MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	TAAT	2	8	70	77	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018743	CAAA	2	8	486	493	75 %	0 %	0 %	25 %	408671741
3	NC_018743	ATTT	2	8	774	781	25 %	75 %	0 %	0 %	408671741
4	NC_018743	GACT	2	8	970	977	25 %	25 %	25 %	25 %	408671741
5	NC_018743	TCAA	2	8	2104	2111	50 %	25 %	0 %	25 %	408671741
6	NC_018743	ATCT	2	8	2323	2330	25 %	50 %	0 %	25 %	408671741
7	NC_018743	ACCC	2	8	2380	2387	25 %	0 %	0 %	75 %	408671741
8	NC_018743	ATGG	2	8	2409	2416	25 %	25 %	50 %	0 %	408671741
9	NC_018743	TTTG	2	8	2603	2610	0 %	75 %	25 %	0 %	408671741
10	NC_018743	GCTT	2	8	2630	2637	0 %	50 %	25 %	25 %	408671741
11	NC_018743	CTTT	2	8	3371	3378	0 %	75 %	0 %	25 %	408671742
12	NC_018743	TTCG	2	8	3388	3395	0 %	50 %	25 %	25 %	408671742
13	NC_018743	AGGT	2	8	3621	3628	25 %	25 %	50 %	0 %	408671742
14	NC_018743	CAAA	2	8	3804	3811	75 %	0 %	0 %	25 %	408671742
15	NC_018743	GGTA	2	8	4515	4522	25 %	25 %	50 %	0 %	408671742
16	NC_018743	ACGA	2	8	4852	4859	50 %	0 %	25 %	25 %	408671742
17	NC_018743	GCCA	2	8	4947	4954	25 %	0 %	25 %	50 %	408671742
18	NC_018743	ACCA	2	8	5436	5443	50 %	0 %	0 %	50 %	408671742
19	NC_018743	TATT	2	8	5953	5960	25 %	75 %	0 %	0 %	408671742
20	NC_018743	GAAT	2	8	6383	6390	50 %	25 %	25 %	0 %	408671743
21	NC_018743	GAAA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018743	TCAT	2	8	7541	7548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018743	TAAA	2	8	7567	7574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018743	AATT	2	8	7585	7592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018743	GTTT	2	8	8353	8360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018743	TCAT	2	8	9019	9026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018743	CATC	2	8	9306	9313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018743	TATT	2	8	9517	9524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018743	CGAC	2	8	9592	9599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018743	CGAC	2	8	9975	9982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018743	GGTA	2	8	10748	10755	25 %	25 %	50 %	0 %	408671744
32	NC_018743	ATTC	2	8	10948	10955	25 %	50 %	0 %	25 %	408671744
33	NC_018743	GTTG	2	8	11153	11160	0 %	50 %	50 %	0 %	408671744
34	NC_018743	TTTG	2	8	11180	11187	0 %	75 %	25 %	0 %	408671744
35	NC_018743	TTTG	2	8	11210	11217	0 %	75 %	25 %	0 %	408671744
36	NC_018743	TAAA	2	8	11713	11720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018743	TAGA	2	8	11771	11778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018743	ACTT	2	8	11848	11855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018743	ACAA	2	8	12017	12024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018743	GGGA	2	8	12085	12092	25 %	0 %	75 %	0 %	408671745
41	NC_018743	CTCA	2	8	12166	12173	25 %	25 %	0 %	50 %	408671745
42	NC_018743	TACT	2	8	12306	12313	25 %	50 %	0 %	25 %	408671745
43	NC_018743	GTAA	2	8	12946	12953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018743	ATTT	2	8	13376	13383	25 %	75 %	0 %	0 %	408671747
45	NC_018743	AAAG	2	8	13639	13646	75 %	0 %	25 %	0 %	408671747
