MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 340

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018749	AATT	2	8	22	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018749	AACT	2	8	164	171	50 %	25 %	0 %	25 %	408671660
4	NC_018749	TTGT	3	12	370	381	0 %	75 %	25 %	0 %	408671660
5	NC_018749	AATA	2	8	596	603	75 %	25 %	0 %	0 %	408671660
6	NC_018749	TAGT	2	8	1900	1907	25 %	50 %	25 %	0 %	408671660
7	NC_018749	TTGA	2	8	2241	2248	25 %	50 %	25 %	0 %	408671660
8	NC_018749	TCAT	2	8	2628	2635	25 %	50 %	0 %	25 %	408671660
9	NC_018749	ATTT	2	8	2700	2707	25 %	75 %	0 %	0 %	408671661
10	NC_018749	ATAA	2	8	2835	2842	75 %	25 %	0 %	0 %	408671661
11	NC_018749	TTAA	2	8	2998	3005	50 %	50 %	0 %	0 %	408671661
12	NC_018749	TTCT	2	8	3180	3187	0 %	75 %	0 %	25 %	408671661
13	NC_018749	AATT	2	8	3225	3232	50 %	50 %	0 %	0 %	408671661
14	NC_018749	GCCA	2	8	3448	3455	25 %	0 %	25 %	50 %	408671661
15	NC_018749	AGTA	2	8	3615	3622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018749	TTCC	2	8	4190	4197	0 %	50 %	0 %	50 %	408671663
17	NC_018749	GGCA	2	8	4263	4270	25 %	0 %	50 %	25 %	408671663
18	NC_018749	GTTG	2	8	4398	4405	0 %	50 %	50 %	0 %	408671663
19	NC_018749	GTTT	2	8	4427	4434	0 %	75 %	25 %	0 %	408671663
20	NC_018749	ACGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	25 %	25 %	408671663
21	NC_018749	GATT	2	8	4878	4885	25 %	50 %	25 %	0 %	408671663
22	NC_018749	AAAG	2	8	5155	5162	75 %	0 %	25 %	0 %	408671663
23	NC_018749	TATT	2	8	5290	5297	25 %	75 %	0 %	0 %	408671663
24	NC_018749	TCAA	2	8	5737	5744	50 %	25 %	0 %	25 %	408671663
25	NC_018749	GGTC	2	8	5999	6006	0 %	25 %	50 %	25 %	408671663
26	NC_018749	GTAA	2	8	6448	6455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018749	GCTC	2	8	6813	6820	0 %	25 %	25 %	50 %	408671664
28	NC_018749	ACGG	2	8	7126	7133	25 %	0 %	50 %	25 %	408671664
29	NC_018749	TCGG	2	8	7491	7498	0 %	25 %	50 %	25 %	408671664
30	NC_018749	ATTT	2	8	7683	7690	25 %	75 %	0 %	0 %	408671665
31	NC_018749	ACCA	2	8	7801	7808	50 %	0 %	0 %	50 %	408671665
32	NC_018749	TACA	2	8	7963	7970	50 %	25 %	0 %	25 %	408671665
33	NC_018749	TGGT	2	8	8372	8379	0 %	50 %	50 %	0 %	408671666
34	NC_018749	GTTT	2	8	8918	8925	0 %	75 %	25 %	0 %	408671666
35	NC_018749	GCAA	2	8	9202	9209	50 %	0 %	25 %	25 %	408671666
36	NC_018749	TACC	2	8	9304	9311	25 %	25 %	0 %	50 %	408671666
37	NC_018749	TCAA	2	8	9617	9624	50 %	25 %	0 %	25 %	408671667
38	NC_018749	CTTT	2	8	9743	9750	0 %	75 %	0 %	25 %	408671667
39	NC_018749	AATA	2	8	10483	10490	75 %	25 %	0 %	0 %	408671668
40	NC_018749	ATTT	2	8	10696	10703	25 %	75 %	0 %	0 %	408671669
41	NC_018749	GCGA	2	8	10762	10769	25 %	0 %	50 %	25 %	408671669
42	NC_018749	CTTG	2	8	11653	11660	0 %	50 %	25 %	25 %	408671670
43	NC_018749	TACC	2	8	11706	11713	25 %	25 %	0 %	50 %	408671670
44	NC_018749	ACCC	2	8	13329	13336	25 %	0 %	0 %	75 %	408671671
45	NC_018749	CGTT	2	8	13511	13518	0 %	50 %	25 %	25 %	408671671
46	NC_018749	GGAA	2	8	13628	13635	50 %	0 %	50 %	0 %	408671671
47	NC_018749	TTTC	2	8	14413	14420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018749	GAAA	2	8	15425	15432	75 %	0 %	25 %	0 %	408671673
