MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL01

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018742	GCTTT	2	10	8807	8816	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018742	AGCCA	2	10	9312	9321	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018742	TAGGG	2	10	11313	11322	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018742	TTCAT	2	10	12506	12515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018742	TTGTA	2	10	18958	18967	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018742	ATTCT	2	10	41152	41161	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018742	TTTAA	2	10	49785	49794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018742	ATTAT	2	10	52441	52450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018742	AAAGC	2	10	52511	52520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018742	TCTGC	2	10	55543	55552	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018742	ATAAA	2	10	58900	58909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018742	AATAA	2	10	66928	66937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018742	TAAAT	2	10	74847	74856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018742	ATTAA	2	10	76230	76239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018742	AATCG	2	10	80031	80040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018742	TAGGA	2	10	83473	83482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018742	GCTTT	2	10	85596	85605	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018742	GCACT	2	10	87907	87916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018742	GATTT	2	10	93607	93616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018742	TCTAT	2	10	95056	95065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018742	TTTGT	2	10	106111	106120	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018742	TCAAA	2	10	110628	110637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018742	TGATT	2	10	113125	113134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018742	AAATC	2	10	115041	115050	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018742	ACAAA	2	10	146929	146938	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018742	TAAAT	2	10	147436	147445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018742	ATTTT	2	10	151835	151844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018742	ACATA	2	10	157298	157307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018742	TTTTC	2	10	158462	158471	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018742	TTATA	2	10	161353	161362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018742	AAACA	2	10	161416	161425	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018742	ATTAT	2	10	185409	185418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018742	TATAA	2	10	185423	185432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.