MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii NMJW1 chromosome

Total Repeats: 568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018747	TGACCA	2	12	2334	2345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408670636
2	NC_018747	GGATTA	2	12	3489	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408670637
3	NC_018747	AGAAAA	2	12	3863	3874	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408670637
4	NC_018747	AAGAAA	2	12	7033	7044	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408670639
5	NC_018747	CAATAA	2	12	8951	8962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670641
6	NC_018747	TCTATT	2	12	8983	8994	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408670641
7	NC_018747	AATAAA	2	12	9391	9402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670642
8	NC_018747	TAAAGA	2	12	9817	9828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408670642
9	NC_018747	TAAAAA	2	12	9861	9872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670642
10	NC_018747	CAGATA	2	12	11057	11068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408670644
11	NC_018747	GTATCC	2	12	12995	13006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408670647
12	NC_018747	AAATTA	2	12	13374	13385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670647
13	NC_018747	AAAACA	2	12	13836	13847	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408670647
14	NC_018747	GAAAAA	2	12	15735	15746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408670650
15	NC_018747	TGGACT	3	18	16176	16193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408670650
16	NC_018747	AACTAT	2	12	18935	18946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670653
17	NC_018747	GTAAAT	2	12	26264	26275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408670660
18	NC_018747	TCAAAC	2	12	28617	28628	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408670664
19	NC_018747	TAAAAA	2	12	29857	29868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670665
20	NC_018747	ATTTAA	2	12	32038	32049	50 %	50 %	0 %	0 %	408670668
21	NC_018747	TATCAA	2	12	32698	32709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670668
22	NC_018747	AGAAGC	2	12	33608	33619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408670668
23	NC_018747	TAAATT	2	12	37721	37732	50 %	50 %	0 %	0 %	408670671
24	NC_018747	ATTTTT	2	12	38584	38595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408670672
25	NC_018747	TAAATT	2	12	38848	38859	50 %	50 %	0 %	0 %	408670672
26	NC_018747	TATGAA	2	12	39725	39736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408670673
27	NC_018747	AATATA	2	12	39756	39767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670673
28	NC_018747	AAAATC	2	12	40978	40989	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670674
29	NC_018747	AATTTC	2	12	41999	42010	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408670675
30	NC_018747	ATTAAA	2	12	42728	42739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670676
31	NC_018747	AATTTA	2	12	43425	43436	50 %	50 %	0 %	0 %	408670677
32	NC_018747	TAAATT	2	12	43667	43678	50 %	50 %	0 %	0 %	408670677
33	NC_018747	AATTAA	2	12	45258	45269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670677
34	NC_018747	AAATAA	2	12	48259	48270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670682
35	NC_018747	TAAAAA	2	12	49531	49542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670684
36	NC_018747	AATAAA	2	12	49869	49880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670684
37	NC_018747	AATTAA	2	12	50281	50292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670685
38	NC_018747	TCAAAT	2	12	51339	51350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670687
39	NC_018747	TAAATT	2	12	55555	55566	50 %	50 %	0 %	0 %	408670690
40	NC_018747	TTAAAA	2	12	57225	57236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670693
41	NC_018747	AAATTT	2	12	57246	57257	50 %	50 %	0 %	0 %	408670693
42	NC_018747	AAAAAT	2	12	57566	57577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670693
43	NC_018747	TAAATT	2	12	62595	62606	50 %	50 %	0 %	0 %	408670699
44	NC_018747	TATTCT	2	12	67001	67012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408670703
45	NC_018747	AAAAAT	2	12	67746	67757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670704
46	NC_018747	AACAAT	2	12	67909	67920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670704
47	NC_018747	TATCTT	2	12	69291	69302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408670704
48	NC_018747	ATAAAA	2	12	69507	69518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670705
49	NC_018747	TAATTT	2	12	69649	69660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408670705
50	NC_018747	TAGAAA	2	12	72154	72165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408670707
51	NC_018747	AATAGA	2	12	73190	73201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408670708
52	NC_018747	AATTTC	2	12	75373	75384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408670710
53	NC_018747	TTGCTA	2	12	76102	76113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408670711
54	NC_018747	AAAAGA	2	12	77548	77559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408670712
55	NC_018747	TTTAGA	2	12	77681	77692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408670713
56	NC_018747	AAAACT	2	12	78201	78212	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670713
57	NC_018747	TAAATC	2	12	78491	78502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670713
58	NC_018747	AGGAAT	2	12	80097	80108	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	408670715
59	NC_018747	TTTTAT	2	12	80569	80580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408670715
60	NC_018747	TACAAA	2	12	81186	81197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670716
61	NC_018747	AATTTT	2	12	81438	81449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408670717
62	NC_018747	AATACT	2	12	85708	85719	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670720
