MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	ACAATA	2	12	30	41	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018749	CCAACC	2	12	3097	3108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671661
3	NC_018749	CCCAGC	2	12	10089	10100	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	408671668
4	NC_018749	TTAATC	2	12	15514	15525	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018749	GCAAAT	2	12	15708	15719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018749	TTTAAA	2	12	16033	16044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018749	TGAAAT	2	12	20676	20687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671677
8	NC_018749	TGTTTA	2	12	23587	23598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018749	AAAAAG	2	12	23627	23638	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018749	TAATGA	2	12	26617	26628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671681
11	NC_018749	ATTTAT	2	12	28647	28658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671682
12	NC_018749	AAAATG	2	12	29272	29283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408671683
13	NC_018749	TGTTAA	2	12	30729	30740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018749	CATAAA	2	12	33297	33308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671687
15	NC_018749	TGGGAG	2	12	38911	38922	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408671693
16	NC_018749	TCAAAA	2	12	40901	40912	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671694
17	NC_018749	CGAATC	2	12	42666	42677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408671697
18	NC_018749	TTCTTT	2	12	48001	48012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408671702
19	NC_018749	AAGAAA	2	12	50397	50408	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408671703
20	NC_018749	TATGCG	2	12	51876	51887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408671705
21	NC_018749	AATTTC	2	12	52204	52215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018749	ATTTTT	2	12	53142	53153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408671706
23	NC_018749	CATAAC	2	12	54016	54027	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408671707
24	NC_018749	AAATTG	2	12	57070	57081	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671709
25	NC_018749	TAAAGT	2	12	59027	59038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671710
26	NC_018749	CTTTAT	2	12	60619	60630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408671711
27	NC_018749	TTGTTT	2	12	61347	61358	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408671712
28	NC_018749	TCTACT	2	12	63617	63628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408671714
29	NC_018749	GCAACA	2	12	64901	64912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671715
30	NC_018749	GAAGTA	2	12	65420	65431	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408671716
31	NC_018749	TCATTT	2	12	67211	67222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408671717
32	NC_018749	CGGATT	2	12	68651	68662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408671718
33	NC_018749	TGAACT	2	12	71695	71706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671719
34	NC_018749	CTTGTG	2	12	75314	75325	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408671722
35	NC_018749	TAAGTT	2	12	84802	84813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671729
36	NC_018749	ATTAGA	2	12	89341	89352	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671731
37	NC_018749	ATTACA	2	12	90650	90661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671732
38	NC_018749	AAAATC	2	12	90829	90840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018749	AAACTA	2	12	91156	91167	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671733
40	NC_018749	AAAGTA	2	12	94972	94983	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408671736
41	NC_018749	CAGTAC	2	12	98971	98982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408671739
42	NC_018749	ATTTTT	2	12	99060	99071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408671739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.