MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL04

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018744	ATAAA	2	10	63	72	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018744	AGAAA	2	10	1673	1682	80 %	0 %	20 %	0 %	408671612
3	NC_018744	AAAAG	2	10	1939	1948	80 %	0 %	20 %	0 %	408671612
4	NC_018744	TAAGT	2	10	3463	3472	40 %	40 %	20 %	0 %	408671612
5	NC_018744	AAAAT	2	10	3995	4004	80 %	20 %	0 %	0 %	408671612
6	NC_018744	TCTTG	2	10	4178	4187	0 %	60 %	20 %	20 %	408671612
7	NC_018744	TACCT	2	10	4280	4289	20 %	40 %	0 %	40 %	408671612
8	NC_018744	ATTTT	2	10	5086	5095	20 %	80 %	0 %	0 %	408671612
9	NC_018744	GATTT	2	10	5293	5302	20 %	60 %	20 %	0 %	408671613
10	NC_018744	ATTAT	2	10	6428	6437	40 %	60 %	0 %	0 %	408671614
11	NC_018744	AACTT	2	10	7618	7627	40 %	40 %	0 %	20 %	408671615
12	NC_018744	ATTAC	2	10	7820	7829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018744	TAAAA	2	10	8002	8011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018744	ACCGT	2	10	10081	10090	20 %	20 %	20 %	40 %	408671617
15	NC_018744	TTTTC	2	10	12878	12887	0 %	80 %	0 %	20 %	408671620
16	NC_018744	AAACC	2	10	17542	17551	60 %	0 %	0 %	40 %	408671622
17	NC_018744	CCGAT	2	10	17986	17995	20 %	20 %	20 %	40 %	408671623
18	NC_018744	TTTTC	2	10	18244	18253	0 %	80 %	0 %	20 %	408671623
19	NC_018744	ATTTT	2	10	19914	19923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018744	ATTGT	2	10	20124	20133	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018744	ATTAT	2	10	22101	22110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018744	ATTAA	2	10	22197	22206	60 %	40 %	0 %	0 %	408671626
23	NC_018744	AAAGA	2	10	22843	22852	80 %	0 %	20 %	0 %	408671626
24	NC_018744	TTTAG	2	10	23327	23336	20 %	60 %	20 %	0 %	408671627
25	NC_018744	TGATT	2	10	23923	23932	20 %	60 %	20 %	0 %	408671627
26	NC_018744	TGATT	2	10	29147	29156	20 %	60 %	20 %	0 %	408671631
27	NC_018744	AGTTA	2	10	31271	31280	40 %	40 %	20 %	0 %	408671632
28	NC_018744	TTGTA	2	10	31643	31652	20 %	60 %	20 %	0 %	408671632
29	NC_018744	GAAAG	2	10	32719	32728	60 %	0 %	40 %	0 %	408671632
30	NC_018744	ATTAG	2	10	32768	32777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018744	TAAAA	2	10	35712	35721	80 %	20 %	0 %	0 %	408671634
32	NC_018744	ATTAA	2	10	35984	35993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018744	ATTTT	2	10	36377	36386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018744	AATCC	2	10	37042	37051	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018744	TACTC	2	10	38410	38419	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.