MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL04

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018744	CATA	2	8	347	354	50 %	25 %	0 %	25 %	408671612
2	NC_018744	AGAA	2	8	999	1006	75 %	0 %	25 %	0 %	408671612
3	NC_018744	TTGA	2	8	1160	1167	25 %	50 %	25 %	0 %	408671612
4	NC_018744	TTCA	2	8	1338	1345	25 %	50 %	0 %	25 %	408671612
5	NC_018744	TAAA	2	8	1581	1588	75 %	25 %	0 %	0 %	408671612
6	NC_018744	TGAT	2	8	1650	1657	25 %	50 %	25 %	0 %	408671612
7	NC_018744	AATT	2	8	1830	1837	50 %	50 %	0 %	0 %	408671612
8	NC_018744	CTAT	2	8	2808	2815	25 %	50 %	0 %	25 %	408671612
9	NC_018744	GACG	2	8	3442	3449	25 %	0 %	50 %	25 %	408671612
10	NC_018744	ATTA	2	8	3512	3519	50 %	50 %	0 %	0 %	408671612
11	NC_018744	GAAA	2	8	3974	3981	75 %	0 %	25 %	0 %	408671612
12	NC_018744	TGAA	2	8	3984	3991	50 %	25 %	25 %	0 %	408671612
13	NC_018744	GATA	2	8	4030	4037	50 %	25 %	25 %	0 %	408671612
14	NC_018744	TATT	2	8	4051	4058	25 %	75 %	0 %	0 %	408671612
15	NC_018744	CGAA	2	8	4357	4364	50 %	0 %	25 %	25 %	408671612
16	NC_018744	TGAT	2	8	4542	4549	25 %	50 %	25 %	0 %	408671612
17	NC_018744	CAAA	2	8	5070	5077	75 %	0 %	0 %	25 %	408671612
18	NC_018744	AGGA	2	8	5192	5199	50 %	0 %	50 %	0 %	408671613
19	NC_018744	GATT	2	8	5244	5251	25 %	50 %	25 %	0 %	408671613
20	NC_018744	CAAA	2	8	5373	5380	75 %	0 %	0 %	25 %	408671613
21	NC_018744	GAAG	2	8	6001	6008	50 %	0 %	50 %	0 %	408671614
22	NC_018744	TTCT	2	8	6047	6054	0 %	75 %	0 %	25 %	408671614
23	NC_018744	TTGA	2	8	6715	6722	25 %	50 %	25 %	0 %	408671614
24	NC_018744	TGGA	2	8	7523	7530	25 %	25 %	50 %	0 %	408671615
25	NC_018744	CAAA	2	8	7943	7950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018744	CCAT	2	8	8131	8138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018744	AGTA	2	8	8244	8251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018744	CTAT	2	8	8266	8273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018744	CTAT	2	8	8330	8337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018744	ATTG	2	8	8408	8415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018744	TCGT	2	8	8624	8631	0 %	50 %	25 %	25 %	408671616
32	NC_018744	AGAT	2	8	8782	8789	50 %	25 %	25 %	0 %	408671616
33	NC_018744	AAAG	2	8	8929	8936	75 %	0 %	25 %	0 %	408671616
34	NC_018744	AATT	2	8	9302	9309	50 %	50 %	0 %	0 %	408671616
35	NC_018744	GATA	2	8	9674	9681	50 %	25 %	25 %	0 %	408671616
36	NC_018744	AATA	2	8	9886	9893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018744	TTGT	2	8	9956	9963	0 %	75 %	25 %	0 %	408671617
38	NC_018744	TAAA	2	8	10217	10224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018744	AAGT	2	8	10247	10254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018744	TGTT	2	8	10292	10299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018744	TTGG	2	8	10412	10419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018744	AGGT	2	8	10451	10458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018744	TAAT	2	8	11214	11221	50 %	50 %	0 %	0 %	408671618
44	NC_018744	ATTT	2	8	11560	11567	25 %	75 %	0 %	0 %	408671619
45	NC_018744	TGAT	2	8	11630	11637	25 %	50 %	25 %	0 %	408671619
46	NC_018744	TCAA	2	8	11664	11671	50 %	25 %	0 %	25 %	408671619
47	NC_018744	AGAT	2	8	12098	12105	50 %	25 %	25 %	0 %	408671619
48	NC_018744	AGGA	2	8	12150	12157	50 %	0 %	50 %	0 %	408671619
49	NC_018744	GCAA	2	8	12437	12444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018744	TTGT	2	8	12525	12532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018744	ATTA	2	8	12629	12636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018744	TAAA	2	8	12734	12741	75 %	25 %	0 %	0 %	408671620
53	NC_018744	TCTA	2	8	13037	13044	25 %	50 %	0 %	25 %	408671620
54	NC_018744	TTAT	2	8	13076	13083	25 %	75 %	0 %	0 %	408671620
55	NC_018744	TCTA	2	8	13573	13580	25 %	50 %	0 %	25 %	408671620
56	NC_018744	TGAA	2	8	14074	14081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018744	AATG	2	8	14696	14703	50 %	25 %	25 %	0 %	408671621
58	NC_018744	TGCG	2	8	15512	15519	0 %	25 %	50 %	25 %	408671622
59	NC_018744	CCTC	2	8	15828	15835	0 %	25 %	0 %	75 %	408671622
60	NC_018744	CATT	2	8	15957	15964	25 %	50 %	0 %	25 %	408671622
61	NC_018744	AATA	2	8	16211	16218	75 %	25 %	0 %	0 %	408671622
