MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL02

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018749	AT	3	6	536	541	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
2	NC_018749	AT	3	6	1743	1748	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
3	NC_018749	AT	3	6	1965	1970	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
4	NC_018749	AT	3	6	2079	2084	50 %	50 %	0 %	0 %	408671660
5	NC_018749	TC	3	6	2469	2474	0 %	50 %	0 %	50 %	408671660
6	NC_018749	GA	3	6	3048	3053	50 %	0 %	50 %	0 %	408671661
7	NC_018749	AT	3	6	8291	8296	50 %	50 %	0 %	0 %	408671665
8	NC_018749	GT	3	6	10426	10431	0 %	50 %	50 %	0 %	408671668
9	NC_018749	TC	3	6	11951	11956	0 %	50 %	0 %	50 %	408671670
10	NC_018749	TG	3	6	12432	12437	0 %	50 %	50 %	0 %	408671670
11	NC_018749	AT	3	6	14781	14786	50 %	50 %	0 %	0 %	408671673
12	NC_018749	AC	3	6	16555	16560	50 %	0 %	0 %	50 %	408671674
13	NC_018749	AT	3	6	16627	16632	50 %	50 %	0 %	0 %	408671674
14	NC_018749	TA	3	6	16962	16967	50 %	50 %	0 %	0 %	408671674
15	NC_018749	TC	3	6	17257	17262	0 %	50 %	0 %	50 %	408671674
16	NC_018749	TG	3	6	19445	19450	0 %	50 %	50 %	0 %	408671676
17	NC_018749	CT	3	6	19696	19701	0 %	50 %	0 %	50 %	408671676
18	NC_018749	AT	3	6	20784	20789	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
19	NC_018749	AT	3	6	20960	20965	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
20	NC_018749	TA	3	6	21302	21307	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
21	NC_018749	AT	3	6	21658	21663	50 %	50 %	0 %	0 %	408671677
22	NC_018749	GA	3	6	22727	22732	50 %	0 %	50 %	0 %	408671678
23	NC_018749	AT	3	6	24031	24036	50 %	50 %	0 %	0 %	408671679
24	NC_018749	TA	3	6	24400	24405	50 %	50 %	0 %	0 %	408671679
25	NC_018749	AT	3	6	24835	24840	50 %	50 %	0 %	0 %	408671680
26	NC_018749	TA	3	6	25253	25258	50 %	50 %	0 %	0 %	408671680
27	NC_018749	TA	3	6	25298	25303	50 %	50 %	0 %	0 %	408671680
28	NC_018749	AT	3	6	27088	27093	50 %	50 %	0 %	0 %	408671681
29	NC_018749	TG	3	6	28376	28381	0 %	50 %	50 %	0 %	408671682
30	NC_018749	AT	3	6	29188	29193	50 %	50 %	0 %	0 %	408671682
31	NC_018749	AT	3	6	29654	29659	50 %	50 %	0 %	0 %	408671684
32	NC_018749	AT	3	6	29921	29926	50 %	50 %	0 %	0 %	408671684
33	NC_018749	TG	3	6	30369	30374	0 %	50 %	50 %	0 %	408671684
34	NC_018749	GA	3	6	30401	30406	50 %	0 %	50 %	0 %	408671684
35	NC_018749	AT	3	6	30564	30569	50 %	50 %	0 %	0 %	408671684
36	NC_018749	AC	3	6	32700	32705	50 %	0 %	0 %	50 %	408671687
37	NC_018749	CT	3	6	34088	34093	0 %	50 %	0 %	50 %	408671688
38	NC_018749	TG	3	6	34232	34237	0 %	50 %	50 %	0 %	408671688
39	NC_018749	AT	3	6	34631	34636	50 %	50 %	0 %	0 %	408671690
40	NC_018749	AG	3	6	35280	35285	50 %	0 %	50 %	0 %	408671690
41	NC_018749	AG	3	6	35683	35688	50 %	0 %	50 %	0 %	408671690
42	NC_018749	GA	3	6	35864	35869	50 %	0 %	50 %	0 %	408671691
43	NC_018749	TA	3	6	36381	36386	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
44	NC_018749	AC	3	6	36441	36446	50 %	0 %	0 %	50 %	408671692
45	NC_018749	AT	3	6	36572	36577	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
46	NC_018749	AT	3	6	36625	36630	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
47	NC_018749	TA	3	6	36840	36845	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
48	NC_018749	TA	3	6	37184	37189	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
