MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	AT	3	6	536	541	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
2	NC_018749	AT	3	6	1743	1748	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
3	NC_018749	AT	3	6	1965	1970	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
4	NC_018749	AT	3	6	2079	2084	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
5	NC_018749	TC	3	6	2469	2474	0 %	50 %	0 %	50 %	408671660
6	NC_018749	GA	3	6	3048	3053	50 %	0 %	50 %	0 %	408671661
7	NC_018749	AG	3	6	3687	3692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018749	AT	3	6	8291	8296	50 %	50 %	0 %	0 %	408671665
9	NC_018749	GT	3	6	10426	10431	0 %	50 %	50 %	0 %	408671668
10	NC_018749	TC	3	6	11951	11956	0 %	50 %	0 %	50 %	408671670
11	NC_018749	TG	3	6	12432	12437	0 %	50 %	50 %	0 %	408671670
12	NC_018749	AT	3	6	14781	14786	50 %	50 %	0 %	0 %	408671673
13	NC_018749	AC	3	6	16555	16560	50 %	0 %	0 %	50 %	408671674
14	NC_018749	AT	3	6	16627	16632	50 %	50 %	0 %	0 %	408671674
15	NC_018749	TA	3	6	16962	16967	50 %	50 %	0 %	0 %	408671674
16	NC_018749	TC	3	6	17257	17262	0 %	50 %	0 %	50 %	408671674
17	NC_018749	AT	3	6	17521	17526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018749	TA	3	6	17835	17840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018749	AT	4	8	17849	17856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018749	TA	3	6	17892	17897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018749	TA	3	6	18635	18640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018749	TA	3	6	18880	18885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018749	TG	3	6	19445	19450	0 %	50 %	50 %	0 %	408671676
24	NC_018749	CT	3	6	19696	19701	0 %	50 %	0 %	50 %	408671676
25	NC_018749	AT	3	6	20784	20789	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
26	NC_018749	AT	3	6	20960	20965	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
27	NC_018749	TA	3	6	21302	21307	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
28	NC_018749	AT	3	6	21658	21663	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
29	NC_018749	GA	3	6	22727	22732	50 %	0 %	50 %	0 %	408671678
30	NC_018749	TA	3	6	23641	23646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018749	AT	3	6	24031	24036	50 %	50 %	0 %	0 %	408671679
32	NC_018749	TA	3	6	24400	24405	50 %	50 %	0 %	0 %	408671679
33	NC_018749	AT	3	6	24835	24840	50 %	50 %	0 %	0 %	408671680
34	NC_018749	TA	3	6	25253	25258	50 %	50 %	0 %	0 %	408671680
35	NC_018749	TA	3	6	25298	25303	50 %	50 %	0 %	0 %	408671680
36	NC_018749	AT	3	6	25611	25616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018749	AT	3	6	27088	27093	50 %	50 %	0 %	0 %	408671681
38	NC_018749	TG	3	6	28376	28381	0 %	50 %	50 %	0 %	408671682
39	NC_018749	AT	3	6	29188	29193	50 %	50 %	0 %	0 %	408671682
40	NC_018749	AT	3	6	29654	29659	50 %	50 %	0 %	0 %	408671684
41	NC_018749	AT	3	6	29921	29926	50 %	50 %	0 %	0 %	408671684
42	NC_018749	TG	3	6	30369	30374	0 %	50 %	50 %	0 %	408671684
43	NC_018749	GA	3	6	30401	30406	50 %	0 %	50 %	0 %	408671684
44	NC_018749	AT	3	6	30564	30569	50 %	50 %	0 %	0 %	408671684
45	NC_018749	AT	3	6	31130	31135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018749	AT	3	6	31466	31471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018749	TA	3	6	32318	32323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018749	AC	3	6	32700	32705	50 %	0 %	0 %	50 %	408671687
49	NC_018749	CT	3	6	34088	34093	0 %	50 %	0 %	50 %	408671688
50	NC_018749	TG	3	6	34232	34237	0 %	50 %	50 %	0 %	408671688
51	NC_018749	TA	3	6	34248	34253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018749	AT	3	6	34631	34636	50 %	50 %	0 %	0 %	408671690
53	NC_018749	AG	3	6	35280	35285	50 %	0 %	50 %	0 %	408671690
54	NC_018749	AG	3	6	35683	35688	50 %	0 %	50 %	0 %	408671690
55	NC_018749	GA	3	6	35864	35869	50 %	0 %	50 %	0 %	408671691
56	NC_018749	AT	3	6	36082	36087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018749	TA	3	6	36381	36386	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
58	NC_018749	AC	3	6	36441	36446	50 %	0 %	0 %	50 %	408671692
59	NC_018749	AT	3	6	36572	36577	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
