MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL04

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018744	AAC	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
2	NC_018744	TCG	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671612
3	NC_018744	ATG	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
4	NC_018744	TAC	2	6	379	384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
5	NC_018744	TAC	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
6	NC_018744	TTA	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
7	NC_018744	GAA	2	6	562	567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
8	NC_018744	CAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
9	NC_018744	GAA	3	9	1004	1012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
10	NC_018744	TGT	2	6	1054	1059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671612
11	NC_018744	GAA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
12	NC_018744	ATG	3	9	1308	1316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
13	NC_018744	AAT	2	6	1406	1411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
14	NC_018744	CGC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671612
15	NC_018744	AGA	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
16	NC_018744	AGA	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
17	NC_018744	ATA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
18	NC_018744	GAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
19	NC_018744	TAT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
20	NC_018744	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
21	NC_018744	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671612
22	NC_018744	AGT	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
23	NC_018744	GAG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
24	NC_018744	TTC	2	6	1977	1982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671612
25	NC_018744	AAT	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
26	NC_018744	AGT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
27	NC_018744	ATG	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
28	NC_018744	GAA	2	6	2216	2221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
29	NC_018744	GAT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
30	NC_018744	TGA	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
31	NC_018744	AGG	2	6	2631	2636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
32	NC_018744	GGA	2	6	2746	2751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
33	NC_018744	GTG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671612
34	NC_018744	AAT	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
35	NC_018744	GTA	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
36	NC_018744	GAT	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
37	NC_018744	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
38	NC_018744	AGG	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
39	NC_018744	ATC	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
40	NC_018744	GAT	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
41	NC_018744	AAC	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
42	NC_018744	ATT	2	6	3268	3273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
43	NC_018744	GTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671612
44	NC_018744	ATG	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
45	NC_018744	TGA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
46	NC_018744	TAA	2	6	3361	3366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
47	NC_018744	GGA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
48	NC_018744	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
49	NC_018744	TAC	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
50	NC_018744	GGT	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671612
51	NC_018744	TAA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
52	NC_018744	TGA	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
53	NC_018744	GTA	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
54	NC_018744	GAA	2	6	3884	3889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
55	NC_018744	TTA	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
56	NC_018744	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
57	NC_018744	ATG	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
58	NC_018744	TAA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
59	NC_018744	CAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
60	NC_018744	ATT	2	6	4607	4612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
61	NC_018744	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
62	NC_018744	ATT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
63	NC_018744	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
64	NC_018744	TAT	2	6	4954	4959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
65	NC_018744	ACA	2	6	4974	4979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
66	NC_018744	TGA	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
67	NC_018744	TGC	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671613
68	NC_018744	CAC	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671613
69	NC_018744	AAC	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671613
70	NC_018744	CCT	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671613
71	NC_018744	AAT	2	6	5552	5557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671613
72	NC_018744	AAG	2	6	5957	5962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671614
73	NC_018744	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671614
74	NC_018744	TGT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671614
75	NC_018744	CGG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408671614
76	NC_018744	CCA	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671614
77	NC_018744	TAA	2	6	6503	6508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671614
78	NC_018744	CTA	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671614
79	NC_018744	ATG	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671614
80	NC_018744	AAT	2	6	6839	6844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671614
81	NC_018744	ACC	2	6	6972	6977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671615
82	NC_018744	AGA	2	6	6987	6992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
83	NC_018744	TGA	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671615
84	NC_018744	AAG	2	6	7199	7204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
85	NC_018744	ACA	2	6	7286	7291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671615
86	NC_018744	GAA	2	6	7354	7359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
87	NC_018744	AGA	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
88	NC_018744	AAG	2	6	7646	7651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
89	NC_018744	AGA	2	6	7731	7736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671615
90	NC_018744	TTG	2	6	8476	8481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671616
91	NC_018744	GAT	2	6	8537	8542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
92	NC_018744	ATG	2	6	8551	8556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
93	NC_018744	GAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
94	NC_018744	ATT	2	6	8717	8722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671616
95	NC_018744	TCT	2	6	8813	8818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671616
96	NC_018744	GAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
97	NC_018744	AAG	2	6	9028	9033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
98	NC_018744	AAG	2	6	9070	9075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
99	NC_018744	AGT	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
100	NC_018744	TAA	2	6	9242	9247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671616
101	NC_018744	GAT	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671616
