MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	TTCAAT	2	12	4824	4835	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671451
2	NC_018742	CAATCG	2	12	5817	5828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408671452
3	NC_018742	TAAAAA	2	12	8273	8284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	408671454
4	NC_018742	CAAAAA	2	12	9884	9895	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408671458
5	NC_018742	CAAAGG	2	12	10292	10303	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408671458
6	NC_018742	GCCTAT	2	12	18448	18459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408671466
7	NC_018742	TTAATA	2	12	18614	18625	50 %	50 %	0 %	0 %	408671466
8	NC_018742	TTAGAT	2	12	18874	18885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671466
9	NC_018742	CATCGG	2	12	23022	23033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408671470
10	NC_018742	ACGCTT	2	12	26156	26167	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408671471
11	NC_018742	GGGATT	2	12	28100	28111	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408671474
12	NC_018742	CTTCGG	2	12	31175	31186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671475
13	NC_018742	GGTTTA	2	12	32830	32841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408671477
14	NC_018742	CTTATC	2	12	34940	34951	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	408671479
15	NC_018742	TATGAT	2	12	38114	38125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671481
16	NC_018742	ATTAAG	2	12	40120	40131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671482
17	NC_018742	TCATTA	2	12	40481	40492	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671482
18	NC_018742	AGAATT	2	12	41614	41625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671483
19	NC_018742	TTGATA	2	12	46170	46181	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671487
20	NC_018742	GACAGT	2	12	48586	48597	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	408671488
21	NC_018742	TCAAAA	2	12	60048	60059	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671497
22	NC_018742	TTTGTA	2	12	63795	63806	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408671503
23	NC_018742	TTGCCC	2	12	65467	65478	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408671507
24	NC_018742	TTTGAA	2	12	67710	67721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671509
25	NC_018742	AAATGA	2	12	74023	74034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408671514
26	NC_018742	CTGCAA	2	12	74358	74369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408671515
27	NC_018742	TGAATA	2	12	75390	75401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671516
28	NC_018742	TGGGAG	2	12	77507	77518	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	408671517
29	NC_018742	TTAAAA	2	12	80214	80225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671519
30	NC_018742	CGAATC	2	12	80487	80498	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408671519
31	NC_018742	ACTAAA	2	12	82508	82519	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671521
32	NC_018742	TGCTTT	2	12	88632	88643	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	408671527
33	NC_018742	TTCATT	2	12	88671	88682	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	408671527
34	NC_018742	AAATGC	2	12	89784	89795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408671528
35	NC_018742	TTTTGA	2	12	94365	94376	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408671531
36	NC_018742	GGATTA	2	12	98245	98256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671534
37	NC_018742	ATAGGT	2	12	109547	109558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671543
38	NC_018742	TGCTAA	2	12	111901	111912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671546
39	NC_018742	TTATAC	2	12	114342	114353	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	408671548
40	NC_018742	ATTGAG	2	12	119369	119380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671552
41	NC_018742	CAATGT	2	12	120947	120958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408671553
42	NC_018742	TTTTCT	2	12	123012	123023	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	408671555
43	NC_018742	TTCCTT	2	12	124841	124852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671558
44	NC_018742	AAAAAC	2	12	130187	130198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408671562
45	NC_018742	TTAGAA	2	12	131366	131377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671563
46	NC_018742	TCATTG	2	12	131637	131648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408671563
47	NC_018742	TAGTTT	2	12	133042	133053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	408671564
48	NC_018742	TGAAGT	2	12	133989	134000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671566
49	NC_018742	TAGTAA	2	12	134573	134584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671566
50	NC_018742	ATATTG	2	12	135345	135356	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671567
51	NC_018742	TGTTGC	2	12	141443	141454	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408671571
52	NC_018742	TGGGAT	2	12	149683	149694	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408671576
53	NC_018742	GAACCA	2	12	150067	150078	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671576
54	NC_018742	GGTATT	2	12	154950	154961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408671578
55	NC_018742	GGCTTA	2	12	155040	155051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408671578
56	NC_018742	ATCTAA	2	12	159160	159171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671579
57	NC_018742	ATCAAA	2	12	159719	159730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	408671579
58	NC_018742	AGTAAT	2	12	159869	159880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671579
59	NC_018742	TGGCAG	2	12	160335	160346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	408671579
60	NC_018742	CAAAGT	2	12	165654	165665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408671582
61	NC_018742	TTAGAT	2	12	166365	166376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671582
62	NC_018742	GAAAAG	2	12	166669	166680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671582
63	NC_018742	AATTAG	2	12	168074	168085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408671582
64	NC_018742	TGATTC	2	12	169438	169449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408671584
65	NC_018742	TCACTC	2	12	170510	170521	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408671585
66	NC_018742	AAACAA	2	12	171256	171267	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	408671586
67	NC_018742	AGAAAA	2	12	174656	174667	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	408671591
68	NC_018742	TGATTA	2	12	176310	176321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408671597
69	NC_018742	ATTTTA	2	12	184413	184424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671605

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.