CGG	2	6	5151	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470821
89	NC_018828	GCG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470821
90	NC_018828	GGC	2	6	5232	5237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470821
91	NC_018828	GGC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470821
92	NC_018828	CGC	3	9	5340	5348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470821
93	NC_018828	CGA	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470821
94	NC_018828	GGT	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470821
95	NC_018828	GCT	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470821
96	NC_018828	TGA	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410470821
97	NC_018828	GCC	2	6	5620	5625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470821
98	NC_018828	CGC	2	6	5634	5639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470821
99	NC_018828	GCC	2	6	5719	5724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470821
100	NC_018828	GCT	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470821
101	NC_018828	GCA	2	6	5754	5759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470821
102	NC_018828	GGT	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470821
103	NC_018828	CGA	3	9	5973	5981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470821
104	NC_018828	GCC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470821
105	NC_018828	TGC	2	6	6032	6037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470821
106	NC_018828	GTT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410470821
107	NC_018828	ACG	2	6	6773	6778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470822
108	NC_018828	CGG	2	6	6783	6788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470822
109	NC_018828	ACG	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470822
110	NC_018828	CGG	2	6	6817	6822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470822
111	NC_018828	GAA	2	6	6964	6969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470822
112	NC_018828	TGC	2	6	6982	6987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
113	NC_018828	TGG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470822
114	NC_018828	CAT	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470822
115	NC_018828	TGA	2	6	7120	7125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410470822
116	NC_018828	GCT	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
117	NC_018828	TGG	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470822
118	NC_018828	CTG	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
119	NC_018828	GGT	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470822
120	NC_018828	GCG	2	6	7404	7409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470822
121	NC_018828	GAC	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470822
122	NC_018828	GCT	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
123	NC_018828	TGC	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
124	NC_018828	TTC	2	6	7670	7675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410470822
125	NC_018828	ACG	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470822
126	NC_018828	CGG	2	6	7737	7742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470822
127	NC_018828	TGC	2	6	7755	7760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
128	NC_018828	GCT	2	6	7789	7794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
129	NC_018828	GAA	2	6	7811	7816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470822
130	NC_018828	CGT	2	6	7864	7869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470822
131	NC_018828	ATC	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470822
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135	NC_018828	GTC	2	6	8280	8285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470823
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252	NC_018828	GAA	2	6	15219	15224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470829
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254	NC_018828	CGA	2	6	15303	15308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470829
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378	NC_018828	GCC	2	6	25054	25059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470833
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380	NC_018828	GTC	2	6	25343	25348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470834
381	NC_018828	CGT	2	6	25354	25359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470834
382	NC_018828	GGC	2	6	25599	25604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470834
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450	NC_018828	CAA	2	6	30433	30438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410470840
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452	NC_018828	TGG	2	6	30675	30680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410470840
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500	NC_018828	GAC	2	6	32954	32959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470841

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