MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL05

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018745	TAA	2	6	1482	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671637
2	NC_018745	GAA	2	6	1531	1536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671637
3	NC_018745	CTA	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671637
4	NC_018745	AAG	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671637
5	NC_018745	TGT	2	6	1749	1754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671637
6	NC_018745	TTA	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
7	NC_018745	ATG	2	6	2011	2016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
8	NC_018745	AAT	3	9	2045	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
9	NC_018745	ACT	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671638
10	NC_018745	AAT	2	6	2190	2195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
11	NC_018745	ATT	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
12	NC_018745	TAA	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
13	NC_018745	AAT	2	6	2561	2566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
14	NC_018745	TGA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
15	NC_018745	AAC	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671638
16	NC_018745	ATT	2	6	2880	2885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
17	NC_018745	TGT	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671638
18	NC_018745	TGG	2	6	3113	3118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671638
19	NC_018745	ATT	3	9	3133	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
20	NC_018745	ACC	2	6	3152	3157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671638
21	NC_018745	TAT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
22	NC_018745	TAA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
23	NC_018745	TAA	2	6	3269	3274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
24	NC_018745	AGT	2	6	3372	3377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
25	NC_018745	ATT	3	9	3442	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
26	NC_018745	GTG	2	6	3613	3618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671638
27	NC_018745	ATA	2	6	3663	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
28	NC_018745	AAG	2	6	3766	3771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671638
29	NC_018745	AAT	2	6	3774	3779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
30	NC_018745	GTT	2	6	3813	3818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671638
31	NC_018745	TAA	2	6	3824	3829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
32	NC_018745	ATA	2	6	3988	3993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
33	NC_018745	CAA	2	6	4179	4184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671638
34	NC_018745	CAA	2	6	4235	4240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671638
35	NC_018745	TGG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671638
36	NC_018745	AGA	2	6	4595	4600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671638
37	NC_018745	TGG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671638
38	NC_018745	ATT	2	6	4645	4650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
39	NC_018745	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671638
40	NC_018745	AAT	2	6	5058	5063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
41	NC_018745	AAT	2	6	5094	5099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
42	NC_018745	CAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671638
43	NC_018745	ATT	2	6	5139	5144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
44	NC_018745	TAC	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671638
45	NC_018745	ATA	2	6	5359	5364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
46	NC_018745	TAC	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671638
47	NC_018745	CAA	2	6	5509	5514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671638
48	NC_018745	TGA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
49	NC_018745	TAC	2	6	5689	5694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671638
50	NC_018745	CTG	2	6	5710	5715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671638
51	NC_018745	TGA	2	6	5768	5773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
52	NC_018745	TAA	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
53	NC_018745	AGT	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
54	NC_018745	ATA	2	6	5932	5937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671638
55	NC_018745	CTC	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671638
56	NC_018745	TAT	2	6	5985	5990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
57	NC_018745	AGT	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
58	NC_018745	TAT	2	6	6122	6127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
59	NC_018745	CAG	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671638
60	NC_018745	ATG	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671638
61	NC_018745	ATT	2	6	6276	6281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671638
62	NC_018745	TGA	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671639
63	NC_018745	GAA	2	6	6610	6615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671639
64	NC_018745	TAT	2	6	6638	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671639
65	NC_018745	CAG	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671639
66	NC_018745	ATA	2	6	6670	6675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671639
67	NC_018745	CTT	2	6	6688	6693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671639
68	NC_018745	TGT	2	6	6695	6700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671639
69	NC_018745	AAG	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671639
70	NC_018745	TTA	2	6	6859	6864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671639
71	NC_018745	CAA	2	6	7023	7028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671639
72	NC_018745	TGG	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671639
73	NC_018745	TTA	2	6	7041	7046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671639
74	NC_018745	TGG	2	6	7052	7057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671639
75	NC_018745	GCA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671639
76	NC_018745	GAT	3	9	7368	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671639
77	NC_018745	AGC	2	6	7430	7435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671639
78	NC_018745	ATT	2	6	7523	7528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671639
79	NC_018745	AGA	2	6	7529	7534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671639
80	NC_018745	AAC	2	6	7772	7777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671640
81	NC_018745	TGC	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671640
82	NC_018745	ACT	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671640
83	NC_018745	TTG	2	6	7828	7833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671640
84	NC_018745	AAG	2	6	7854	7859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671640
85	NC_018745	GAA	2	6	7869	7874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671640
86	NC_018745	TGG	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671640
87	NC_018745	CAA	2	6	7947	7952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671640
88	NC_018745	ATG	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671640
89	NC_018745	GGT	2	6	8175	8180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671640
90	NC_018745	TAA	2	6	8257	8262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671640
91	NC_018745	GGC	2	6	8295	8300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408671640
92	NC_018745	ATA	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671640
93	NC_018745	AGT	2	6	8336	8341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671640
94	NC_018745	GAT	2	6	8342	8347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671640
95	NC_018745	TTA	2	6	8359	8364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671640
96	NC_018745	GAC	2	6	8531	8536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671640
97	NC_018745	TTA	2	6	8663	8668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671640
98	NC_018745	TGT	2	6	8696	8701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671640
99	NC_018745	GAT	2	6	8709	8714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671640
100	NC_018745	AGT	2	6	8735	8740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671640
101	NC_018745	GAT	2	6	8816	8821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671640
102	NC_018745	ATG	2	6	8838	8843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671640
103	NC_018745	TTC	2	6	8975	8980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671640
104	NC_018745	GAA	2	6	9065	9070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671640
105	NC_018745	GGT	2	6	9148	9153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671640
106	NC_018745	TAA	2	6	9269	9274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671640
107	NC_018745	CAG	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671640
108	NC_018745	TTA	2	6	9373	9378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671640
109	NC_018745	TAT	2	6	9428	9433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671640
110	NC_018745	ATT	2	6	9446	9451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671640
111	NC_018745	AGA	2	6	9476	9481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671640
112	NC_018745	CAA	2	6	10072	10077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671641
113	NC_018745	AAG	2	6	10109	10114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671641
114	NC_018745	ATC	2	6	10151	10156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671641
115	NC_018745	GTA	2	6	10267	10272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671641
116	NC_018745	GTA	2	6	10327	10332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671641
117	NC_018745	ACA	2	6	10381	10386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671641
118	NC_018745	ATG	2	6	10435	10440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671641
119	NC_018745	ATG	2	6	10529	10534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671641
120	NC_018745	CCA	2	6	10574	10579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671641
121	NC_018745	AGG	2	6	10581	10586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671641
122	NC_018745	TTG	3	9	10685	10693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671641
123	NC_018745	CAG	2	6	10700	10705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671641
124	NC_018745	AGA	2	6	10796	10801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671641
125	NC_018745	GAA	2	6	10876	10881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671641
126	NC_018745	ACC	2	6	11052	11057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671641
127	NC_018745	GGC	2	6	11065	11070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408671641
128	NC_018745	ATT	2	6	11099	11104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671641
129	NC_018745	ATA	2	6	11492	11497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671641
130	NC_018745	ATG	2	6	11594	11599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671641
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256	NC_018745	AAG	2	6	23730	23735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671652
257	NC_018745	ATC	2	6	23770	23775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671652
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280	NC_018745	AAT	2	6	26577	26582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671653
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379	NC_018745	TAT	2	6	33916	33921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671658

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.