MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL05

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018745	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018745	AC	4	8	612	619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018745	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018745	TA	3	6	1460	1465	50 %	50 %	0 %	0 %	408671637
5	NC_018745	AT	3	6	1731	1736	50 %	50 %	0 %	0 %	408671637
6	NC_018745	TG	3	6	1972	1977	0 %	50 %	50 %	0 %	408671638
7	NC_018745	AT	3	6	2028	2033	50 %	50 %	0 %	0 %	408671638
8	NC_018745	AT	3	6	2162	2167	50 %	50 %	0 %	0 %	408671638
9	NC_018745	AT	3	6	2731	2736	50 %	50 %	0 %	0 %	408671638
10	NC_018745	TA	3	6	3046	3051	50 %	50 %	0 %	0 %	408671638
11	NC_018745	TA	3	6	4062	4067	50 %	50 %	0 %	0 %	408671638
12	NC_018745	TA	3	6	4687	4692	50 %	50 %	0 %	0 %	408671638
13	NC_018745	CT	3	6	5241	5246	0 %	50 %	0 %	50 %	408671638
14	NC_018745	CT	3	6	5376	5381	0 %	50 %	0 %	50 %	408671638
15	NC_018745	TA	3	6	5541	5546	50 %	50 %	0 %	0 %	408671638
16	NC_018745	AT	3	6	6463	6468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018745	AT	3	6	7478	7483	50 %	50 %	0 %	0 %	408671639
18	NC_018745	TA	3	6	7794	7799	50 %	50 %	0 %	0 %	408671640
19	NC_018745	AT	3	6	8058	8063	50 %	50 %	0 %	0 %	408671640
20	NC_018745	TA	3	6	8184	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	408671640
21	NC_018745	AT	3	6	9482	9487	50 %	50 %	0 %	0 %	408671640
22	NC_018745	TA	3	6	10814	10819	50 %	50 %	0 %	0 %	408671641
23	NC_018745	CA	3	6	10821	10826	50 %	0 %	0 %	50 %	408671641
24	NC_018745	TA	3	6	14836	14841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018745	TA	3	6	15003	15008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018745	AT	3	6	17015	17020	50 %	50 %	0 %	0 %	408671646
27	NC_018745	GT	3	6	17683	17688	0 %	50 %	50 %	0 %	408671647
28	NC_018745	TA	3	6	17959	17964	50 %	50 %	0 %	0 %	408671647
29	NC_018745	TA	3	6	18581	18586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018745	AT	3	6	18952	18957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018745	GA	3	6	19072	19077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018745	TG	3	6	19757	19762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018745	TA	3	6	20110	20115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018745	TA	3	6	20380	20385	50 %	50 %	0 %	0 %	408671649
35	NC_018745	CT	3	6	20447	20452	0 %	50 %	0 %	50 %	408671649
36	NC_018745	TA	3	6	20468	20473	50 %	50 %	0 %	0 %	408671649
37	NC_018745	AT	3	6	20621	20626	50 %	50 %	0 %	0 %	408671649
38	NC_018745	AG	3	6	21043	21048	50 %	0 %	50 %	0 %	408671649
39	NC_018745	TA	3	6	21796	21801	50 %	50 %	0 %	0 %	408671650
40	NC_018745	TA	3	6	21888	21893	50 %	50 %	0 %	0 %	408671650
41	NC_018745	CT	3	6	22268	22273	0 %	50 %	0 %	50 %	408671650
42	NC_018745	AT	3	6	23190	23195	50 %	50 %	0 %	0 %	408671652
43	NC_018745	TG	3	6	23685	23690	0 %	50 %	50 %	0 %	408671652
44	NC_018745	GA	4	8	25309	25316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018745	AT	3	6	25366	25371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018745	AG	3	6	25737	25742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018745	CA	3	6	25915	25920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018745	AT	3	6	26806	26811	50 %	50 %	0 %	0 %	408671653
49	NC_018745	AG	3	6	27376	27381	50 %	0 %	50 %	0 %	408671653
50	NC_018745	TA	4	8	27645	27652	50 %	50 %	0 %	0 %	408671653
51	NC_018745	TA	3	6	29584	29589	50 %	50 %	0 %	0 %	408671656
52	NC_018745	TA	3	6	30150	30155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018745	GA	3	6	30869	30874	50 %	0 %	50 %	0 %	408671657
54	NC_018745	TA	3	6	32257	32262	50 %	50 %	0 %	0 %	408671657
55	NC_018745	AT	3	6	33213	33218	50 %	50 %	0 %	0 %	408671658
56	NC_018745	CT	3	6	33701	33706	0 %	50 %	0 %	50 %	408671658
57	NC_018745	AT	3	6	33920	33925	50 %	50 %	0 %	0 %	408671658

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.