MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	TGTGT	2	10	3071	3080	0 %	60 %	40 %	0 %	408671661
2	NC_018749	GAAAA	2	10	3329	3338	80 %	0 %	20 %	0 %	408671661
3	NC_018749	TGGTA	2	10	3889	3898	20 %	40 %	40 %	0 %	408671662
4	NC_018749	AGAAA	2	10	4018	4027	80 %	0 %	20 %	0 %	408671662
5	NC_018749	CGTGG	2	10	5840	5849	0 %	20 %	60 %	20 %	408671663
6	NC_018749	ATGCC	2	10	8320	8329	20 %	20 %	20 %	40 %	408671666
7	NC_018749	CCGAG	2	10	8548	8557	20 %	0 %	40 %	40 %	408671666
8	NC_018749	TTTGA	2	10	10629	10638	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018749	ACGCT	2	10	11958	11967	20 %	20 %	20 %	40 %	408671670
10	NC_018749	CAATC	2	10	12936	12945	40 %	20 %	0 %	40 %	408671671
11	NC_018749	TCTAA	2	10	14342	14351	40 %	40 %	0 %	20 %	408671672
12	NC_018749	CATTT	2	10	16509	16518	20 %	60 %	0 %	20 %	408671674
13	NC_018749	TTCTT	2	10	16690	16699	0 %	80 %	0 %	20 %	408671674
14	NC_018749	AAAAG	2	10	16997	17006	80 %	0 %	20 %	0 %	408671674
15	NC_018749	AATAA	2	10	18705	18714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018749	TAGAA	2	10	18975	18984	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018749	TGAGA	2	10	19323	19332	40 %	20 %	40 %	0 %	408671676
18	NC_018749	TTTGC	2	10	20840	20849	0 %	60 %	20 %	20 %	408671677
19	NC_018749	ATTTT	2	10	24063	24072	20 %	80 %	0 %	0 %	408671679
20	NC_018749	TTCAA	2	10	24710	24719	40 %	40 %	0 %	20 %	408671679
21	NC_018749	ATGCT	2	10	24774	24783	20 %	40 %	20 %	20 %	408671679
22	NC_018749	AAATT	2	10	24903	24912	60 %	40 %	0 %	0 %	408671680
23	NC_018749	ATTCA	2	10	25808	25817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018749	AACAA	2	10	28029	28038	80 %	0 %	0 %	20 %	408671682
25	NC_018749	GAAAA	2	10	31556	31565	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018749	ATTGA	2	10	31625	31634	40 %	40 %	20 %	0 %	408671686
27	NC_018749	CGTTT	2	10	31699	31708	0 %	60 %	20 %	20 %	408671686
28	NC_018749	ATAGT	2	10	31710	31719	40 %	40 %	20 %	0 %	408671686
29	NC_018749	TTTAT	2	10	32889	32898	20 %	80 %	0 %	0 %	408671687
30	NC_018749	ATTTT	2	10	34311	34320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018749	TTCAA	2	10	36388	36397	40 %	40 %	0 %	20 %	408671692
32	NC_018749	TATAT	2	10	36954	36963	40 %	60 %	0 %	0 %	408671692
33	NC_018749	TTATA	2	10	37726	37735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018749	GCTTT	2	10	38816	38825	0 %	60 %	20 %	20 %	408671693
35	NC_018749	AATCA	2	10	40015	40024	60 %	20 %	0 %	20 %	408671694
36	NC_018749	TAATG	2	10	40889	40898	40 %	40 %	20 %	0 %	408671694
37	NC_018749	AATTT	2	10	41158	41167	40 %	60 %	0 %	0 %	408671694
38	NC_018749	GTAAA	2	10	41170	41179	60 %	20 %	20 %	0 %	408671694
39	NC_018749	TCCAA	2	10	41881	41890	40 %	20 %	0 %	40 %	408671696
40	NC_018749	TTTAA	2	10	44937	44946	40 %	60 %	0 %	0 %	408671699
41	NC_018749	ATTAG	2	10	46053	46062	40 %	40 %	20 %	0 %	408671700
42	NC_018749	TTATA	2	10	48284	48293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018749	ATATG	2	10	48316	48325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018749	CAAAA	2	10	49266	49275	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018749	TTTCA	2	10	49324	49333	20 %	60 %	0 %	20 %	408671703
46	NC_018749	CTTTA	2	10	52933	52942	20 %	60 %	0 %	20 %	408671706
47	NC_018749	ATTCT	2	10	54145	54154	20 %	60 %	0 %	20 %	408671707
48	NC_018749	ATTTC	2	10	54322	54331	20 %	60 %	0 %	20 %	408671707
49	NC_018749	TTTGG	2	10	59012	59021	0 %	60 %	40 %	0 %	408671710
50	NC_018749	AAATC	2	10	59647	59656	60 %	20 %	0 %	20 %	408671711
51	NC_018749	TTTTC	2	10	62425	62434	0 %	80 %	0 %	20 %	408671713
52	NC_018749	GCTTT	2	10	62878	62887	0 %	60 %	20 %	20 %	408671713
53	NC_018749	ATTTT	2	10	63965	63974	20 %	80 %	0 %	0 %	408671714
54	NC_018749	ATTCG	2	10	64705	64714	20 %	40 %	20 %	20 %	408671715
55	NC_018749	TTTAT	2	10	64868	64877	20 %	80 %	0 %	0 %	408671715
56	NC_018749	TGCAA	2	10	66069	66078	40 %	20 %	20 %	20 %	408671716
57	NC_018749	TTTGT	2	10	67481	67490	0 %	80 %	20 %	0 %	408671717
58	NC_018749	ATTAC	2	10	68255	68264	40 %	40 %	0 %	20 %	408671717
59	NC_018749	ATTTA	2	10	68502	68511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018749	GCATT	2	10	70858	70867	20 %	40 %	20 %	20 %	408671718
61	NC_018749	ATTGA	2	10	72507	72516	40 %	40 %	20 %	0 %	408671719
62	NC_018749	GTTTT	2	10	80490	80499	0 %	80 %	20 %	0 %	408671726
63	NC_018749	TACAA	2	10	81392	81401	60 %	20 %	0 %	20 %	408671727
64	NC_018749	ATAAA	2	10	81792	81801	80 %	20 %	0 %	0 %	408671727
65	NC_018749	CAAAA	2	10	82251	82260	80 %	0 %	0 %	20 %	408671728
66	NC_018749	CAAAA	2	10	83899	83908	80 %	0 %	0 %	20 %	408671729
67	NC_018749	CATGT	2	10	87770	87779	20 %	40 %	20 %	20 %	408671730
68	NC_018749	TAAAA	2	10	88702	88711	80 %	20 %	0 %	0 %	408671731
69	NC_018749	TTAAC	2	10	89391	89400	40 %	40 %	0 %	20 %	408671731
70	NC_018749	TATTT	2	10	90900	90909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018749	ATACA	2	10	93079	93088	60 %	20 %	0 %	20 %	408671735
72	NC_018749	TATGC	2	10	94849	94858	20 %	40 %	20 %	20 %	408671736
73	NC_018749	AACAA	2	10	95375	95384	80 %	0 %	0 %	20 %	408671736
74	NC_018749	GAAAA	2	10	95440	95449	80 %	0 %	20 %	0 %	408671736
75	NC_018749	TGAAA	2	10	95864	95873	60 %	20 %	20 %	0 %	408671737
76	NC_018749	AAATG	2	10	96085	96094	60 %	20 %	20 %	0 %	408671737
77	NC_018749	ATTGG	2	10	99087	99096	20 %	40 %	40 %	0 %	408671739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.