MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL04

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018744	ACT	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018744	GAA	2	6	162	167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018744	ATT	3	9	5666	5674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018744	TAA	2	6	5681	5686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018744	TAT	2	6	5721	5726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018744	TCT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018744	TAT	2	6	5853	5858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018744	AGG	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018744	GAC	2	6	7885	7890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018744	ACT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018744	TAA	2	6	7981	7986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018744	TAT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018744	ATA	2	6	8080	8085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018744	ACA	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018744	ACT	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018744	TAT	2	6	8226	8231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018744	TAT	2	6	8290	8295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018744	TAT	2	6	9845	9850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018744	GTA	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018744	TTG	2	6	11455	11460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018744	ATT	2	6	11482	11487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018744	ATT	2	6	12519	12524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018744	CTG	2	6	12662	12667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018744	TGT	2	6	12703	12708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018744	CAG	2	6	13824	13829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018744	GAA	2	6	13925	13930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018744	AAT	2	6	13962	13967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018744	CTA	2	6	14007	14012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018744	ATC	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018744	TTG	2	6	17777	17782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018744	ATG	2	6	19869	19874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018744	AAT	2	6	19954	19959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018744	AAT	2	6	20025	20030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018744	TAA	2	6	20152	20157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018744	TAG	2	6	20221	20226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018744	AGT	2	6	20303	20308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018744	AGA	2	6	20323	20328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018744	CTT	2	6	20350	20355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018744	ACA	2	6	21009	21014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018744	CAA	2	6	21064	21069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018744	AAT	2	6	21130	21135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018744	ATA	2	6	22030	22035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018744	ATT	2	6	22043	22048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018744	AGT	2	6	22068	22073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018744	AAT	2	6	24039	24044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018744	ATT	2	6	24083	24088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018744	AAT	2	6	25011	25016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018744	TGT	2	6	25034	25039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018744	ATG	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018744	AGT	2	6	25182	25187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018744	ACT	2	6	25271	25276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018744	TTA	2	6	25277	25282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018744	CTA	2	6	25440	25445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018744	CGC	2	6	25616	25621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018744	GAA	2	6	25725	25730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018744	TTG	2	6	25753	25758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018744	GTA	2	6	25796	25801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018744	ATT	2	6	29917	29922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018744	ATT	2	6	29925	29930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018744	TAT	2	6	32802	32807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018744	ATT	2	6	32817	32822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018744	ATT	2	6	32876	32881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018744	AAT	2	6	34007	34012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018744	AGT	2	6	34025	34030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018744	ATA	2	6	34122	34127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018744	ATT	2	6	34154	34159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018744	ATT	2	6	34195	34200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018744	ATT	2	6	35861	35866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018744	AAT	2	6	35894	35899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018744	ATT	2	6	36115	36120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018744	TAA	2	6	36234	36239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018744	AGC	2	6	36264	36269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018744	AAT	2	6	36360	36365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018744	TAA	2	6	36466	36471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018744	GTT	2	6	36477	36482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018744	ACT	2	6	36484	36489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018744	ACC	2	6	36550	36555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018744	TTA	2	6	36566	36571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018744	TTC	2	6	36655	36660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018744	TGA	2	6	36705	36710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018744	AGC	2	6	36760	36765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018744	TTG	2	6	36843	36848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018744	CCT	2	6	36884	36889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018744	CGG	2	6	36900	36905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018744	TCG	2	6	36998	37003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018744	TAC	2	6	37083	37088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018744	CAA	2	6	37095	37100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018744	TTC	2	6	37218	37223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018744	CAC	2	6	37244	37249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018744	TGT	2	6	37297	37302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018744	TAA	2	6	37320	37325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018744	ACT	2	6	37561	37566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018744	GCT	2	6	37654	37659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018744	GCG	2	6	37717	37722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018744	ATC	2	6	37827	37832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018744	TAC	2	6	37842	37847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018744	ATA	2	6	37909	37914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018744	TAA	2	6	37983	37988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018744	TAA	2	6	38033	38038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018744	AAT	2	6	38135	38140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018744	ATT	2	6	38157	38162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018744	ATT	2	6	38187	38192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018744	TAA	2	6	38286	38291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018744	TGT	2	6	38364	38369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.