MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 chromosome

Total Repeats: 1792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018748	AGCCAA	2	12	3861	3872	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671772
2	NC_018748	TCCTGT	2	12	6785	6796	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408671775
3	NC_018748	CACTCA	2	12	9603	9614	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	408671776
4	NC_018748	TTTCAT	2	12	11797	11808	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408671779
5	NC_018748	GAGCAG	2	12	11899	11910	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408671779
6	NC_018748	CTTCTG	2	12	17117	17128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408671783
7	NC_018748	TTTGAT	2	12	19192	19203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408671785
8	NC_018748	TGCTCT	2	12	20537	20548	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408671787
9	NC_018748	ACGCTT	3	18	22270	22287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408671787
10	NC_018748	TTGATT	2	12	22513	22524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408671787
11	NC_018748	CGGAGT	2	12	22855	22866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408671787
12	NC_018748	ATTTAT	2	12	29210	29221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671793
13	NC_018748	AATTAA	2	12	34853	34864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671799
14	NC_018748	TTCAAG	2	12	35887	35898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671801
15	NC_018748	CACCCC	2	12	37494	37505	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	408671801
16	NC_018748	ATTCAA	2	12	45147	45158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671809
17	NC_018748	ATTGAA	2	12	46403	46414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671810
18	NC_018748	ATGCTG	2	12	47088	47099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408671811
19	NC_018748	TTTATT	2	12	53459	53470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408671816
20	NC_018748	TAAAAT	2	12	58237	58248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671822
21	NC_018748	AGAAAA	2	12	58249	58260	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408671822
22	NC_018748	TCTTTG	2	12	60325	60336	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408671824
23	NC_018748	TCAAAA	2	12	69779	69790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671834
24	NC_018748	GTTGGA	2	12	71988	71999	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408671835
25	NC_018748	AATGAC	2	12	76825	76836	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408671837
26	NC_018748	TAATTG	2	12	76866	76877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671837
27	NC_018748	GTAATT	2	12	79808	79819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671840
28	NC_018748	TCCTTC	2	12	91893	91904	0 %	50 %	0 %	50 %	408671850
29	NC_018748	GTTTCT	2	12	93128	93139	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408671851
30	NC_018748	CAAACT	2	12	97057	97068	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408671852
31	NC_018748	TTATTT	2	12	100492	100503	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408671856
32	NC_018748	GATTCA	2	12	100736	100747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671856
33	NC_018748	TATTTA	2	12	101130	101141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671856
34	NC_018748	AAGCAA	2	12	102988	102999	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408671858
35	NC_018748	ATCAAA	2	12	105553	105564	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671860
36	NC_018748	TCAAAA	2	12	113969	113980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671866
37	NC_018748	TCAATT	2	12	120468	120479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671873
38	NC_018748	GAAAGT	2	12	121131	121142	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408671873
39	NC_018748	CATTTG	2	12	121519	121530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408671873
40	NC_018748	GAATCC	2	12	122335	122346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408671874
41	NC_018748	AGAACG	2	12	123560	123571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408671875
42	NC_018748	TTTTTA	2	12	124699	124710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408671876
43	NC_018748	AAATCT	2	12	125812	125823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671876
44	NC_018748	CTGTTA	2	12	126569	126580	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408671876
45	NC_018748	TAATGA	2	12	133647	133658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671884
46	NC_018748	ATACCA	2	12	140694	140705	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408671888
47	NC_018748	GGCAAA	2	12	140952	140963	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408671888
48	NC_018748	GTAAAG	2	12	142008	142019	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408671890
49	NC_018748	ATTTTA	2	12	143160	143171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671890
50	NC_018748	CAATTT	2	12	147745	147756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671893
51	NC_018748	ATGCTG	2	12	154579	154590	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408671897
52	NC_018748	AAAGTG	2	12	156501	156512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408671899
53	NC_018748	TTTCAA	2	12	162415	162426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671904
54	NC_018748	TGCTCC	2	12	162830	162841	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408671904
55	NC_018748	AATTAA	2	12	165043	165054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671907
56	NC_018748	TCGACT	2	12	166345	166356	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408671910
57	NC_018748	GACCCA	2	12	166374	166385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408671910
58	NC_018748	TGGAGA	2	12	168645	168656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408671912
59	NC_018748	CAATTC	2	12	169052	169063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671913
60	NC_018748	ATCAGT	2	12	173770	173781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671918
61	NC_018748	ATTTGT	2	12	175951	175962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408671919
62	NC_018748	AATTGT	2	12	176262	176273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671919
63	NC_018748	TAAATC	2	12	178762	178773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671921
64	NC_018748	TTTTGC	2	12	179078	179089	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408671921
65	NC_018748	AGTGTA	2	12	182396	182407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671927
66	NC_018748	AATCAT	2	12	183543	183554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671928
67	NC_018748	TTTTTG	2	12	189272	189283	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	408671939
68	NC_018748	CTGTAA	2	12	193058	193069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671946
69	NC_018748	CGATTT	2	12	193097	193108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408671946
70	NC_018748	GAATTA	2	12	203708	203719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671954
71	NC_018748	AGTACA	2	12	205976	205987	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408671956