46	NC_018743	ATTC	2	8	13895	13902	25 %	50 %	0 %	25 %	408671747
47	NC_018743	CAGA	2	8	14472	14479	50 %	0 %	25 %	25 %	408671747
48	NC_018743	GACA	2	8	14702	14709	50 %	0 %	25 %	25 %	408671747
49	NC_018743	CGAA	2	8	15124	15131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018743	TGAG	2	8	15429	15436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018743	AAAG	2	8	15584	15591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018743	TAAA	2	8	15862	15869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018743	AAAC	2	8	16087	16094	75 %	0 %	0 %	25 %	408671748
54	NC_018743	TGGC	2	8	16295	16302	0 %	25 %	50 %	25 %	408671748
55	NC_018743	TAGA	2	8	16449	16456	50 %	25 %	25 %	0 %	408671748
56	NC_018743	ATTT	2	8	16476	16483	25 %	75 %	0 %	0 %	408671748
57	NC_018743	TTTC	2	8	16502	16509	0 %	75 %	0 %	25 %	408671748
58	NC_018743	TTTG	2	8	16792	16799	0 %	75 %	25 %	0 %	408671749
59	NC_018743	AATA	2	8	17074	17081	75 %	25 %	0 %	0 %	408671749
60	NC_018743	CAAA	2	8	17547	17554	75 %	0 %	0 %	25 %	408671750
61	NC_018743	GATT	2	8	18702	18709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018743	AAGC	2	8	20243	20250	50 %	0 %	25 %	25 %	408671753
63	NC_018743	ATCC	2	8	20273	20280	25 %	25 %	0 %	50 %	408671753
64	NC_018743	ATTG	2	8	20363	20370	25 %	50 %	25 %	0 %	408671753
65	NC_018743	CTTT	2	8	20526	20533	0 %	75 %	0 %	25 %	408671753
66	NC_018743	AATC	2	8	20749	20756	50 %	25 %	0 %	25 %	408671753
67	NC_018743	TAAT	2	8	21318	21325	50 %	50 %	0 %	0 %	408671753
68	NC_018743	ATCA	2	8	21447	21454	50 %	25 %	0 %	25 %	408671753
69	NC_018743	TAAG	2	8	21555	21562	50 %	25 %	25 %	0 %	408671753
70	NC_018743	CAAT	2	8	21634	21641	50 %	25 %	0 %	25 %	408671753
71	NC_018743	TTTA	2	8	21802	21809	25 %	75 %	0 %	0 %	408671753
72	NC_018743	TTCA	2	8	21829	21836	25 %	50 %	0 %	25 %	408671753
73	NC_018743	ATTT	2	8	22067	22074	25 %	75 %	0 %	0 %	408671753
74	NC_018743	AAAC	2	8	22155	22162	75 %	0 %	0 %	25 %	408671753
75	NC_018743	CAAT	2	8	22261	22268	50 %	25 %	0 %	25 %	408671753
76	NC_018743	CTAC	2	8	22269	22276	25 %	25 %	0 %	50 %	408671753
77	NC_018743	TTAC	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018743	AAAG	2	8	23013	23020	75 %	0 %	25 %	0 %	408671755
79	NC_018743	TAAA	2	8	23029	23036	75 %	25 %	0 %	0 %	408671755
80	NC_018743	AGAA	2	8	23255	23262	75 %	0 %	25 %	0 %	408671755
81	NC_018743	AATG	2	8	23506	23513	50 %	25 %	25 %	0 %	408671755
82	NC_018743	ATTC	2	8	23791	23798	25 %	50 %	0 %	25 %	408671756
83	NC_018743	AAAT	2	8	23985	23992	75 %	25 %	0 %	0 %	408671756
84	NC_018743	TACA	2	8	24107	24114	50 %	25 %	0 %	25 %	408671756
85	NC_018743	TGAA	2	8	24252	24259	50 %	25 %	25 %	0 %	408671756
86	NC_018743	TTCA	2	8	24706	24713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018743	ATTA	2	8	24907	24914	50 %	50 %	0 %	0 %	408671757
88	NC_018743	ATTG	2	8	25525	25532	25 %	50 %	25 %	0 %	408671758
89	NC_018743	TACT	2	8	25606	25613	25 %	50 %	0 %	25 %	408671758
90	NC_018743	CATA	2	8	25663	25670	50 %	25 %	0 %	25 %	408671758
91	NC_018743	CAAT	2	8	25927	25934	50 %	25 %	0 %	25 %	408671758
92	NC_018743	TTGT	2	8	26092	26099	0 %	75 %	25 %	0 %	408671758
93	NC_018743	ATTT	2	8	26537	26544	25 %	75 %	0 %	0 %	408671758
