MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	CTGTT	2	10	667	676	0 %	60 %	20 %	20 %	408671449
2	NC_018742	TAAAT	2	10	830	839	60 %	40 %	0 %	0 %	408671449
3	NC_018742	GATTG	2	10	898	907	20 %	40 %	40 %	0 %	408671449
4	NC_018742	GTTTT	2	10	1278	1287	0 %	80 %	20 %	0 %	408671450
5	NC_018742	GCTTG	2	10	2086	2095	0 %	40 %	40 %	20 %	408671450
6	NC_018742	CTTTT	2	10	3210	3219	0 %	80 %	0 %	20 %	408671451
7	NC_018742	ATTGT	2	10	3647	3656	20 %	60 %	20 %	0 %	408671451
8	NC_018742	ATTAT	2	10	4436	4445	40 %	60 %	0 %	0 %	408671451
9	NC_018742	AAGTA	2	10	5999	6008	60 %	20 %	20 %	0 %	408671452
10	NC_018742	AACAA	2	10	6018	6027	80 %	0 %	0 %	20 %	408671452
11	NC_018742	CAATA	2	10	7656	7665	60 %	20 %	0 %	20 %	408671454
12	NC_018742	ACAAA	2	10	7853	7862	80 %	0 %	0 %	20 %	408671454
13	NC_018742	TTGGG	2	10	8215	8224	0 %	40 %	60 %	0 %	408671454
14	NC_018742	GCTTT	2	10	8807	8816	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018742	AAATT	2	10	9173	9182	60 %	40 %	0 %	0 %	408671456
16	NC_018742	AGCCA	2	10	9312	9321	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018742	TGGTG	2	10	10868	10877	0 %	40 %	60 %	0 %	408671459
18	NC_018742	TAGGG	2	10	11313	11322	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018742	TTCAT	2	10	12506	12515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018742	GAGAA	2	10	13061	13070	60 %	0 %	40 %	0 %	408671461
21	NC_018742	CTAAT	2	10	13573	13582	40 %	40 %	0 %	20 %	408671462
22	NC_018742	GAAAT	2	10	13862	13871	60 %	20 %	20 %	0 %	408671462
23	NC_018742	CAAAC	2	10	15547	15556	60 %	0 %	0 %	40 %	408671464
24	NC_018742	TTCTT	2	10	16377	16386	0 %	80 %	0 %	20 %	408671464
25	NC_018742	ATGGT	2	10	16786	16795	20 %	40 %	40 %	0 %	408671464
26	NC_018742	TTGTA	2	10	18958	18967	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018742	TCAAA	2	10	20198	20207	60 %	20 %	0 %	20 %	408671468
28	NC_018742	AACCA	2	10	21068	21077	60 %	0 %	0 %	40 %	408671469
29	NC_018742	AGTTT	2	10	21405	21414	20 %	60 %	20 %	0 %	408671469
30	NC_018742	AAAAT	2	10	21879	21888	80 %	20 %	0 %	0 %	408671469
31	NC_018742	GCGGT	2	10	23665	23674	0 %	20 %	60 %	20 %	408671470
32	NC_018742	CCAAA	2	10	23941	23950	60 %	0 %	0 %	40 %	408671470
33	NC_018742	CGAGC	2	10	23967	23976	20 %	0 %	40 %	40 %	408671470
34	NC_018742	CAAAA	2	10	26703	26712	80 %	0 %	0 %	20 %	408671472
35	NC_018742	AAAAT	2	10	26839	26848	80 %	20 %	0 %	0 %	408671472
36	NC_018742	TTCTT	2	10	28126	28135	0 %	80 %	0 %	20 %	408671474
37	NC_018742	CCCAA	2	10	28506	28515	40 %	0 %	0 %	60 %	408671474
38	NC_018742	ATTTT	2	10	29133	29142	20 %	80 %	0 %	0 %	408671474
39	NC_018742	TTTAC	2	10	29486	29495	20 %	60 %	0 %	20 %	408671475
40	NC_018742	ATGCC	2	10	31579	31588	20 %	20 %	20 %	40 %	408671476
41	NC_018742	GATTT	2	10	31779	31788	20 %	60 %	20 %	0 %	408671476
42	NC_018742	ACAAA	2	10	32642	32651	80 %	0 %	0 %	20 %	408671476
43	NC_018742	ATTGT	2	10	32885	32894	20 %	60 %	20 %	0 %	408671477
44	NC_018742	ATTCT	2	10	41152	41161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018742	GTGAA	2	10	42301	42310	40 %	20 %	40 %	0 %	408671484
46	NC_018742	AAAGA	2	10	42371	42380	80 %	0 %	20 %	0 %	408671484
47	NC_018742	ATTTT	2	10	42796	42805	20 %	80 %	0 %	0 %	408671485
48	NC_018742	GGAGT	2	10	44840	44849	20 %	20 %	60 %	0 %	408671487