72	NC_018748	TTACTA	2	12	206924	206935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671957
73	NC_018748	TTTGGC	2	12	207457	207468	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408671957
74	NC_018748	AATAAA	2	12	210255	210266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408671960
75	NC_018748	CATGAG	2	12	214664	214675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408671966
76	NC_018748	GCAACA	2	12	221682	221693	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671970
77	NC_018748	TATAAT	2	12	222813	222824	50 %	50 %	0 %	0 %	408671971
78	NC_018748	GCCAAA	2	12	222837	222848	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671971
79	NC_018748	TAATGC	2	12	223156	223167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671972
80	NC_018748	ATTCAA	2	12	223356	223367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671972
81	NC_018748	TGAAGT	2	12	224827	224838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671972
82	NC_018748	AAAGAC	2	12	225513	225524	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408671974
83	NC_018748	TTTTTA	2	12	225798	225809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408671974
84	NC_018748	AAAAGC	2	12	235766	235777	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408671980
85	NC_018748	AAAAAT	2	12	236951	236962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408671981
86	NC_018748	TGCAGG	2	12	237241	237252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408671981
87	NC_018748	TAGCAA	2	12	238455	238466	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408671982
88	NC_018748	TAAACC	2	12	238645	238656	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408671982
89	NC_018748	TGAAAT	2	12	248915	248926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671992
90	NC_018748	GAAGCA	2	12	249797	249808	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408671993
91	NC_018748	TACAAA	2	12	250169	250180	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671993
92	NC_018748	AAGTAA	2	12	251061	251072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408671993
93	NC_018748	GCCAGA	2	12	256704	256715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408672000
94	NC_018748	AAAGTA	2	12	257721	257732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408672001
95	NC_018748	AAGATT	2	12	258038	258049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408672002
96	NC_018748	AATCAA	2	12	267531	267542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408672010
97	NC_018748	TGGAAT	2	12	271622	271633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408672014
98	NC_018748	TGCTCT	2	12	271781	271792	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408672014
99	NC_018748	TACGTT	2	12	273834	273845	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408672015
100	NC_018748	TAACCA	2	12	274504	274515	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408672015
101	NC_018748	ACTTTT	2	12	276931	276942	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408672016
102	NC_018748	CATTTC	2	12	282038	282049	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408672025
103	NC_018748	ATTGGC	2	12	288892	288903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408672030
104	NC_018748	CCGATG	2	12	290344	290355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408672032
105	NC_018748	AAAAGC	2	12	290375	290386	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408672032
106	NC_018748	CCATGG	2	12	290728	290739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408672032
107	NC_018748	TTCCCG	2	12	293652	293663	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408672035
108	NC_018748	CCAATC	2	12	296101	296112	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	408672037
109	NC_018748	ACTCAA	2	12	299200	299211	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408672040
110	NC_018748	TCCTAT	2	12	311446	311457	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408672055
111	NC_018748	ACGTGG	2	12	313485	313496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408672057
112	NC_018748	TGATAT	2	12	313737	313748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408672057
113	NC_018748	TTTTAG	2	12	319154	319165	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408672062
114	NC_018748	TCTGCA	2	12	323582	323593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408672066
115	NC_018748	AATTGT	2	12	327076	327087	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408672069
116	NC_018748	CAATAC	2	12	329141	329152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408672070
117	NC_018748	CCTAAA	2	12	329716	329727	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408672070
118	NC_018748	ACATTC	2	12	334514	334525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408672073
119	NC_018748	AGCCAA	2	12	335004	335015	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408672074
120	NC_018748	ATGATA	2	12	337516	337527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408672075
121	NC_018748	AAATTA	2	12	344981	344992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408672081
122	NC_018748	GTTCAA	2	12	349281	349292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408672084
123	NC_018748	TAAAGT	2	12	350528	350539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408672085
124	NC_018748	GAAGTT	2	12	352254	352265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408672086
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138	NC_018748	CTTGAA	2	12	398073	398084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408672127
139	NC_018748	AAATCC	2	12	398844	398855	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408672128
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219	NC_018748	TAAAGT	2	12	582951	582962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408672273
220	NC_018748	TGCTTT	2	12	586214	586225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408672276
221	NC_018748	AACGGA	2	12	587261	587272	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408672277
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223	NC_018748	GCTGTA	2	12	590489	590500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408672278
224	NC_018748	ATTGAT	2	12	595563	595574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408672281
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227	NC_018748	GCCATT	2	12	601870	601881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408672287
228	NC_018748	GAGCAT	2	12	604402	604413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408672290
229	NC_018748	CCCAGC	2	12	604487	604498	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	408672290
230	NC_018748	TTAATT	2	12	606820	606831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408672291
231	NC_018748	TGATAC	2	12	607418	607429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408672292
232	NC_018748	GAAAAA	2	12	610191	610202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408672293
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458	NC_018748	TTTTAG	2	12	1263047	1263058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408672820
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