MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL05

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018745	AAAGG	2	10	1249	1258	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018745	AATAC	2	10	1620	1629	60 %	20 %	0 %	20 %	408671637
3	NC_018745	GGAAT	2	10	5485	5494	40 %	20 %	40 %	0 %	408671638
4	NC_018745	CTTGG	2	10	8482	8491	0 %	40 %	40 %	20 %	408671640
5	NC_018745	GGTTT	2	10	8766	8775	0 %	60 %	40 %	0 %	408671640
6	NC_018745	CCAAT	2	10	9073	9082	40 %	20 %	0 %	40 %	408671640
7	NC_018745	ATTTA	2	10	12494	12503	40 %	60 %	0 %	0 %	408671642
8	NC_018745	TACCT	2	10	13575	13584	20 %	40 %	0 %	40 %	408671643
9	NC_018745	ATTGA	2	10	14124	14133	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018745	AGCAG	2	10	16590	16599	40 %	0 %	40 %	20 %	408671645
11	NC_018745	AAGAA	2	10	16924	16933	80 %	0 %	20 %	0 %	408671645
12	NC_018745	CAAAT	2	10	16961	16970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018745	AGTTT	2	10	17906	17915	20 %	60 %	20 %	0 %	408671647
14	NC_018745	TCTAT	2	10	19584	19593	20 %	60 %	0 %	20 %	408671648
15	NC_018745	TAAAA	2	10	19791	19800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018745	GTTAT	2	10	19970	19979	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018745	TGTAT	2	10	20556	20565	20 %	60 %	20 %	0 %	408671649
18	NC_018745	TCATT	2	10	22433	22442	20 %	60 %	0 %	20 %	408671650
19	NC_018745	ATTTC	2	10	23079	23088	20 %	60 %	0 %	20 %	408671652
20	NC_018745	CTTTG	2	10	24083	24092	0 %	60 %	20 %	20 %	408671652
21	NC_018745	AGAAA	2	10	24679	24688	80 %	0 %	20 %	0 %	408671652
22	NC_018745	GCTTC	2	10	25823	25832	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018745	GTTTA	2	10	25842	25851	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018745	AAAGG	2	10	26543	26552	60 %	0 %	40 %	0 %	408671653
25	NC_018745	AATTG	2	10	26725	26734	40 %	40 %	20 %	0 %	408671653
26	NC_018745	TTTAA	2	10	28262	28271	40 %	60 %	0 %	0 %	408671654
27	NC_018745	TATCA	2	10	28906	28915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018745	ATTGA	2	10	29954	29963	40 %	40 %	20 %	0 %	408671656
29	NC_018745	CATTT	2	10	31826	31835	20 %	60 %	0 %	20 %	408671657

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.