62	NC_018744	ACCA	2	8	16513	16520	50 %	0 %	0 %	50 %	408671622
63	NC_018744	ATCA	2	8	16712	16719	50 %	25 %	0 %	25 %	408671622
64	NC_018744	TTAC	2	8	16743	16750	25 %	50 %	0 %	25 %	408671622
65	NC_018744	ATTG	2	8	17279	17286	25 %	50 %	25 %	0 %	408671622
66	NC_018744	AAGC	2	8	17391	17398	50 %	0 %	25 %	25 %	408671622
67	NC_018744	CTTG	2	8	18026	18033	0 %	50 %	25 %	25 %	408671623
68	NC_018744	TGTA	2	8	18263	18270	25 %	50 %	25 %	0 %	408671623
69	NC_018744	GTTT	2	8	18570	18577	0 %	75 %	25 %	0 %	408671623
70	NC_018744	TCTA	2	8	18759	18766	25 %	50 %	0 %	25 %	408671623
71	NC_018744	AAGA	2	8	19007	19014	75 %	0 %	25 %	0 %	408671623
72	NC_018744	ATTT	2	8	19272	19279	25 %	75 %	0 %	0 %	408671623
73	NC_018744	CACG	2	8	19556	19563	25 %	0 %	25 %	50 %	408671623
74	NC_018744	CAAT	2	8	19616	19623	50 %	25 %	0 %	25 %	408671623
75	NC_018744	TTCA	2	8	19737	19744	25 %	50 %	0 %	25 %	408671623
76	NC_018744	TAAT	2	8	20999	21006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018744	TTTA	2	8	21094	21101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018744	TGAT	2	8	21459	21466	25 %	50 %	25 %	0 %	408671625
79	NC_018744	ATGA	2	8	21481	21488	50 %	25 %	25 %	0 %	408671625
80	NC_018744	TGGA	2	8	21885	21892	25 %	25 %	50 %	0 %	408671625
81	NC_018744	AGTT	2	8	22715	22722	25 %	50 %	25 %	0 %	408671626
82	NC_018744	TTCA	2	8	22723	22730	25 %	50 %	0 %	25 %	408671626
83	NC_018744	ACTG	2	8	23051	23058	25 %	25 %	25 %	25 %	408671627
84	NC_018744	ATGC	2	8	23993	24000	25 %	25 %	25 %	25 %	408671627
85	NC_018744	ATTA	2	8	24359	24366	50 %	50 %	0 %	0 %	408671628
86	NC_018744	ATTT	2	8	24903	24910	25 %	75 %	0 %	0 %	408671628
87	NC_018744	AGAA	2	8	25214	25221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018744	GTAC	2	8	25400	25407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018744	ACTT	2	8	25550	25557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018744	CTAT	2	8	26102	26109	25 %	50 %	0 %	25 %	408671629
91	NC_018744	AATA	2	8	27607	27614	75 %	25 %	0 %	0 %	408671630
92	NC_018744	CCTC	2	8	28052	28059	0 %	25 %	0 %	75 %	408671630
93	NC_018744	AATA	2	8	28245	28252	75 %	25 %	0 %	0 %	408671630
94	NC_018744	ACCA	2	8	28440	28447	50 %	0 %	0 %	50 %	408671630
95	NC_018744	TGGA	2	8	28578	28585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018744	AATT	2	8	28906	28913	50 %	50 %	0 %	0 %	408671631
97	NC_018744	TCTT	2	8	29276	29283	0 %	75 %	0 %	25 %	408671631
98	NC_018744	TTTG	2	8	29514	29521	0 %	75 %	25 %	0 %	408671631
99	NC_018744	TCAA	2	8	29756	29763	50 %	25 %	0 %	25 %	408671631
100	NC_018744	TGAT	2	8	30193	30200	25 %	50 %	25 %	0 %	408671632
101	NC_018744	TGAT	2	8	31168	31175	25 %	50 %	25 %	0 %	408671632
102	NC_018744	TACG	2	8	31813	31820	25 %	25 %	25 %	25 %	408671632
103	NC_018744	GATT	2	8	32021	32028	25 %	50 %	25 %	0 %	408671632
104	NC_018744	TTTG	2	8	32359	32366	0 %	75 %	25 %	0 %	408671632
105	NC_018744	TTCC	2	8	32587	32594	0 %	50 %	0 %	50 %	408671632
106	NC_018744	AGGA	2	8	33725	33732	50 %	0 %	50 %	0 %	408671633
107	NC_018744	AATT	2	8	34083	34090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018744	AATT	2	8	34548	34555	50 %	50 %	0 %	0 %	408671634
109	NC_018744	TTTA	2	8	35316	35323	25 %	75 %	0 %	0 %	408671634
110	NC_018744	TGAC	2	8	35867	35874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018744	TATT	2	8	35882	35889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018744	ATTT	2	8	36007	36014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018744	ATTT	2	8	36194	36201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018744	TTTC	2	8	36497	36504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018744	CCTT	2	8	36673	36680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018744	TCAT	2	8	37022	37029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018744	GAAA	2	8	37152	37159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018744	GTTT	2	8	37161	37168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018744	AATT	2	8	37520	37527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018744	TACC	2	8	38230	38237	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018744	AAAT	2	8	38269	38276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.