60	NC_018749	AT	3	6	36625	36630	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
61	NC_018749	TA	3	6	36840	36845	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
62	NC_018749	TA	3	6	37184	37189	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
63	NC_018749	TA	3	6	37193	37198	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
64	NC_018749	GA	3	6	37288	37293	50 %	0 %	50 %	0 %	408671692
65	NC_018749	AT	3	6	37399	37404	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
66	NC_018749	AT	3	6	39093	39098	50 %	50 %	0 %	0 %	408671693
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68	NC_018749	AG	3	6	40448	40453	50 %	0 %	50 %	0 %	408671694
69	NC_018749	AG	3	6	41402	41407	50 %	0 %	50 %	0 %	408671694
70	NC_018749	GA	3	6	41552	41557	50 %	0 %	50 %	0 %	408671695
71	NC_018749	AT	3	6	41909	41914	50 %	50 %	0 %	0 %	408671696
72	NC_018749	TA	3	6	42257	42262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74	NC_018749	GA	3	6	44230	44235	50 %	0 %	50 %	0 %	408671699
75	NC_018749	AT	3	6	44300	44305	50 %	50 %	0 %	0 %	408671699
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79	NC_018749	TA	3	6	45494	45499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018749	TA	3	6	45697	45702	50 %	50 %	0 %	0 %	408671700
81	NC_018749	TA	3	6	46951	46956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_018749	AT	3	6	48278	48283	50 %	50 %	0 %	0 %	408671702
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86	NC_018749	GA	3	6	50284	50289	50 %	0 %	50 %	0 %	408671703
87	NC_018749	TA	3	6	50352	50357	50 %	50 %	0 %	0 %	408671703
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90	NC_018749	AT	3	6	57419	57424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018749	AT	3	6	61012	61017	50 %	50 %	0 %	0 %	408671711
92	NC_018749	TA	3	6	61698	61703	50 %	50 %	0 %	0 %	408671712
93	NC_018749	AC	3	6	62597	62602	50 %	0 %	0 %	50 %	408671713
94	NC_018749	GA	3	6	62659	62664	50 %	0 %	50 %	0 %	408671713
95	NC_018749	TA	3	6	63025	63030	50 %	50 %	0 %	0 %	408671713
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102	NC_018749	AT	3	6	71230	71235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_018749	AT	3	6	73079	73084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_018749	TA	3	6	75814	75819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_018749	AT	3	6	76086	76091	50 %	50 %	0 %	0 %	408671724
109	NC_018749	TA	3	6	76195	76200	50 %	50 %	0 %	0 %	408671724
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111	NC_018749	TG	3	6	77490	77495	0 %	50 %	50 %	0 %	408671725
112	NC_018749	CA	3	6	78949	78954	50 %	0 %	0 %	50 %	408671726
113	NC_018749	AT	3	6	79498	79503	50 %	50 %	0 %	0 %	408671726
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118	NC_018749	CA	3	6	83291	83296	50 %	0 %	0 %	50 %	408671728
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120	NC_018749	CT	3	6	84038	84043	0 %	50 %	0 %	50 %	408671729
121	NC_018749	GA	3	6	84369	84374	50 %	0 %	50 %	0 %	408671729
122	NC_018749	CA	3	6	85199	85204	50 %	0 %	0 %	50 %	408671729
123	NC_018749	CA	3	6	87859	87864	50 %	0 %	0 %	50 %	408671730
124	NC_018749	GA	3	6	87879	87884	50 %	0 %	50 %	0 %	408671730
125	NC_018749	TG	3	6	88030	88035	0 %	50 %	50 %	0 %	408671730
126	NC_018749	CA	3	6	88482	88487	50 %	0 %	0 %	50 %	408671731
127	NC_018749	GA	3	6	88687	88692	50 %	0 %	50 %	0 %	408671731
128	NC_018749	AT	3	6	91010	91015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018749	TA	3	6	91571	91576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_018749	TC	3	6	92214	92219	0 %	50 %	0 %	50 %	408671734
132	NC_018749	AT	3	6	94062	94067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018749	TG	3	6	94370	94375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018749	AG	3	6	96691	96696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018749	TG	3	6	96958	96963	0 %	50 %	50 %	0 %	408671738
136	NC_018749	CT	3	6	98576	98581	0 %	50 %	0 %	50 %	408671739
137	NC_018749	TG	3	6	98872	98877	0 %	50 %	50 %	0 %	408671739
138	NC_018749	TG	3	6	98937	98942	0 %	50 %	50 %	0 %	408671739
139	NC_018749	AT	4	8	100229	100236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018749	CA	3	6	100306	100311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.