MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL04

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018744	ACT	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018744	GAA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018744	AAC	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
4	NC_018744	TCG	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671612
5	NC_018744	ATG	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
6	NC_018744	TAC	2	6	379	384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
7	NC_018744	TAC	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
8	NC_018744	TTA	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
9	NC_018744	GAA	2	6	562	567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
10	NC_018744	CAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
11	NC_018744	GAA	3	9	1004	1012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
12	NC_018744	TGT	2	6	1054	1059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671612
13	NC_018744	GAA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
14	NC_018744	ATG	3	9	1308	1316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
15	NC_018744	AAT	2	6	1406	1411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
16	NC_018744	CGC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671612
17	NC_018744	AGA	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
18	NC_018744	AGA	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
19	NC_018744	ATA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
20	NC_018744	GAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
21	NC_018744	TAT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
22	NC_018744	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
23	NC_018744	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671612
24	NC_018744	AGT	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
25	NC_018744	GAG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
26	NC_018744	TTC	2	6	1977	1982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671612
27	NC_018744	AAT	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
28	NC_018744	AGT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
29	NC_018744	ATG	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
30	NC_018744	GAA	2	6	2216	2221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
31	NC_018744	GAT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
32	NC_018744	TGA	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
33	NC_018744	AGG	2	6	2631	2636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
34	NC_018744	GGA	2	6	2746	2751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
35	NC_018744	GTG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671612
36	NC_018744	AAT	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
37	NC_018744	GTA	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
38	NC_018744	GAT	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
39	NC_018744	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
40	NC_018744	AGG	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
41	NC_018744	ATC	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
42	NC_018744	GAT	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
43	NC_018744	AAC	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
44	NC_018744	ATT	2	6	3268	3273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
45	NC_018744	GTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671612
46	NC_018744	ATG	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
47	NC_018744	TGA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
48	NC_018744	TAA	2	6	3361	3366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
49	NC_018744	GGA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
50	NC_018744	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
51	NC_018744	TAC	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
52	NC_018744	GGT	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671612
53	NC_018744	TAA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
54	NC_018744	TGA	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
55	NC_018744	GTA	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
56	NC_018744	GAA	2	6	3884	3889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
57	NC_018744	TTA	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
58	NC_018744	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
59	NC_018744	ATG	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
60	NC_018744	TAA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
61	NC_018744	CAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
62	NC_018744	ATT	2	6	4607	4612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
63	NC_018744	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
64	NC_018744	ATT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
65	NC_018744	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
66	NC_018744	TAT	2	6	4954	4959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
67	NC_018744	ACA	2	6	4974	4979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
68	NC_018744	TGA	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
69	NC_018744	TGC	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671613
70	NC_018744	CAC	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671613
71	NC_018744	AAC	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671613
72	NC_018744	CCT	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671613
73	NC_018744	AAT	2	6	5552	5557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671613
74	NC_018744	ATT	3	9	5666	5674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018744	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018744	TAT	2	6	5721	5726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018744	TCT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018744	TAT	2	6	5853	5858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018744	AAG	2	6	5957	5962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671614
80	NC_018744	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671614
81	NC_018744	TGT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671614
82	NC_018744	CGG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408671614
83	NC_018744	CCA	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671614
84	NC_018744	TAA	2	6	6503	6508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671614
85	NC_018744	CTA	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671614
86	NC_018744	ATG	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671614
87	NC_018744	AAT	2	6	6839	6844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671614
88	NC_018744	ACC	2	6	6972	6977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671615
89	NC_018744	AGA	2	6	6987	6992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
90	NC_018744	TGA	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671615
91	NC_018744	AAG	2	6	7199	7204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
92	NC_018744	ACA	2	6	7286	7291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671615
93	NC_018744	GAA	2	6	7354	7359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
94	NC_018744	AGA	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
95	NC_018744	AAG	2	6	7646	7651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
