MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018746	ACG	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018746	CAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018746	CTT	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018746	GTC	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018746	GTC	2	6	1558	1563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018746	AAG	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018746	TTG	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018746	GGC	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018746	CGG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018746	TGA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018746	AGA	2	6	4630	4635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018746	TGC	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018746	AGC	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018746	GCA	2	6	6865	6870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018746	CAC	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018746	AGG	2	6	8253	8258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018746	CGG	2	6	9494	9499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018746	AAG	2	6	10665	10670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018746	CTA	2	6	11682	11687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018746	TGG	2	6	11692	11697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018746	AAT	2	6	11813	11818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018746	ATA	2	6	11821	11826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018746	AGG	2	6	13873	13878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018746	TCG	2	6	20524	20529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018746	AAT	2	6	26150	26155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018746	ATG	2	6	31170	31175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018746	ATG	2	6	31856	31861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018746	CAA	2	6	31876	31881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018746	GGA	2	6	40091	40096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018746	GCT	2	6	41620	41625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018746	CCA	2	6	42409	42414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018746	TCA	2	6	42438	42443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018746	ATA	2	6	42546	42551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018746	GCC	2	6	42571	42576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018746	GTT	2	6	42721	42726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018746	TAA	2	6	48536	48541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018746	TAC	2	6	48548	48553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018746	AGC	2	6	48630	48635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018746	AGC	2	6	49941	49946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018746	ACC	2	6	51713	51718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018746	CCA	2	6	52305	52310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018746	CTT	2	6	52364	52369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018746	TGC	2	6	52404	52409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018746	CAG	2	6	52895	52900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018746	CTC	2	6	54262	54267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018746	CAA	3	9	54310	54318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018746	TAA	2	6	55462	55467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018746	TTA	2	6	55473	55478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018746	CAA	2	6	58651	58656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018746	ACC	2	6	58803	58808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018746	GCA	2	6	58857	58862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018746	CCA	2	6	58962	58967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018746	CCA	2	6	58984	58989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018746	ACG	2	6	59367	59372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018746	ACG	2	6	59480	59485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018746	CAT	3	9	59707	59715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018746	TCG	2	6	60094	60099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018746	GGC	2	6	60113	60118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018746	GGC	2	6	60179	60184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018746	CCT	2	6	60267	60272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_018746	ACC	2	6	60293	60298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018746	GTC	2	6	61862	61867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018746	TCG	2	6	62181	62186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018746	TTA	2	6	63505	63510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018746	ATC	2	6	66424	66429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018746	GGA	2	6	72350	72355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018746	GTG	2	6	73717	73722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018746	ATC	2	6	75290	75295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018746	TGA	2	6	77712	77717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018746	CTG	2	6	78493	78498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018746	CGG	2	6	79138	79143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018746	GCG	2	6	79188	79193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018746	AAC	2	6	79252	79257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018746	ACT	2	6	79270	79275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018746	CCA	2	6	79341	79346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018746	AGC	2	6	79365	79370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018746	GCC	2	6	89458	89463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018746	CAA	2	6	90229	90234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018746	GCC	2	6	90304	90309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018746	GCT	2	6	90392	90397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018746	GCC	2	6	90506	90511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018746	CCT	2	6	90658	90663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018746	AGG	2	6	90751	90756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018746	CCT	2	6	92675	92680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018746	TGC	2	6	92721	92726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018746	CAA	2	6	92743	92748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018746	TTG	2	6	92839	92844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018746	GCA	2	6	92854	92859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018746	GTA	2	6	95416	95421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018746	CTG	2	6	96653	96658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018746	GGC	2	6	97535	97540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018746	ATG	2	6	97572	97577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018746	CTG	2	6	97608	97613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018746	TTC	2	6	97658	97663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018746	TGA	2	6	99151	99156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018746	CAC	2	6	99159	99164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018746	CGG	2	6	99167	99172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018746	TAT	2	6	99303	99308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018746	CGG	2	6	100947	100952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018746	TGC	3	9	100963	100971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018746	GTG	2	6	101129	101134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018746	GTT	2	6	101200	101205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018746	TTC	2	6	103775	103780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018746	GCG	2	6	103796	103801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018746	GAC	2	6	115766	115771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018746	TAA	2	6	115901	115906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018746	GCC	2	6	115936	115941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018746	TCG	2	6	116000	116005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018746	ACC	2	6	116097	116102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018746	CAA	2	6	116183	116188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018746	CTG	2	6	116205	116210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018746	TGC	2	6	116485	116490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018746	TAT	2	6	116494	116499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018746	GCC	2	6	116564	116569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018746	CCG	2	6	116954	116959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.