MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 chromosome

Total Repeats: 58250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018748	GAT	2	6	158	163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671770
2	NC_018748	GAG	2	6	282	287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671770
3	NC_018748	CTA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
4	NC_018748	TTG	2	6	358	363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671770
5	NC_018748	CCT	2	6	414	419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671770
6	NC_018748	CTC	2	6	427	432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671770
7	NC_018748	TGC	2	6	581	586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671770
8	NC_018748	CTT	2	6	619	624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671770
9	NC_018748	TCA	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
10	NC_018748	TCA	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
11	NC_018748	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671770
12	NC_018748	ATT	2	6	828	833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
13	NC_018748	GAT	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671770
14	NC_018748	TTC	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671770
15	NC_018748	TCA	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671770
16	NC_018748	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671770
17	NC_018748	ATT	2	6	1157	1162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
18	NC_018748	ATT	2	6	1266	1271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
19	NC_018748	CCG	2	6	1303	1308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671770
20	NC_018748	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671770
21	NC_018748	ATA	2	6	1532	1537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671770
22	NC_018748	GAT	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671771
23	NC_018748	ATG	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671771
24	NC_018748	ACT	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671771
25	NC_018748	TGG	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671771
26	NC_018748	AAT	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671771
27	NC_018748	CAT	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671771
28	NC_018748	TCA	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671771
29	NC_018748	TTC	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671771
30	NC_018748	AAT	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671771
31	NC_018748	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671771
32	NC_018748	ACC	2	6	2416	2421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671771
33	NC_018748	TCC	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671771
34	NC_018748	TTC	2	6	2568	2573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671771
35	NC_018748	ATT	2	6	2649	2654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671771
36	NC_018748	CTT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671772
37	NC_018748	AGA	2	6	3090	3095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671772
38	NC_018748	AGA	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671772
39	NC_018748	TGA	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671772
40	NC_018748	GCA	2	6	3484	3489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671772
41	NC_018748	CAC	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671772
42	NC_018748	ATA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671772
43	NC_018748	TGC	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671772
44	NC_018748	GAA	2	6	3957	3962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671772
45	NC_018748	CTT	2	6	4083	4088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671773
46	NC_018748	TAT	2	6	4128	4133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671773
47	NC_018748	GAA	2	6	4185	4190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
48	NC_018748	GAA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
49	NC_018748	CGA	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671773
50	NC_018748	ATT	2	6	4467	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671773
51	NC_018748	GAA	2	6	4488	4493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
52	NC_018748	AAG	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671773
53	NC_018748	ATA	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671773
54	NC_018748	GAA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671774
55	NC_018748	TGA	2	6	4865	4870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
56	NC_018748	AAG	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671774
57	NC_018748	ATA	2	6	4939	4944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
58	NC_018748	TGA	2	6	5033	5038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
59	NC_018748	AAT	2	6	5102	5107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
60	NC_018748	GCA	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671774
61	NC_018748	TAT	2	6	5126	5131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671774
62	NC_018748	TAA	2	6	5134	5139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
63	NC_018748	TGG	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671774
64	NC_018748	TAT	2	6	5154	5159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671774
65	NC_018748	TAA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
66	NC_018748	TGA	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
67	NC_018748	TCA	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671774
68	NC_018748	GTA	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
69	NC_018748	CTT	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671774
70	NC_018748	TGA	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671774
71	NC_018748	GTG	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671774
72	NC_018748	AAT	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
73	NC_018748	AAC	2	6	5653	5658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671774
74	NC_018748	GCT	2	6	5712	5717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671774
75	NC_018748	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671774
76	NC_018748	ATA	3	9	5886	5894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671774
77	NC_018748	CCT	2	6	6158	6163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671775
78	NC_018748	AGT	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671775
79	NC_018748	AAG	2	6	6223	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671775
80	NC_018748	TAA	2	6	6440	6445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
81	NC_018748	ATT	2	6	6447	6452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671775
82	NC_018748	GAT	2	6	6621	6626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671775
83	NC_018748	AAG	2	6	6667	6672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671775
84	NC_018748	GAA	2	6	6711	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671775
85	NC_018748	TTC	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671775
86	NC_018748	AGC	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671775
87	NC_018748	TAA	2	6	6824	6829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
88	NC_018748	CAT	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671775
89	NC_018748	TGC	2	6	7103	7108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671775
90	NC_018748	GAC	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671775
91	NC_018748	GGT	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671775
92	NC_018748	TTA	2	6	7513	7518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671775
93	NC_018748	TGC	2	6	7520	7525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671775
94	NC_018748	TGG	2	6	7562	7567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671775
95	NC_018748	AAT	2	6	7572	7577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
96	NC_018748	GCA	2	6	7590	7595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671775
97	NC_018748	TGC	2	6	7751	7756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671775
98	NC_018748	ATG	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671775
99	NC_018748	ACT	2	6	7872	7877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671775
100	NC_018748	TGG	2	6	7901	7906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671775
101	NC_018748	GAA	2	6	8031	8036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671775
102	NC_018748	ACA	2	6	8330	8335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671775
103	NC_018748	TAT	2	6	8340	8345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671775
104	NC_018748	ATA	2	6	8416	8421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
105	NC_018748	GCA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671775
106	NC_018748	TAT	2	6	8555	8560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671775
107	NC_018748	AAT	2	6	8568	8573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
108	NC_018748	TGC	2	6	8612	8617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671775
109	NC_018748	AAT	2	6	8754	8759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
110	NC_018748	ATT	2	6	8836	8841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671775
111	NC_018748	GTG	2	6	8943	8948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671775
112	NC_018748	GTT	2	6	8961	8966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671775
113	NC_018748	AAC	2	6	9021	9026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671775
114	NC_018748	AAT	2	6	9126	9131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671775
115	NC_018748	CGA	2	6	9201	9206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671775
116	NC_018748	ACA	2	6	9209	9214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671775
117	NC_018748	TCT	2	6	9776	9781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671776
118	NC_018748	GCA	2	6	9827	9832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671776
119	NC_018748	TCA	2	6	9867	9872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671776
120	NC_018748	TGC	2	6	9893	9898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671776
121	NC_018748	TAA	2	6	9914	9919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671776
122	NC_018748	AGT	2	6	9971	9976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671776
123	NC_018748	TTG	2	6	10137	10142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671776
124	NC_018748	ATA	2	6	10160	10165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671776
125	NC_018748	CAA	2	6	10331	10336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671777
126	NC_018748	TAG	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671777
127	NC_018748	TTG	2	6	10357	10362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671777
128	NC_018748	TAT	2	6	10469	10474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671777
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130	NC_018748	CCA	2	6	10882	10887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671778
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496	NC_018748	ACC	2	6	36888	36893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671801
497	NC_018748	TGA	2	6	36993	36998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671801
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