49	NC_018749	ATTA	2	8	15557	15564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018749	ATGT	2	8	15826	15833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018749	ACTA	2	8	15876	15883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018749	AATC	2	8	16003	16010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018749	GGCT	3	12	16319	16330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018749	GAAA	2	8	17112	17119	75 %	0 %	25 %	0 %	408671674
55	NC_018749	GATT	2	8	17281	17288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018749	TAAA	2	8	17461	17468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018749	AATT	2	8	17994	18001	50 %	50 %	0 %	0 %	408671675
58	NC_018749	TCAA	2	8	18150	18157	50 %	25 %	0 %	25 %	408671675
59	NC_018749	AGAA	2	8	18271	18278	75 %	0 %	25 %	0 %	408671675
60	NC_018749	TAAC	2	8	18499	18506	50 %	25 %	0 %	25 %	408671675
61	NC_018749	ACTA	2	8	18728	18735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018749	TGGT	2	8	18859	18866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018749	ATGT	2	8	19608	19615	25 %	50 %	25 %	0 %	408671676
64	NC_018749	CATC	2	8	19890	19897	25 %	25 %	0 %	50 %	408671676
65	NC_018749	TGCC	2	8	20130	20137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018749	TGAT	2	8	20215	20222	25 %	50 %	25 %	0 %	408671677
67	NC_018749	ATCA	2	8	20566	20573	50 %	25 %	0 %	25 %	408671677
68	NC_018749	CAAA	2	8	21030	21037	75 %	0 %	0 %	25 %	408671677
69	NC_018749	GTAT	2	8	21375	21382	25 %	50 %	25 %	0 %	408671677
70	NC_018749	ACGG	2	8	21388	21395	25 %	0 %	50 %	25 %	408671677
71	NC_018749	GATA	2	8	21411	21418	50 %	25 %	25 %	0 %	408671677
72	NC_018749	TCAA	2	8	21542	21549	50 %	25 %	0 %	25 %	408671677
73	NC_018749	ATTC	2	8	21624	21631	25 %	50 %	0 %	25 %	408671677
74	NC_018749	ATAG	2	8	21964	21971	50 %	25 %	25 %	0 %	408671677
75	NC_018749	TATT	2	8	21975	21982	25 %	75 %	0 %	0 %	408671677
76	NC_018749	CCAT	2	8	22530	22537	25 %	25 %	0 %	50 %	408671678
77	NC_018749	TTGT	2	8	22839	22846	0 %	75 %	25 %	0 %	408671678
78	NC_018749	CAAA	2	8	23000	23007	75 %	0 %	0 %	25 %	408671678
79	NC_018749	TGGA	2	8	25395	25402	25 %	25 %	50 %	0 %	408671680
80	NC_018749	AAAC	2	8	25818	25825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018749	TTGG	2	8	25983	25990	0 %	50 %	50 %	0 %	408671681
82	NC_018749	CAAT	2	8	26403	26410	50 %	25 %	0 %	25 %	408671681
83	NC_018749	CATA	2	8	26481	26488	50 %	25 %	0 %	25 %	408671681
84	NC_018749	AAAT	2	8	26514	26521	75 %	25 %	0 %	0 %	408671681
85	NC_018749	ATTT	2	8	26553	26560	25 %	75 %	0 %	0 %	408671681
86	NC_018749	CAAA	2	8	26785	26792	75 %	0 %	0 %	25 %	408671681
87	NC_018749	GATT	2	8	26998	27005	25 %	50 %	25 %	0 %	408671681
88	NC_018749	GGTA	2	8	27734	27741	25 %	25 %	50 %	0 %	408671682
89	NC_018749	GAAA	2	8	28001	28008	75 %	0 %	25 %	0 %	408671682
90	NC_018749	ATTT	2	8	29022	29029	25 %	75 %	0 %	0 %	408671682
91	NC_018749	AATA	2	8	29033	29040	75 %	25 %	0 %	0 %	408671682
92	NC_018749	TAGA	2	8	29238	29245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018749	TTGA	2	8	29488	29495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018749	TAAT	2	8	29519	29526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018749	ATTA	2	8	29780	29787	50 %	50 %	0 %	0 %	408671684
96	NC_018749	CAAT	2	8	29848	29855	50 %	25 %	0 %	25 %	408671684