49	NC_018749	TA	3	6	37193	37198	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
50	NC_018749	GA	3	6	37288	37293	50 %	0 %	50 %	0 %	408671692
51	NC_018749	AT	3	6	37399	37404	50 %	50 %	0 %	0 %	408671692
52	NC_018749	AT	3	6	39093	39098	50 %	50 %	0 %	0 %	408671693
53	NC_018749	CA	3	6	39216	39221	50 %	0 %	0 %	50 %	408671693
54	NC_018749	AG	3	6	40448	40453	50 %	0 %	50 %	0 %	408671694
55	NC_018749	AG	3	6	41402	41407	50 %	0 %	50 %	0 %	408671694
56	NC_018749	GA	3	6	41552	41557	50 %	0 %	50 %	0 %	408671695
57	NC_018749	AT	3	6	41909	41914	50 %	50 %	0 %	0 %	408671696
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60	NC_018749	AT	3	6	44300	44305	50 %	50 %	0 %	0 %	408671699
61	NC_018749	TA	3	6	44380	44385	50 %	50 %	0 %	0 %	408671699
62	NC_018749	CT	3	6	44536	44541	0 %	50 %	0 %	50 %	408671699
63	NC_018749	TC	3	6	45022	45027	0 %	50 %	0 %	50 %	408671699
64	NC_018749	TA	3	6	45697	45702	50 %	50 %	0 %	0 %	408671700
65	NC_018749	TG	3	6	47349	47354	0 %	50 %	50 %	0 %	408671701
66	NC_018749	AT	3	6	48278	48283	50 %	50 %	0 %	0 %	408671702
67	NC_018749	AT	3	6	49810	49815	50 %	50 %	0 %	0 %	408671703
68	NC_018749	GA	3	6	50284	50289	50 %	0 %	50 %	0 %	408671703
69	NC_018749	TA	3	6	50352	50357	50 %	50 %	0 %	0 %	408671703
70	NC_018749	TA	3	6	51612	51617	50 %	50 %	0 %	0 %	408671705
71	NC_018749	GA	3	6	55419	55424	50 %	0 %	50 %	0 %	408671708
72	NC_018749	AT	3	6	61012	61017	50 %	50 %	0 %	0 %	408671711
73	NC_018749	TA	3	6	61698	61703	50 %	50 %	0 %	0 %	408671712
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79	NC_018749	AT	3	6	66154	66159	50 %	50 %	0 %	0 %	408671716
80	NC_018749	TA	3	6	67119	67124	50 %	50 %	0 %	0 %	408671717
81	NC_018749	AT	3	6	67189	67194	50 %	50 %	0 %	0 %	408671717
82	NC_018749	TA	3	6	68472	68477	50 %	50 %	0 %	0 %	408671717
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87	NC_018749	TA	3	6	76195	76200	50 %	50 %	0 %	0 %	408671724
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91	NC_018749	AT	3	6	79498	79503	50 %	50 %	0 %	0 %	408671726
92	NC_018749	CA	3	6	80501	80506	50 %	0 %	0 %	50 %	408671726
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95	NC_018749	AT	3	6	82906	82911	50 %	50 %	0 %	0 %	408671728
96	NC_018749	CA	3	6	83291	83296	50 %	0 %	0 %	50 %	408671728
97	NC_018749	TC	3	6	83957	83962	0 %	50 %	0 %	50 %	408671729
98	NC_018749	CT	3	6	84038	84043	0 %	50 %	0 %	50 %	408671729
99	NC_018749	GA	3	6	84369	84374	50 %	0 %	50 %	0 %	408671729
100	NC_018749	CA	3	6	85199	85204	50 %	0 %	0 %	50 %	408671729
101	NC_018749	CA	3	6	87859	87864	50 %	0 %	0 %	50 %	408671730
102	NC_018749	GA	3	6	87879	87884	50 %	0 %	50 %	0 %	408671730
103	NC_018749	TG	3	6	88030	88035	0 %	50 %	50 %	0 %	408671730
104	NC_018749	CA	3	6	88482	88487	50 %	0 %	0 %	50 %	408671731
105	NC_018749	GA	3	6	88687	88692	50 %	0 %	50 %	0 %	408671731
106	NC_018749	TC	3	6	92022	92027	0 %	50 %	0 %	50 %	408671734
107	NC_018749	TC	3	6	92214	92219	0 %	50 %	0 %	50 %	408671734
108	NC_018749	TG	3	6	96958	96963	0 %	50 %	50 %	0 %	408671738
109	NC_018749	CT	3	6	98576	98581	0 %	50 %	0 %	50 %	408671739
110	NC_018749	TG	3	6	98872	98877	0 %	50 %	50 %	0 %	408671739
111	NC_018749	TG	3	6	98937	98942	0 %	50 %	50 %	0 %	408671739

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.