63	NC_018747	AGCAAC	2	12	85900	85911	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408670721
64	NC_018747	AAACAA	2	12	87080	87091	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408670722
65	NC_018747	ATAAAA	2	12	88142	88153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670723
66	NC_018747	CAATTT	2	12	88563	88574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408670723
67	NC_018747	CAGAAA	2	12	90546	90557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408670725
68	NC_018747	TCTTTC	2	12	95243	95254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408670730
69	NC_018747	CTAAAT	2	12	96096	96107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670730
70	NC_018747	AACATA	2	12	98410	98421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670732
71	NC_018747	TAAGAA	2	12	99050	99061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408670733
72	NC_018747	GCAATT	2	12	99613	99624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408670733
73	NC_018747	TGGACT	2	12	99969	99980	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408670733
74	NC_018747	TTCACT	2	12	100684	100695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408670735
75	NC_018747	GAAATA	2	12	105216	105227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408670738
76	NC_018747	TTGCTG	2	12	105831	105842	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408670740
77	NC_018747	ATTATG	2	12	109052	109063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408670742
78	NC_018747	AAAATC	2	12	111601	111612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670745
79	NC_018747	TAAACT	2	12	111753	111764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670745
80	NC_018747	CAATAT	2	12	111803	111814	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670746
81	NC_018747	ATTTAT	2	12	115142	115153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408670749
82	NC_018747	AAAAAG	2	12	115442	115453	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408670750
83	NC_018747	AACTTA	2	12	116905	116916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670751
84	NC_018747	AAATCA	2	12	117793	117804	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670752
85	NC_018747	AATTTC	2	12	119734	119745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408670755
86	NC_018747	ATCTTT	2	12	121871	121882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408670758
87	NC_018747	TCTCTT	2	12	123521	123532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408670759
88	NC_018747	AATTCT	2	12	124798	124809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408670761
89	NC_018747	CTTCCC	2	12	127169	127180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408670763
90	NC_018747	CTGAAT	2	12	128089	128100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408670764
91	NC_018747	TATTAA	2	12	131808	131819	50 %	50 %	0 %	0 %	408670766
92	NC_018747	TGATAT	2	12	132175	132186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408670766
93	NC_018747	ATTTTT	2	12	132537	132548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408670767
94	NC_018747	ATTTCC	2	12	134934	134945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408670768
95	NC_018747	TTAAAA	2	12	135245	135256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670768
96	NC_018747	AAACTA	2	12	137000	137011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670769
97	NC_018747	ATTTTA	2	12	139655	139666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408670771
98	NC_018747	ATTCCA	2	12	140489	140500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408670771
99	NC_018747	CTAAAT	2	12	141396	141407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670771
100	NC_018747	TAGAAT	2	12	142724	142735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408670773
101	NC_018747	AAAAGA	2	12	143901	143912	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408670773
102	NC_018747	AAAATA	2	12	145966	145977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670775
103	NC_018747	AAATCA	2	12	146377	146388	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670776
104	NC_018747	ATACTT	2	12	146751	146762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408670776
105	NC_018747	TTTCAT	2	12	147068	147079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408670776
106	NC_018747	CATTGC	2	12	147454	147465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408670777
107	NC_018747	TCAACT	2	12	149504	149515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408670778
108	NC_018747	AAACAT	2	12	152245	152256	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670780
109	NC_018747	CAAGAA	2	12	152403	152414	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408670780
110	NC_018747	AATTCA	2	12	153308	153319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670781
111	NC_018747	TAAAAA	2	12	156500	156511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408670783
112	NC_018747	AATACT	2	12	156633	156644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408670783
113	NC_018747	AATTAA	2	12	156978	156989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408670783
114	NC_018747	GGCAAT	2	12	158684	158695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408670786
115	NC_018747	GAAAAT	2	12	159293	159304	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408670787
116	NC_018747	CTAGAA	2	12	160407	160418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408670788
117	NC_018747	ATTTTT	2	12	160822	160833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	408670788
118	NC_018747	TCATAT	2	12	161290	161301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408670789
119	NC_018747	ATCTTT	2	12	161811	161822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408670789
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121	NC_018747	AATCAA	2	12	168083	168094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408670794
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