102	NC_018744	AGG	2	6	9406	9411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671616
103	NC_018744	AGA	2	6	9485	9490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671616
104	NC_018744	TTG	2	6	9631	9636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671616
105	NC_018744	GGA	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671616
106	NC_018744	ATT	2	6	9782	9787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671616
107	NC_018744	TCA	2	6	10011	10016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671617
108	NC_018744	GCT	2	6	10059	10064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671617
109	NC_018744	GAA	2	6	10074	10079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671617
110	NC_018744	GAA	2	6	10155	10160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671617
111	NC_018744	AAC	2	6	10516	10521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671618
112	NC_018744	ATG	2	6	10537	10542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671618
113	NC_018744	ATC	2	6	10648	10653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671618
114	NC_018744	ATA	2	6	10943	10948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671618
115	NC_018744	AAT	2	6	10984	10989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671618
116	NC_018744	TGT	2	6	11193	11198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671618
117	NC_018744	CTT	2	6	11343	11348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671618
118	NC_018744	ATA	2	6	11447	11452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671618
119	NC_018744	TCT	2	6	11877	11882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671619
120	NC_018744	CCT	2	6	11959	11964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671619
121	NC_018744	TTA	2	6	11994	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671619
122	NC_018744	AAT	2	6	12054	12059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671619
123	NC_018744	ACA	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671619
124	NC_018744	ATT	3	9	12194	12202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671619
125	NC_018744	TAT	2	6	12293	12298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671619
126	NC_018744	TTA	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671620
127	NC_018744	ATC	2	6	12830	12835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671620
128	NC_018744	GAA	3	9	12958	12966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671620
129	NC_018744	ATT	2	6	13031	13036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671620
130	NC_018744	AAT	2	6	13087	13092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671620
131	NC_018744	AGA	2	6	13179	13184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671620
132	NC_018744	TAA	2	6	13505	13510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671620
133	NC_018744	GTT	2	6	13558	13563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671620
134	NC_018744	CAA	2	6	13666	13671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671620
135	NC_018744	TTA	2	6	13676	13681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671620
136	NC_018744	GTA	2	6	13685	13690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671620
137	NC_018744	CAT	2	6	13703	13708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671620
138	NC_018744	TCA	2	6	13733	13738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671620
139	NC_018744	TGC	2	6	13740	13745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671620
140	NC_018744	AAG	2	6	13811	13816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671620
141	NC_018744	TAA	2	6	14489	14494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671621
142	NC_018744	GTT	2	6	14508	14513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671621
143	NC_018744	TTA	2	6	14553	14558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671621
144	NC_018744	ATT	2	6	14565	14570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671621
145	NC_018744	TAT	2	6	14976	14981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671622
146	NC_018744	TTC	3	9	14994	15002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671622
147	NC_018744	ATC	4	12	15029	15040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671622
148	NC_018744	TTC	2	6	15074	15079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671622
149	NC_018744	CAT	2	6	15229	15234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671622
150	NC_018744	TAC	2	6	15283	15288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671622
151	NC_018744	CCA	2	6	15340	15345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671622
152	NC_018744	TAC	2	6	15352	15357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671622
153	NC_018744	TAA	2	6	15403	15408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671622
154	NC_018744	TGA	2	6	15668	15673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671622
155	NC_018744	CTG	2	6	15862	15867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671622
156	NC_018744	CCG	2	6	15924	15929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671622
157	NC_018744	GCC	2	6	15936	15941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671622
158	NC_018744	AGA	2	6	16018	16023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671622
159	NC_018744	AGC	2	6	16055	16060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671622
160	NC_018744	TCA	2	6	16185	16190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671622
161	NC_018744	ATT	2	6	16301	16306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671622
162	NC_018744	TCA	2	6	16341	16346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671622
163	NC_018744	CCA	2	6	16386	16391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671622
164	NC_018744	CAT	2	6	16483	16488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671622
165	NC_018744	CAA	2	6	16591	16596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671622
166	NC_018744	CTC	2	6	16642	16647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671622
167	NC_018744	ATT	2	6	16733	16738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671622
168	NC_018744	ACC	2	6	16793	16798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671622
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171	NC_018744	CAC	2	6	17338	17343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671622
172	NC_018744	TAA	2	6	17473	17478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671622
173	NC_018744	TAA	2	6	17593	17598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671622
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181	NC_018744	ATT	2	6	18384	18389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671623
182	NC_018744	ATT	2	6	18408	18413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671623
183	NC_018744	ATC	2	6	18459	18464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671623
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242	NC_018744	AGA	2	6	24662	24667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671628
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247	NC_018744	ATC	2	6	24832	24837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671628
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253	NC_018744	GCA	2	6	26216	26221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671629
254	NC_018744	CTC	2	6	26223	26228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671629
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256	NC_018744	TTC	2	6	26341	26346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671629
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260	NC_018744	CAT	2	6	26571	26576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671629
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373	NC_018744	CAA	2	6	35800	35805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.