96	NC_018744	AGA	2	6	7731	7736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
97	NC_018744	AGG	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018744	GAC	2	6	7885	7890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018744	ACT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018744	TAA	2	6	7981	7986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018744	TAT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018744	ATA	2	6	8080	8085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018744	ACA	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018744	ACT	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018744	TAT	2	6	8226	8231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018744	TAT	2	6	8290	8295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018744	TTG	2	6	8476	8481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671616
108	NC_018744	GAT	2	6	8537	8542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
109	NC_018744	ATG	2	6	8551	8556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
110	NC_018744	GAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
111	NC_018744	ATT	2	6	8717	8722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671616
112	NC_018744	TCT	2	6	8813	8818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671616
113	NC_018744	GAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
114	NC_018744	AAG	2	6	9028	9033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
115	NC_018744	AAG	2	6	9070	9075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
116	NC_018744	AGT	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
117	NC_018744	TAA	2	6	9242	9247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671616
118	NC_018744	GAT	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
119	NC_018744	AGG	2	6	9406	9411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671616
120	NC_018744	AGA	2	6	9485	9490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
121	NC_018744	TTG	2	6	9631	9636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671616
122	NC_018744	GGA	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671616
123	NC_018744	ATT	2	6	9782	9787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671616
124	NC_018744	TAT	2	6	9845	9850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018744	TCA	2	6	10011	10016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671617
126	NC_018744	GCT	2	6	10059	10064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671617
127	NC_018744	GAA	2	6	10074	10079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671617
128	NC_018744	GAA	2	6	10155	10160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671617
129	NC_018744	GTA	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018744	AAC	2	6	10516	10521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671618
131	NC_018744	ATG	2	6	10537	10542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671618
132	NC_018744	ATC	2	6	10648	10653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671618
133	NC_018744	ATA	2	6	10943	10948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671618
134	NC_018744	AAT	2	6	10984	10989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671618
135	NC_018744	TGT	2	6	11193	11198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671618
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137	NC_018744	ATA	2	6	11447	11452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671618
138	NC_018744	TTG	2	6	11455	11460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018744	ATT	2	6	11482	11487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018744	TCT	2	6	11877	11882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671619
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147	NC_018744	ATT	2	6	12519	12524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018744	CTG	2	6	12662	12667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018744	TGT	2	6	12703	12708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018744	TTA	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671620
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254	NC_018744	ATT	2	6	21819	21824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671625
255	NC_018744	ATA	2	6	22030	22035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_018744	ATT	2	6	22043	22048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_018744	AGT	2	6	22068	22073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018744	TTA	2	6	22235	22240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671626
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260	NC_018744	GGT	2	6	22467	22472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671626
261	NC_018744	TGA	2	6	22634	22639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671626
262	NC_018744	AAT	2	6	22758	22763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671626
263	NC_018744	ATT	2	6	22890	22895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671626
264	NC_018744	TGA	2	6	23008	23013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671627
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277	NC_018744	ATT	2	6	24083	24088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_018744	TTA	2	6	24538	24543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671628
285	NC_018744	GGT	2	6	24558	24563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671628
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293	NC_018744	ATC	2	6	24832	24837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671628
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297	NC_018744	AGT	2	6	25182	25187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018744	ACT	2	6	25271	25276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_018744	TTA	2	6	25277	25282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_018744	TTG	2	6	25753	25758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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363	NC_018744	ATT	2	6	29917	29922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
364	NC_018744	ATT	2	6	29925	29930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_018744	CAT	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671632
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383	NC_018744	ACC	2	6	31964	31969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671632
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385	NC_018744	TGA	2	6	32099	32104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671632
386	NC_018744	CCT	2	6	32106	32111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671632
387	NC_018744	TCT	2	6	32208	32213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671632
388	NC_018744	TCC	2	6	32282	32287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671632
389	NC_018744	TAA	2	6	32320	32325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671632
390	NC_018744	GTA	2	6	32412	32417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671632
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395	NC_018744	ATT	2	6	32817	32822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_018744	ATT	2	6	34195	34200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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