MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	TTTGAA	2	12	182	193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671741
2	NC_018743	CTTATG	2	12	212	223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408671741
3	NC_018743	CTACAA	2	12	2748	2759	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408671741
4	NC_018743	AACTAC	2	12	7903	7914	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018743	TATCAA	2	12	8023	8034	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018743	TCAATT	2	12	13534	13545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671747
7	NC_018743	CAACAG	2	12	13851	13862	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671747
8	NC_018743	ATTTAG	2	12	19567	19578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671752
9	NC_018743	GCAAGA	2	12	23283	23294	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408671755
10	NC_018743	GCAAAA	2	12	23762	23773	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408671756
11	NC_018743	ATTAAT	2	12	25017	25028	50 %	50 %	0 %	0 %	408671758
12	NC_018743	TTCTTT	2	12	29187	29198	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408671758
13	NC_018743	AAATCC	2	12	33769	33780	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408671761
14	NC_018743	ATTAAA	2	12	35121	35132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671761
15	NC_018743	GTAGGA	2	12	37924	37935	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	408671761
16	NC_018743	GGTACT	2	12	40113	40124	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408671761
17	NC_018743	GCCATA	2	12	40718	40729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408671762
18	NC_018743	CCGATG	2	12	40834	40845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408671762
19	NC_018743	TTTGAG	2	12	41429	41440	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408671762
20	NC_018743	TCACCG	2	12	44749	44760	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	408671763
21	NC_018743	TTTCCA	2	12	45303	45314	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408671763
22	NC_018743	ACCATT	2	12	45755	45766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671763
23	NC_018743	CCATTG	2	12	48693	48704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408671763
24	NC_018743	AGAACA	2	12	54623	54634	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	408671766
25	NC_018743	AATATT	2	12	58778	58789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.