MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii NMJW1 chromosome

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018747	TCAAAA	2	12	36413	36424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018747	AAAAAT	2	12	80655	80666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018747	AAAATA	2	12	105731	105742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018747	TAAAAA	2	12	158225	158236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018747	ACAAGT	2	12	167691	167702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018747	ATTAAA	2	12	174880	174891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018747	AAAATC	2	12	205922	205933	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018747	GTTTAA	2	12	205977	205988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018747	TAAATA	2	12	244808	244819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018747	ATTAAA	2	12	313419	313430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018747	CAAGAT	2	12	316192	316203	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018747	TAAAAA	2	12	328330	328341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018747	TAATTT	2	12	337369	337380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018747	TAATAG	2	12	354437	354448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018747	AAATTT	2	12	389396	389407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018747	TAAAAA	2	12	396213	396224	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018747	CCTTTC	2	12	409292	409303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018747	ATAATT	2	12	413935	413946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018747	TTCAAA	2	12	417532	417543	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018747	ATTAGT	2	12	436301	436312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018747	TCGCTT	2	12	438497	438508	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018747	TTTATC	2	12	442406	442417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018747	TTCGCC	2	12	443227	443238	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018747	TTCTTG	2	12	443524	443535	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018747	TTCGCC	2	12	444726	444737	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018747	TTATTT	2	12	445459	445470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018747	TAAAAA	2	12	457572	457583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018747	AATAAG	2	12	547499	547510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018747	TAGCTT	2	12	584553	584564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018747	TAATTA	2	12	589773	589784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018747	AAAATT	2	12	615540	615551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018747	TTAAAA	2	12	648709	648720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018747	TTAAAT	2	12	695132	695143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018747	AGAATA	2	12	714476	714487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018747	ATATTA	2	12	738333	738344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018747	TAATGT	2	12	798508	798519	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018747	TTAATT	2	12	798564	798575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018747	TAATGT	2	12	828671	828682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018747	TTGAAT	2	12	828708	828719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018747	TTTTTA	2	12	859729	859740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018747	TTTTAT	2	12	887510	887521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018747	AATATT	2	12	898651	898662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.