MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii NMJW1 chromosome

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018747	ATTT	2	8	8	15	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018747	TTAT	2	8	8231	8238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018747	TAAT	2	8	19877	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018747	TAAA	2	8	22684	22691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018747	ATTT	2	8	25592	25599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018747	TGCT	2	8	37882	37889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018747	ATTA	2	8	37988	37995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018747	CATT	2	8	38022	38029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018747	ATTT	2	8	40625	40632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018747	AATT	2	8	46318	46325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018747	GATA	2	8	46555	46562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018747	AAAT	2	8	46571	46578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018747	TTTA	2	8	46647	46654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018747	AAGC	2	8	46739	46746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018747	AATA	2	8	47736	47743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018747	TAAT	2	8	47761	47768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018747	TAAT	3	12	56688	56699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018747	ATTT	2	8	58934	58941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018747	GAAA	2	8	70013	70020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018747	AAAT	2	8	70021	70028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018747	AACA	2	8	72507	72514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018747	TCTT	3	12	80688	80699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018747	TTTA	2	8	80786	80793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018747	ACAA	2	8	82002	82009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018747	CAAA	2	8	93960	93967	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018747	ATAA	2	8	98671	98678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018747	TTCC	2	8	101218	101225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018747	TCAA	2	8	101246	101253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018747	TAAA	2	8	108107	108114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018747	TTAG	2	8	112701	112708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018747	TTTA	2	8	112746	112753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018747	TATT	2	8	114521	114528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018747	ATAA	2	8	114658	114665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018747	TAAT	2	8	120565	120572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018747	TTTC	2	8	120704	120711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018747	AAAT	2	8	120757	120764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018747	TATT	2	8	131090	131097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018747	TTAT	2	8	137696	137703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018747	AATA	2	8	138022	138029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018747	AAAT	2	8	150684	150691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018747	AAGA	2	8	165743	165750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018747	TTTA	2	8	167646	167653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018747	ATTA	2	8	169251	169258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018747	AAAC	2	8	171006	171013	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018747	ATTT	2	8	171362	171369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018747	TAAT	2	8	182707	182714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018747	AAAT	2	8	188347	188354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018747	TTTA	2	8	188386	188393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018747	ATCT	2	8	188894	188901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018747	AATT	5	20	189724	189743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018747	GATT	2	8	189881	189888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018747	TAAA	2	8	191358	191365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018747	TAAA	2	8	193545	193552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018747	CAAA	2	8	197599	197606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018747	TAAA	2	8	205951	205958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018747	ATTA	2	8	206046	206053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018747	TTAA	2	8	206265	206272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018747	ATTT	2	8	206355	206362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018747	AATA	2	8	230815	230822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018747	TCTT	2	8	237397	237404	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018747	TCAA	2	8	237511	237518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018747	AAAT	2	8	238356	238363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018747	CAAA	2	8	243459	243466	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018747	CAAA	2	8	243870	243877	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018747	CATA	2	8	244629	244636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018747	GAAA	2	8	244737	244744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018747	TTAA	2	8	244789	244796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018747	ATTA	2	8	244842	244849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018747	GGAA	2	8	244855	244862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018747	ATTT	2	8	247375	247382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018747	GAAA	2	8	247432	247439	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018747	AATT	2	8	247471	247478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018747	CAAA	2	8	251335	251342	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018747	TTTC	2	8	252189	252196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018747	ATTA	2	8	262981	262988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018747	AATT	2	8	268444	268451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018747	TAAA	2	8	272828	272835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018747	TACT	2	8	275656	275663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018747	AAAT	2	8	278063	278070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018747	TAAA	2	8	287195	287202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018747	AATA	2	8	288994	289001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018747	ATTT	2	8	290085	290092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018747	CTTA	2	8	313454	313461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018747	ATCA	2	8	316165	316172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018747	ATTA	2	8	325394	325401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018747	TAAA	2	8	325565	325572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018747	ATAA	2	8	329859	329866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018747	AAAT	2	8	329875	329882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018747	TTAT	2	8	333763	333770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018747	CTTT	2	8	333843	333850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018747	ATTT	2	8	337302	337309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018747	TAAA	2	8	339133	339140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018747	AAAT	2	8	339142	339149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018747	ACAT	2	8	344042	344049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018747	TAAA	2	8	344055	344062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018747	ATAG	2	8	364649	364656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018747	ATTC	2	8	367426	367433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018747	ATTT	2	8	373211	373218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018747	AATA	2	8	373247	373254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018747	ATTT	2	8	373255	373262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018747	TAAA	2	8	383099	383106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018747	ATAA	3	12	383148	383159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018747	ATAG	2	8	383265	383272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018747	TATT	2	8	390894	390901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018747	AATA	2	8	390909	390916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018747	TTTA	2	8	392079	392086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018747	TTTA	2	8	393956	393963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018747	TAAA	2	8	395001	395008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018747	AAAC	2	8	396068	396075	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018747	ATTT	2	8	396108	396115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018747	TTTA	2	8	396178	396185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018747	AATA	2	8	397460	397467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018747	TCCT	2	8	409147	409154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018747	TCCT	2	8	410341	410348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018747	TATT	2	8	413985	413992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018747	CAAA	2	8	415238	415245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018747	TTAT	2	8	417485	417492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018747	AATT	2	8	417493	417500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018747	CTTA	2	8	417505	417512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018747	CTTA	2	8	419287	419294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018747	CATT	2	8	425412	425419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018747	AAAT	2	8	425441	425448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018747	TTAT	2	8	425569	425576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018747	AATA	2	8	428873	428880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018747	TACG	2	8	437443	437450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018747	ACCT	2	8	437507	437514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018747	CTAC	2	8	437577	437584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018747	GTTT	2	8	438338	438345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018747	CTAA	2	8	438473	438480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018747	TCGC	2	8	438963	438970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018747	TAAA	2	8	439357	439364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018747	TTTA	2	8	440378	440385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018747	TTTA	2	8	441059	441066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018747	AATA	2	8	441070	441077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018747	AATT	2	8	441567	441574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018747	TATT	3	12	441657	441668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018747	AATA	3	12	441688	441699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018747	TAAA	2	8	441949	441956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018747	ATTT	2	8	442307	442314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018747	TTTG	2	8	443567	443574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018747	CAAT	2	8	443746	443753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018747	TTCT	2	8	444745	444752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018747	AATT	2	8	445276	445283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018747	GTAG	2	8	445331	445338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018747	TTTG	2	8	445499	445506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018747	CTTA	2	8	445516	445523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018747	AATC	2	8	446253	446260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018747	ATAA	2	8	446275	446282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018747	CTTC	2	8	447036	447043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018747	TTTA	2	8	447064	447071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.