MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	GGC	2	6	85	90	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018743	GAA	2	6	111	116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018743	TAA	2	6	3247	3252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018743	ACA	2	6	3280	3285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018743	AAT	2	6	3320	3325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018743	TCT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018743	AGA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018743	TAA	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018743	ATG	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018743	TCC	2	6	6787	6792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018743	GAT	2	6	6909	6914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018743	ATG	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018743	CAA	3	9	7058	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018743	GAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018743	TTG	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018743	CAA	2	6	7156	7161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018743	TAC	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018743	AGT	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018743	CAC	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018743	TAT	2	6	7334	7339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018743	TCA	2	6	7422	7427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018743	TCA	2	6	7508	7513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018743	AAT	2	6	7553	7558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018743	CAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018743	ATA	2	6	7783	7788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018743	AAG	2	6	7840	7845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018743	GCC	2	6	7980	7985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_018743	GCC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018743	CGA	2	6	8230	8235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018743	ACC	2	6	8265	8270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018743	ATT	2	6	8273	8278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018743	GCG	2	6	8363	8368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018743	ATC	2	6	8378	8383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018743	ATT	2	6	8423	8428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018743	GCT	2	6	8468	8473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018743	TTG	2	6	8492	8497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018743	ACC	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018743	AGG	2	6	8587	8592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018743	CAA	2	6	8632	8637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018743	TAG	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018743	TAT	2	6	8675	8680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018743	TTC	2	6	8699	8704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018743	ATT	2	6	8764	8769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018743	TTA	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018743	AAT	2	6	8842	8847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018743	GCT	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018743	TAG	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018743	ACA	2	6	9027	9032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018743	CGA	2	6	9073	9078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018743	ATC	2	6	9106	9111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018743	ATA	2	6	9300	9305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018743	AGA	2	6	9418	9423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018743	TTG	2	6	9428	9433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018743	ATT	2	6	9624	9629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018743	CAA	2	6	9728	9733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018743	AGA	2	6	9757	9762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018743	CAG	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018743	TAT	2	6	9875	9880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018743	ATT	2	6	9953	9958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018743	TGA	2	6	10036	10041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018743	ACA	2	6	11660	11665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018743	ATT	2	6	11781	11786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018743	AAT	2	6	11805	11810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018743	ATC	2	6	11840	11845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018743	TAC	2	6	11941	11946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018743	CGC	2	6	11947	11952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018743	TGG	2	6	11986	11991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018743	TAT	2	6	12045	12050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018743	CCA	2	6	12843	12848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018743	ACA	3	9	13059	13067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018743	ATA	2	6	13093	13098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018743	CCA	2	6	14935	14940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018743	AAC	2	6	14996	15001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018743	ATA	2	6	15328	15333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018743	AGC	2	6	15383	15388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018743	ATT	2	6	15678	15683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018743	TAA	2	6	15773	15778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018743	TAA	2	6	15841	15846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018743	TAA	2	6	15849	15854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018743	CAA	2	6	15855	15860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018743	GTT	2	6	17253	17258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018743	ATT	2	6	17304	17309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018743	CAG	2	6	18119	18124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018743	TAG	2	6	18681	18686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018743	TTG	2	6	18721	18726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018743	CTT	2	6	18767	18772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018743	TGA	2	6	22739	22744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018743	ATT	2	6	22749	22754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018743	ATC	2	6	24476	24481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018743	TTA	2	6	24494	24499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018743	TTG	2	6	24505	24510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018743	ATT	2	6	24565	24570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018743	TTA	2	6	24615	24620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018743	GTT	2	6	30492	30497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018743	GTT	2	6	30501	30506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018743	TAT	2	6	31250	31255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018743	TAT	2	6	31419	31424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018743	TAT	2	6	31558	31563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018743	CAC	2	6	31571	31576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018743	TTC	2	6	31593	31598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018743	CTC	2	6	42173	42178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018743	GGT	2	6	42185	42190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018743	CAA	2	6	49518	49523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018743	ATT	2	6	49625	49630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018743	TGG	2	6	49690	49695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018743	GAA	2	6	49707	49712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018743	ATT	2	6	49740	49745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018743	TAT	2	6	49914	49919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018743	AAT	2	6	50012	50017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018743	CTT	2	6	50122	50127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018743	CAA	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018743	AAT	2	6	50307	50312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018743	TGT	2	6	50386	50391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018743	TTG	2	6	50408	50413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018743	TTC	2	6	50443	50448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018743	TTA	2	6	50540	50545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018743	TAA	2	6	50588	50593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018743	AAT	2	6	50635	50640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018743	CCT	2	6	50649	50654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018743	CTT	2	6	50746	50751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018743	TAA	2	6	50765	50770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018743	AAT	2	6	50825	50830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018743	ACC	2	6	50942	50947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018743	ACT	2	6	50967	50972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018743	ACA	2	6	53074	53079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018743	TTA	2	6	53174	53179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018743	AAC	2	6	53307	53312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018743	TAA	2	6	53400	53405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018743	AAT	2	6	55107	55112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018743	AGA	2	6	55142	55147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018743	CAA	2	6	55166	55171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018743	GTT	2	6	55209	55214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018743	GAA	2	6	55254	55259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018743	TTC	2	6	55316	55321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018743	TGA	2	6	55345	55350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018743	ATC	2	6	55370	55375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018743	ATG	2	6	55427	55432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018743	TGA	2	6	55475	55480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018743	GTG	2	6	55541	55546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018743	AGC	2	6	55659	55664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018743	GAA	2	6	55679	55684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018743	TGA	2	6	55723	55728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018743	AGG	2	6	55874	55879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018743	CTT	2	6	55905	55910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018743	TGC	2	6	55979	55984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018743	AAT	2	6	56019	56024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018743	TAG	2	6	56084	56089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018743	TCA	2	6	56100	56105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018743	GAC	2	6	56107	56112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018743	TGC	2	6	58136	58141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018743	AAG	2	6	58145	58150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018743	AAG	2	6	58208	58213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018743	TCT	2	6	58227	58232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018743	TTC	2	6	58283	58288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018743	TAA	2	6	58326	58331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018743	AAC	2	6	58439	58444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_018743	AAG	2	6	58476	58481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018743	AGA	2	6	58525	58530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018743	TTC	2	6	58771	58776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_018743	TAA	2	6	58941	58946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.