49	NC_018742	CGGTA	2	10	45437	45446	20 %	20 %	40 %	20 %	408671487
50	NC_018742	TATTG	2	10	45611	45620	20 %	60 %	20 %	0 %	408671487
51	NC_018742	AATTG	2	10	45640	45649	40 %	40 %	20 %	0 %	408671487
52	NC_018742	ATTAC	2	10	46311	46320	40 %	40 %	0 %	20 %	408671487
53	NC_018742	GGCTG	2	10	46911	46920	0 %	20 %	60 %	20 %	408671487
54	NC_018742	TAGTC	2	10	47323	47332	20 %	40 %	20 %	20 %	408671487
55	NC_018742	ATATT	2	10	48331	48340	40 %	60 %	0 %	0 %	408671488
56	NC_018742	TTTAA	2	10	48624	48633	40 %	60 %	0 %	0 %	408671488
57	NC_018742	TTTAA	2	10	49785	49794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018742	ATTAT	2	10	52441	52450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018742	AAAGC	2	10	52511	52520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018742	TTTTC	2	10	52683	52692	0 %	80 %	0 %	20 %	408671491
61	NC_018742	TGTCA	2	10	53841	53850	20 %	40 %	20 %	20 %	408671492
62	NC_018742	TCTGC	2	10	55543	55552	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018742	GTTTT	2	10	55815	55824	0 %	80 %	20 %	0 %	408671494
64	NC_018742	ATAAA	2	10	58900	58909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018742	AAAGT	2	10	59273	59282	60 %	20 %	20 %	0 %	408671496
66	NC_018742	AAAAC	2	10	60353	60362	80 %	0 %	0 %	20 %	408671498
67	NC_018742	CAAAA	2	10	61728	61737	80 %	0 %	0 %	20 %	408671500
68	NC_018742	AAAAT	2	10	61743	61752	80 %	20 %	0 %	0 %	408671500
69	NC_018742	AATCA	2	10	62916	62925	60 %	20 %	0 %	20 %	408671503
70	NC_018742	GCAAA	2	10	63854	63863	60 %	0 %	20 %	20 %	408671503
71	NC_018742	TCAAA	2	10	64399	64408	60 %	20 %	0 %	20 %	408671505
72	NC_018742	GAATT	2	10	64748	64757	40 %	40 %	20 %	0 %	408671505
73	NC_018742	TGGCT	2	10	65271	65280	0 %	40 %	40 %	20 %	408671506
74	NC_018742	TGAAT	2	10	65408	65417	40 %	40 %	20 %	0 %	408671507
75	NC_018742	AATAA	2	10	66928	66937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018742	AGACA	2	10	67880	67889	60 %	0 %	20 %	20 %	408671509
77	NC_018742	ATTTT	2	10	70473	70482	20 %	80 %	0 %	0 %	408671511
78	NC_018742	TTCAA	2	10	71120	71129	40 %	40 %	0 %	20 %	408671511
79	NC_018742	GCTAC	2	10	72801	72810	20 %	20 %	20 %	40 %	408671513
80	NC_018742	TAAAT	2	10	74847	74856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018742	ATTAA	2	10	76230	76239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018742	ATCAA	2	10	76677	76686	60 %	20 %	0 %	20 %	408671517
83	NC_018742	GCTTT	2	10	77412	77421	0 %	60 %	20 %	20 %	408671517
84	NC_018742	AGCAA	2	10	79433	79442	60 %	0 %	20 %	20 %	408671518
85	NC_018742	TAATG	2	10	79470	79479	40 %	40 %	20 %	0 %	408671518
86	NC_018742	AATTT	2	10	79739	79748	40 %	60 %	0 %	0 %	408671518
87	NC_018742	GTAAA	2	10	79751	79760	60 %	20 %	20 %	0 %	408671518
88	NC_018742	AATCG	2	10	80031	80040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018742	TAATT	2	10	80627	80636	40 %	60 %	0 %	0 %	408671519
90	NC_018742	TAGGA	2	10	83473	83482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018742	TTACT	2	10	84136	84145	20 %	60 %	0 %	20 %	408671522
92	NC_018742	AGTGA	2	10	84546	84555	40 %	20 %	40 %	0 %	408671522
93	NC_018742	TTATT	2	10	85328	85337	20 %	80 %	0 %	0 %	408671523
94	NC_018742	GCTTT	2	10	85596	85605	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018742	GGATA	2	10	85969	85978	40 %	20 %	40 %	0 %	408671524