94	NC_018743	TATT	2	8	26905	26912	25 %	75 %	0 %	0 %	408671758
95	NC_018743	CATC	2	8	27805	27812	25 %	25 %	0 %	50 %	408671758
96	NC_018743	TCTT	2	8	27814	27821	0 %	75 %	0 %	25 %	408671758
97	NC_018743	CATA	2	8	28177	28184	50 %	25 %	0 %	25 %	408671758
98	NC_018743	CTTC	2	8	28186	28193	0 %	50 %	0 %	50 %	408671758
99	NC_018743	CATC	2	8	28315	28322	25 %	25 %	0 %	50 %	408671758
100	NC_018743	GTGA	2	8	29158	29165	25 %	25 %	50 %	0 %	408671758
101	NC_018743	AAGA	2	8	29203	29210	75 %	0 %	25 %	0 %	408671758
102	NC_018743	TTTG	2	8	29628	29635	0 %	75 %	25 %	0 %	408671758
103	NC_018743	ATAG	2	8	30072	30079	50 %	25 %	25 %	0 %	408671758
104	NC_018743	TTTC	2	8	30215	30222	0 %	75 %	0 %	25 %	408671758
105	NC_018743	TCTT	2	8	30853	30860	0 %	75 %	0 %	25 %	408671759
106	NC_018743	TGCT	2	8	30962	30969	0 %	50 %	25 %	25 %	408671759
107	NC_018743	CAAA	2	8	31717	31724	75 %	0 %	0 %	25 %	408671760
108	NC_018743	GTTT	2	8	31972	31979	0 %	75 %	25 %	0 %	408671760
109	NC_018743	CTTT	2	8	32056	32063	0 %	75 %	0 %	25 %	408671760
110	NC_018743	CTAT	2	8	32146	32153	25 %	50 %	0 %	25 %	408671761
111	NC_018743	CATA	2	8	32290	32297	50 %	25 %	0 %	25 %	408671761
112	NC_018743	TTTA	2	8	32682	32689	25 %	75 %	0 %	0 %	408671761
113	NC_018743	GCTT	2	8	33307	33314	0 %	50 %	25 %	25 %	408671761
114	NC_018743	TAAA	2	8	33371	33378	75 %	25 %	0 %	0 %	408671761
115	NC_018743	TAAA	2	8	33468	33475	75 %	25 %	0 %	0 %	408671761
116	NC_018743	CTTT	2	8	33595	33602	0 %	75 %	0 %	25 %	408671761
117	NC_018743	GGTT	2	8	33603	33610	0 %	50 %	50 %	0 %	408671761
118	NC_018743	AAAT	2	8	34071	34078	75 %	25 %	0 %	0 %	408671761
119	NC_018743	TAGA	2	8	34509	34516	50 %	25 %	25 %	0 %	408671761
120	NC_018743	AGTT	2	8	34748	34755	25 %	50 %	25 %	0 %	408671761
121	NC_018743	CCAT	2	8	35659	35666	25 %	25 %	0 %	50 %	408671761
122	NC_018743	TAGT	2	8	35876	35883	25 %	50 %	25 %	0 %	408671761
123	NC_018743	ATTG	2	8	36054	36061	25 %	50 %	25 %	0 %	408671761
124	NC_018743	GCTT	2	8	36867	36874	0 %	50 %	25 %	25 %	408671761
125	NC_018743	AATA	2	8	37742	37749	75 %	25 %	0 %	0 %	408671761
126	NC_018743	GTTT	2	8	38308	38315	0 %	75 %	25 %	0 %	408671761
127	NC_018743	AAGG	2	8	38745	38752	50 %	0 %	50 %	0 %	408671761
128	NC_018743	GAAG	2	8	39124	39131	50 %	0 %	50 %	0 %	408671761
129	NC_018743	TCTT	2	8	39471	39478	0 %	75 %	0 %	25 %	408671761
130	NC_018743	TGAA	2	8	40202	40209	50 %	25 %	25 %	0 %	408671761
131	NC_018743	TCCT	2	8	40425	40432	0 %	50 %	0 %	50 %	408671762
132	NC_018743	TTTG	2	8	40450	40457	0 %	75 %	25 %	0 %	408671762
133	NC_018743	TAAA	2	8	40460	40467	75 %	25 %	0 %	0 %	408671762
134	NC_018743	CATT	2	8	40678	40685	25 %	50 %	0 %	25 %	408671762
135	NC_018743	CCCT	2	8	40769	40776	0 %	25 %	0 %	75 %	408671762
136	NC_018743	TGAT	2	8	40878	40885	25 %	50 %	25 %	0 %	408671762
137	NC_018743	CTGA	2	8	41395	41402	25 %	25 %	25 %	25 %	408671762
138	NC_018743	TAAA	2	8	41521	41528	75 %	25 %	0 %	0 %	408671762
139	NC_018743	AATC	2	8	43018	43025	50 %	25 %	0 %	25 %	408671763
140	NC_018743	TTCA	2	8	43172	43179	25 %	50 %	0 %	25 %	408671763
141	NC_018743	CGCA	2	8	43277	43284	25 %	0 %	25 %	50 %	408671763
