MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL03

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018743	TC	3	6	724	729	0 %	50 %	0 %	50 %	408671741
2	NC_018743	TG	3	6	1547	1552	0 %	50 %	50 %	0 %	408671741
3	NC_018743	TG	3	6	3058	3063	0 %	50 %	50 %	0 %	408671741
4	NC_018743	TA	3	6	4184	4189	50 %	50 %	0 %	0 %	408671742
5	NC_018743	TG	3	6	5013	5018	0 %	50 %	50 %	0 %	408671742
6	NC_018743	TG	3	6	5514	5519	0 %	50 %	50 %	0 %	408671742
7	NC_018743	TA	3	6	6415	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	408671743
8	NC_018743	AT	3	6	6504	6509	50 %	50 %	0 %	0 %	408671743
9	NC_018743	CT	3	6	11038	11043	0 %	50 %	0 %	50 %	408671744
10	NC_018743	TA	3	6	11163	11168	50 %	50 %	0 %	0 %	408671744
11	NC_018743	TG	3	6	13186	13191	0 %	50 %	50 %	0 %	408671747
12	NC_018743	GA	3	6	13570	13575	50 %	0 %	50 %	0 %	408671747
13	NC_018743	AT	3	6	16340	16345	50 %	50 %	0 %	0 %	408671748
14	NC_018743	AT	3	6	17693	17698	50 %	50 %	0 %	0 %	408671750
15	NC_018743	TA	3	6	17769	17774	50 %	50 %	0 %	0 %	408671750
16	NC_018743	CT	3	6	18942	18947	0 %	50 %	0 %	50 %	408671752
17	NC_018743	AT	3	6	19888	19893	50 %	50 %	0 %	0 %	408671753
18	NC_018743	AC	3	6	21025	21030	50 %	0 %	0 %	50 %	408671753
19	NC_018743	AC	3	6	21061	21066	50 %	0 %	0 %	50 %	408671753
20	NC_018743	CA	3	6	21604	21609	50 %	0 %	0 %	50 %	408671753
21	NC_018743	AT	3	6	21873	21878	50 %	50 %	0 %	0 %	408671753
22	NC_018743	AG	3	6	23052	23057	50 %	0 %	50 %	0 %	408671755
23	NC_018743	TA	3	6	23365	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	408671755
24	NC_018743	AT	3	6	23438	23443	50 %	50 %	0 %	0 %	408671755
25	NC_018743	AT	3	6	24166	24171	50 %	50 %	0 %	0 %	408671756
26	NC_018743	AT	3	6	25267	25272	50 %	50 %	0 %	0 %	408671758
27	NC_018743	AC	3	6	25591	25596	50 %	0 %	0 %	50 %	408671758
28	NC_018743	GA	3	6	25693	25698	50 %	0 %	50 %	0 %	408671758
29	NC_018743	TC	3	6	25837	25842	0 %	50 %	0 %	50 %	408671758
30	NC_018743	TG	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
31	NC_018743	TA	3	6	28628	28633	50 %	50 %	0 %	0 %	408671758
32	NC_018743	TG	3	6	28642	28647	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
33	NC_018743	AC	3	6	28738	28743	50 %	0 %	0 %	50 %	408671758
34	NC_018743	TA	3	6	28826	28831	50 %	50 %	0 %	0 %	408671758
35	NC_018743	TG	3	6	28915	28920	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
36	NC_018743	AC	3	6	29334	29339	50 %	0 %	0 %	50 %	408671758
37	NC_018743	TG	3	6	30313	30318	0 %	50 %	50 %	0 %	408671758
38	NC_018743	AT	3	6	30534	30539	50 %	50 %	0 %	0 %	408671759
39	NC_018743	AT	3	6	31872	31877	50 %	50 %	0 %	0 %	408671760
40	NC_018743	CA	3	6	32245	32250	50 %	0 %	0 %	50 %	408671761
41	NC_018743	CA	3	6	32835	32840	50 %	0 %	0 %	50 %	408671761
42	NC_018743	GT	3	6	35087	35092	0 %	50 %	50 %	0 %	408671761
43	NC_018743	TA	3	6	37566	37571	50 %	50 %	0 %	0 %	408671761
44	NC_018743	CA	3	6	38934	38939	50 %	0 %	0 %	50 %	408671761
45	NC_018743	AC	3	6	42823	42828	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
46	NC_018743	CA	3	6	43244	43249	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
47	NC_018743	CA	3	6	43483	43488	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
48	NC_018743	CA	3	6	44258	44263	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
49	NC_018743	CA	3	6	45430	45435	50 %	0 %	0 %	50 %	408671763
50	NC_018743	CT	3	6	48210	48215	0 %	50 %	0 %	50 %	408671763
51	NC_018743	AG	3	6	54591	54596	50 %	0 %	50 %	0 %	408671766
52	NC_018743	TA	3	6	56617	56622	50 %	50 %	0 %	0 %	408671767
53	NC_018743	TA	3	6	56643	56648	50 %	50 %	0 %	0 %	408671767
54	NC_018743	AC	3	6	57760	57765	50 %	0 %	0 %	50 %	408671768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.