97	NC_018749	ATGA	2	8	30006	30013	50 %	25 %	25 %	0 %	408671684
98	NC_018749	GATG	2	8	30158	30165	25 %	25 %	50 %	0 %	408671684
99	NC_018749	TGCC	2	8	30382	30389	0 %	25 %	25 %	50 %	408671684
100	NC_018749	TTGA	2	8	30570	30577	25 %	50 %	25 %	0 %	408671684
101	NC_018749	GATT	2	8	31138	31145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018749	TCAA	2	8	31684	31691	50 %	25 %	0 %	25 %	408671686
103	NC_018749	TTTA	2	8	31758	31765	25 %	75 %	0 %	0 %	408671686
104	NC_018749	TTTG	2	8	32231	32238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018749	GAAA	2	8	32797	32804	75 %	0 %	25 %	0 %	408671687
106	NC_018749	TAGT	2	8	32960	32967	25 %	50 %	25 %	0 %	408671687
107	NC_018749	AATG	2	8	33342	33349	50 %	25 %	25 %	0 %	408671687
108	NC_018749	TAGT	2	8	33386	33393	25 %	50 %	25 %	0 %	408671687
109	NC_018749	AATT	2	8	33626	33633	50 %	50 %	0 %	0 %	408671687
110	NC_018749	ATAA	2	8	34010	34017	75 %	25 %	0 %	0 %	408671687
111	NC_018749	TTTA	2	8	34255	34262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018749	CATT	2	8	34265	34272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018749	TGCA	2	8	34437	34444	25 %	25 %	25 %	25 %	408671689
114	NC_018749	ATAA	2	8	35398	35405	75 %	25 %	0 %	0 %	408671690
115	NC_018749	ACAA	2	8	35762	35769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018749	ATCA	2	8	35781	35788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018749	TAAA	2	8	35789	35796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018749	CTTA	2	8	36202	36209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018749	TCTA	2	8	36300	36307	25 %	50 %	0 %	25 %	408671692
120	NC_018749	CAAA	2	8	36365	36372	75 %	0 %	0 %	25 %	408671692
121	NC_018749	CAAG	2	8	36513	36520	50 %	0 %	25 %	25 %	408671692
122	NC_018749	AAAT	2	8	36525	36532	75 %	25 %	0 %	0 %	408671692
123	NC_018749	AAAT	2	8	36682	36689	75 %	25 %	0 %	0 %	408671692
124	NC_018749	GTTG	2	8	36828	36835	0 %	50 %	50 %	0 %	408671692
125	NC_018749	CTGA	2	8	37001	37008	25 %	25 %	25 %	25 %	408671692
126	NC_018749	ACAA	2	8	37017	37024	75 %	0 %	0 %	25 %	408671692
127	NC_018749	GATA	2	8	37297	37304	50 %	25 %	25 %	0 %	408671692
128	NC_018749	CAAA	2	8	38251	38258	75 %	0 %	0 %	25 %	408671693
129	NC_018749	TATT	2	8	38421	38428	25 %	75 %	0 %	0 %	408671693
130	NC_018749	GCTT	2	8	38961	38968	0 %	50 %	25 %	25 %	408671693
131	NC_018749	TGAA	2	8	39182	39189	50 %	25 %	25 %	0 %	408671693
132	NC_018749	TTAG	2	8	40314	40321	25 %	50 %	25 %	0 %	408671694
133	NC_018749	AAAT	2	8	41475	41482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018749	ATTG	2	8	41724	41731	25 %	50 %	25 %	0 %	408671695
135	NC_018749	ATAA	2	8	42204	42211	75 %	25 %	0 %	0 %	408671696
136	NC_018749	GTTT	2	8	42272	42279	0 %	75 %	25 %	0 %	408671697
137	NC_018749	ACAA	2	8	42361	42368	75 %	0 %	0 %	25 %	408671697
138	NC_018749	TTCA	2	8	42516	42523	25 %	50 %	0 %	25 %	408671697
139	NC_018749	TTCT	2	8	42997	43004	0 %	75 %	0 %	25 %	408671697
140	NC_018749	TCAA	2	8	43165	43172	50 %	25 %	0 %	25 %	408671697
141	NC_018749	ATCA	2	8	43266	43273	50 %	25 %	0 %	25 %	408671697
142	NC_018749	TCAA	2	8	43508	43515	50 %	25 %	0 %	25 %	408671697
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.