96	NC_018742	TTTCC	2	10	86523	86532	0 %	60 %	0 %	40 %	408671524
97	NC_018742	TTTCA	2	10	87308	87317	20 %	60 %	0 %	20 %	408671526
98	NC_018742	GCACT	2	10	87907	87916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018742	ATTGA	2	10	89439	89448	40 %	40 %	20 %	0 %	408671528
100	NC_018742	CAAAA	2	10	93037	93046	80 %	0 %	0 %	20 %	408671530
101	NC_018742	GCAAG	2	10	93519	93528	40 %	0 %	40 %	20 %	408671530
102	NC_018742	GATTT	2	10	93607	93616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018742	TTAAA	2	10	93653	93662	60 %	40 %	0 %	0 %	408671531
104	NC_018742	TTGAT	2	10	94070	94079	20 %	60 %	20 %	0 %	408671531
105	NC_018742	GAATA	2	10	94891	94900	60 %	20 %	20 %	0 %	408671532
106	NC_018742	TCTAT	2	10	95056	95065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018742	GGTAT	2	10	95965	95974	20 %	40 %	40 %	0 %	408671533
108	NC_018742	GAAAG	2	10	96673	96682	60 %	0 %	40 %	0 %	408671533
109	NC_018742	AAAGA	2	10	97774	97783	80 %	0 %	20 %	0 %	408671534
110	NC_018742	ATTTT	2	10	97826	97835	20 %	80 %	0 %	0 %	408671534
111	NC_018742	ACAGC	2	10	97885	97894	40 %	0 %	20 %	40 %	408671534
112	NC_018742	AATTA	2	10	98343	98352	60 %	40 %	0 %	0 %	408671534
113	NC_018742	AACAA	2	10	105005	105014	80 %	0 %	0 %	20 %	408671539
114	NC_018742	AAATC	2	10	105688	105697	60 %	20 %	0 %	20 %	408671540
115	NC_018742	ATCGT	2	10	105750	105759	20 %	40 %	20 %	20 %	408671540
116	NC_018742	TTTGT	2	10	106111	106120	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018742	AAAAT	2	10	106580	106589	80 %	20 %	0 %	0 %	408671541
118	NC_018742	TGATT	2	10	107319	107328	20 %	60 %	20 %	0 %	408671541
119	NC_018742	CAAAT	2	10	110077	110086	60 %	20 %	0 %	20 %	408671543
120	NC_018742	GATAA	2	10	110522	110531	60 %	20 %	20 %	0 %	408671543
121	NC_018742	TCAAA	2	10	110628	110637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018742	AACTA	2	10	110698	110707	60 %	20 %	0 %	20 %	408671544
123	NC_018742	GTTTT	2	10	111265	111274	0 %	80 %	20 %	0 %	408671544
124	NC_018742	AAAGT	2	10	112818	112827	60 %	20 %	20 %	0 %	408671546
125	NC_018742	TGATT	2	10	113125	113134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018742	TTGGA	2	10	113454	113463	20 %	40 %	40 %	0 %	408671547
127	NC_018742	AAATC	2	10	115041	115050	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018742	TGAAA	2	10	117351	117360	60 %	20 %	20 %	0 %	408671551
129	NC_018742	GAAAA	2	10	117396	117405	80 %	0 %	20 %	0 %	408671551
130	NC_018742	TTGAA	2	10	118025	118034	40 %	40 %	20 %	0 %	408671551
131	NC_018742	CCATT	2	10	118572	118581	20 %	40 %	0 %	40 %	408671551
132	NC_018742	ATCAC	2	10	119407	119416	40 %	20 %	0 %	40 %	408671552
133	NC_018742	TGTTT	2	10	119972	119981	0 %	80 %	20 %	0 %	408671553
134	NC_018742	CCTGA	2	10	120599	120608	20 %	20 %	20 %	40 %	408671553
135	NC_018742	TCTGT	2	10	120864	120873	0 %	60 %	20 %	20 %	408671553
136	NC_018742	CATTT	2	10	123674	123683	20 %	60 %	0 %	20 %	408671556
137	NC_018742	GTTTG	2	10	128074	128083	0 %	60 %	40 %	0 %	408671560
138	NC_018742	ATAAA	2	10	128895	128904	80 %	20 %	0 %	0 %	408671562
139	NC_018742	TCTTA	2	10	129458	129467	20 %	60 %	0 %	20 %	408671562
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.