MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018748	ACCTAA	2	12	31384	31395	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018748	ATTTAA	2	12	79079	79090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018748	AATTTT	2	12	79144	79155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018748	AGAAAA	2	12	118618	118629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018748	CTTTAA	2	12	141465	141476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018748	TTTGAA	2	12	188712	188723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018748	TTTTAT	2	12	194988	194999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018748	CAGGGG	2	12	233848	233859	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018748	CGAAGC	2	12	239348	239359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018748	CATTTA	2	12	260445	260456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018748	TTAAAT	2	12	269433	269444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018748	TTATTT	2	12	285311	285322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018748	ATACAA	2	12	290030	290041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018748	TGATTT	2	12	314640	314651	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018748	ATTTTT	2	12	381808	381819	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018748	GTTTCT	2	12	411027	411038	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018748	TAAAAT	2	12	432404	432415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018748	ATTTTA	2	12	455413	455424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018748	TATTTT	2	12	459099	459110	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018748	CTTTAT	2	12	520870	520881	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018748	ATAAAA	2	12	542602	542613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018748	TACAAA	2	12	542677	542688	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018748	TAAGAT	2	12	549423	549434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018748	AATAAA	2	12	585908	585919	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018748	ACATTA	2	12	586781	586792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018748	AATCTT	2	12	592211	592222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018748	CAATAG	2	12	628391	628402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018748	AAAAAT	2	12	631285	631296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018748	AAATAT	2	12	643058	643069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018748	AATCCT	2	12	654721	654732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018748	TGCTTT	2	12	697276	697287	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018748	ATTTTC	2	12	697294	697305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018748	AAAGAT	2	12	790379	790390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018748	ATTACA	2	12	807970	807981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018748	AATCTA	2	12	824457	824468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018748	ATAACA	2	12	843928	843939	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018748	GAAAAA	2	12	886799	886810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018748	ACCTAA	2	12	901799	901810	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018748	TAATTT	2	12	909078	909089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018748	CAAGCC	2	12	984775	984786	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018748	TAGAAA	2	12	1029896	1029907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018748	GAAAAT	2	12	1058545	1058556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018748	TGATTC	2	12	1138709	1138720	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018748	TTACTG	2	12	1197107	1197118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018748	ATTTAT	2	12	1205311	1205322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018748	AAAAGG	2	12	1205483	1205494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018748	TTATAA	2	12	1282040	1282051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018748	ATTCAA	2	12	1285037	1285048	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018748	CTATTT	2	12	1288601	1288612	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018748	TTTTTC	2	12	1318235	1318246	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018748	AAATCA	2	12	1330027	1330038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018748	ATTTTT	2	12	1330793	1330804	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018748	TTTTTA	2	12	1334873	1334884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018748	TTAATG	2	12	1370082	1370093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018748	TTCTAT	2	12	1378277	1378288	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018748	TTTTTA	2	12	1402132	1402143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018748	ACTTTT	2	12	1405128	1405139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018748	CTTACG	2	12	1411475	1411486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018748	CATGCT	2	12	1414416	1414427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018748	CTCCGT	2	12	1414454	1414465	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018748	CCCTCA	2	12	1414549	1414560	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018748	GTTTAT	2	12	1423202	1423213	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018748	TCATTT	2	12	1484463	1484474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018748	ATGGAT	2	12	1526654	1526665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018748	GCTTCG	2	12	1551763	1551774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018748	ATTTTT	2	12	1604256	1604267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018748	TGATTT	2	12	1608405	1608416	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018748	TAATTT	2	12	1636956	1636967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018748	TTTGAA	2	12	1690121	1690132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018748	CAAAAA	2	12	1721287	1721298	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018748	ATAGAG	2	12	1724974	1724985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018748	TGAGTT	2	12	1736297	1736308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018748	ATTAAA	2	12	1788823	1788834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018748	AGTTTT	2	12	1833585	1833596	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018748	AGTACC	2	12	1846182	1846193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018748	ACAGGA	2	12	1855412	1855423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018748	TAAAAA	2	12	1879291	1879302	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018748	ATTTTC	2	12	1950336	1950347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018748	ATGAAT	2	12	1970962	1970973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018748	TATAAA	2	12	1991585	1991596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018748	AAGTTT	2	12	1995098	1995109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018748	TATTTT	2	12	1998245	1998256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018748	TTTTTC	2	12	2009599	2009610	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018748	CCTAAG	2	12	2009698	2009709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018748	AAAATT	2	12	2028824	2028835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018748	TCGAAG	2	12	2056302	2056313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018748	ATAATT	2	12	2071890	2071901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018748	AAGTAA	2	12	2079517	2079528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018748	TATATG	2	12	2090595	2090606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018748	AACCCT	2	12	2092356	2092367	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018748	GAAATT	2	12	2121547	2121558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018748	TGAGGG	2	12	2128710	2128721	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018748	CGTAAG	2	12	2131769	2131780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018748	TGAAAT	2	12	2195761	2195772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018748	TAATTC	2	12	2242155	2242166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018748	AAATTT	2	12	2262196	2262207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018748	GCTTCG	2	12	2365583	2365594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018748	TCAACT	2	12	2369385	2369396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018748	AATTCA	2	12	2376963	2376974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018748	CTTGAA	2	12	2398153	2398164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018748	TAAAAG	2	12	2423018	2423029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018748	TATACT	2	12	2436453	2436464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018748	ATTTTT	2	12	2494893	2494904	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018748	TACATT	2	12	2504330	2504341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018748	AAATTT	2	12	2534276	2534287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018748	TTTCTT	2	12	2537945	2537956	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018748	GCTTTT	2	12	2540802	2540813	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018748	TTCAAA	2	12	2572760	2572771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018748	ATATTT	2	12	2593902	2593913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018748	AAAACA	2	12	2615315	2615326	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018748	CAAAAA	2	12	2651324	2651335	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018748	TAAGTT	2	12	2776585	2776596	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018748	AAATAT	2	12	2776640	2776651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018748	AAACTA	2	12	2798384	2798395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018748	AATCCT	2	12	2861804	2861815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018748	ACACAA	2	12	2901415	2901426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018748	GATTTA	2	12	2921588	2921599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018748	TCAAAA	2	12	2923297	2923308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018748	TTATGT	2	12	2971575	2971586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018748	TTTATT	2	12	3063499	3063510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018748	CAAATT	2	12	3127560	3127571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018748	CTGCTC	2	12	3210190	3210201	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018748	CTTTAT	2	12	3210600	3210611	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018748	GATAAA	2	12	3406831	3406842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018748	CTCCGG	2	12	3407077	3407088	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018748	CAAAAA	2	12	3407094	3407105	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_018748	AATTAA	2	12	3414678	3414689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.