MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	AAATC	2	10	657	666	60 %	20 %	0 %	20 %	408671741
2	NC_018743	CTCGA	2	10	1612	1621	20 %	20 %	20 %	40 %	408671741
3	NC_018743	TATTT	2	10	2141	2150	20 %	80 %	0 %	0 %	408671741
4	NC_018743	AAGAA	2	10	3585	3594	80 %	0 %	20 %	0 %	408671742
5	NC_018743	GCCAA	2	10	5906	5915	40 %	0 %	20 %	40 %	408671742
6	NC_018743	CAAAA	2	10	6678	6687	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018743	AAACG	2	10	6752	6761	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018743	AAATT	2	10	10077	10086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018743	TATTT	2	10	10537	10546	20 %	80 %	0 %	0 %	408671744
10	NC_018743	AAATT	2	10	11724	11733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018743	ACAAG	2	10	12633	12642	60 %	0 %	20 %	20 %	408671746
12	NC_018743	CTTTT	2	10	13251	13260	0 %	80 %	0 %	20 %	408671747
13	NC_018743	GGAAA	2	10	14484	14493	60 %	0 %	40 %	0 %	408671747
14	NC_018743	TAAAC	2	10	14869	14878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018743	CATAA	2	10	15337	15346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018743	AATCA	2	10	16021	16030	60 %	20 %	0 %	20 %	408671748
17	NC_018743	AATTT	2	10	16816	16825	40 %	60 %	0 %	0 %	408671749
18	NC_018743	GAGCC	2	10	17823	17832	20 %	0 %	40 %	40 %	408671750
19	NC_018743	TAAAT	2	10	18172	18181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018743	TTTAG	2	10	19064	19073	20 %	60 %	20 %	0 %	408671752
21	NC_018743	AAAAG	2	10	19696	19705	80 %	0 %	20 %	0 %	408671752
22	NC_018743	AATAA	2	10	20438	20447	80 %	20 %	0 %	0 %	408671753
23	NC_018743	TTTTA	2	10	21128	21137	20 %	80 %	0 %	0 %	408671753
24	NC_018743	TCTTA	2	10	21419	21428	20 %	60 %	0 %	20 %	408671753
25	NC_018743	TACTT	2	10	22485	22494	20 %	60 %	0 %	20 %	408671753
26	NC_018743	TGAAT	2	10	22866	22875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018743	TTAGA	2	10	24535	24544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018743	CATTA	2	10	24580	24589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018743	GTTTT	2	10	24808	24817	0 %	80 %	20 %	0 %	408671757
30	NC_018743	CTTTG	2	10	26103	26112	0 %	60 %	20 %	20 %	408671758
31	NC_018743	TATGG	2	10	26343	26352	20 %	40 %	40 %	0 %	408671758
32	NC_018743	ACTTT	2	10	27764	27773	20 %	60 %	0 %	20 %	408671758
33	NC_018743	TTTTG	2	10	28352	28361	0 %	80 %	20 %	0 %	408671758
34	NC_018743	AGCTA	2	10	32976	32985	40 %	20 %	20 %	20 %	408671761
35	NC_018743	GTAAT	2	10	33544	33553	40 %	40 %	20 %	0 %	408671761
36	NC_018743	CTTCT	2	10	34872	34881	0 %	60 %	0 %	40 %	408671761
37	NC_018743	AAAAC	2	10	39689	39698	80 %	0 %	0 %	20 %	408671761
38	NC_018743	ATTAT	2	10	40274	40283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018743	GCAAA	2	10	40846	40855	60 %	0 %	20 %	20 %	408671762
40	NC_018743	AGTCG	2	10	41631	41640	20 %	20 %	40 %	20 %	408671762
41	NC_018743	TTGGT	2	10	42682	42691	0 %	60 %	40 %	0 %	408671763
42	NC_018743	TTCAC	2	10	42792	42801	20 %	40 %	0 %	40 %	408671763
43	NC_018743	GAATA	2	10	43096	43105	60 %	20 %	20 %	0 %	408671763
44	NC_018743	AGATT	2	10	46092	46101	40 %	40 %	20 %	0 %	408671763
45	NC_018743	GTACC	2	10	47665	47674	20 %	20 %	20 %	40 %	408671763
46	NC_018743	CTAAA	2	10	48619	48628	60 %	20 %	0 %	20 %	408671763
47	NC_018743	TTTTA	2	10	49396	49405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018743	TCTTT	2	10	53279	53288	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018743	ATTAG	2	10	53907	53916	40 %	40 %	20 %	0 %	408671766
50	NC_018743	ATTTA	2	10	54857	54866	40 %	60 %	0 %	0 %	408671766
51	NC_018743	GTAGG	2	10	54967	54976	20 %	20 %	60 %	0 %	408671766
52	NC_018743	AATAA	2	10	56293	56302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018743	TCCAA	2	10	58626	58635	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.