142	NC_018743	GCTT	2	8	43497	43504	0 %	50 %	25 %	25 %	408671763
143	NC_018743	AATA	2	8	43654	43661	75 %	25 %	0 %	0 %	408671763
144	NC_018743	GGTA	2	8	44527	44534	25 %	25 %	50 %	0 %	408671763
145	NC_018743	AGGT	2	8	44695	44702	25 %	25 %	50 %	0 %	408671763
146	NC_018743	TAGT	2	8	44805	44812	25 %	50 %	25 %	0 %	408671763
147	NC_018743	CCCG	2	8	44843	44850	0 %	0 %	25 %	75 %	408671763
148	NC_018743	GCTC	2	8	45898	45905	0 %	25 %	25 %	50 %	408671763
149	NC_018743	TCGG	2	8	46362	46369	0 %	25 %	50 %	25 %	408671763
150	NC_018743	TACT	2	8	46855	46862	25 %	50 %	0 %	25 %	408671763
151	NC_018743	TTGG	2	8	47299	47306	0 %	50 %	50 %	0 %	408671763
152	NC_018743	CTTT	2	8	47325	47332	0 %	75 %	0 %	25 %	408671763
153	NC_018743	AGGC	2	8	47437	47444	25 %	0 %	50 %	25 %	408671763
154	NC_018743	GTAA	2	8	48680	48687	50 %	25 %	25 %	0 %	408671763
155	NC_018743	AATA	2	8	49381	49388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018743	AGGT	2	8	49662	49669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018743	ACTT	2	8	49938	49945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_018743	AAAG	2	8	50193	50200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018743	ACCT	2	8	50661	50668	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_018743	TGTC	2	8	50869	50876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_018743	TATC	2	8	51004	51011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_018743	TCTT	2	8	51548	51555	0 %	75 %	0 %	25 %	408671764
163	NC_018743	CATA	2	8	52082	52089	50 %	25 %	0 %	25 %	408671765
164	NC_018743	TAAA	2	8	52244	52251	75 %	25 %	0 %	0 %	408671765
165	NC_018743	CAGT	2	8	52262	52269	25 %	25 %	25 %	25 %	408671765
166	NC_018743	GGTA	2	8	52328	52335	25 %	25 %	50 %	0 %	408671765
167	NC_018743	GAGG	2	8	52408	52415	25 %	0 %	75 %	0 %	408671765
168	NC_018743	AATG	2	8	52594	52601	50 %	25 %	25 %	0 %	408671765
169	NC_018743	TTTG	2	8	52607	52614	0 %	75 %	25 %	0 %	408671765
170	NC_018743	TCAA	2	8	52666	52673	50 %	25 %	0 %	25 %	408671765
171	NC_018743	CTTT	2	8	53234	53241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_018743	TCTT	2	8	53326	53333	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_018743	CTTT	2	8	53338	53345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_018743	GAAA	2	8	54602	54609	75 %	0 %	25 %	0 %	408671766
175	NC_018743	AGCC	2	8	55189	55196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_018743	TCCA	2	8	55587	55594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
177	NC_018743	CAAA	2	8	55599	55606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
178	NC_018743	CTTC	2	8	56148	56155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_018743	GAAA	2	8	56728	56735	75 %	0 %	25 %	0 %	408671767
180	NC_018743	ACCG	2	8	57567	57574	25 %	0 %	25 %	50 %	408671768
181	NC_018743	ATTG	2	8	58200	58207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018743	CTAC	2	8	58656	58663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_018743	ATAA	2	8	58817	58824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018743	ATTA	2	8	58914	58921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.